Genomic and proteomic characterizations of the central nervous system tumors

中枢神经系统肿瘤的基因组和蛋白质组特征

基本信息

批准号：
19791003
负责人：
OKAMOTO Hiroaki
金额：
$ 2.23万
依托单位：
Saga University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
财政年份：
2007
资助国家：
日本
起止时间：
2007 至 2008
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-19791003/
关键词：
ゲノミクスプロテオミクス脳腫瘍神経膠腫脳重瘍神経膠種

项目摘要

私は脳腫瘍を対象とした研究で、病理学的診断をもとにそれぞれのsubtype間の網羅的な蛋白発現検索を施行し、これらの解析を更に進めることで各脳腫瘍(特に神経膠腫)および各subtype間の特徴をプロテオミクスパターンとしてデータベース化できないかと考えてきた。この"脳腫瘍ファイル"が出来上がれば、例えば病理学的には診断困難な場合、プロテオミクス解析からの病理診断を判断すると言う逆からのアプローチも可能になると思われる。また特に神経膠芽腫などに関してはまだ細かなsubtypeへの分類が必要と以前より考えられているが、この病理学的診断手法、プロテオミクス解析手法を合わせることによりその細分化も可能になると考えられる。平成20年度は、これまでの情報の蓄積を行うことで、脳腫瘍のプロテオミクスデータベースの構築を継続した。実際の症例に対してこの構築したプロテオミクスデータベースを利用することで、病理学的診断を試みている。これらの結果を踏まえ、当研究で得たプロテオミクスパターンと病理学的診断との関連を解析している。次にゲノムマイクロアレーによるゲノミクスデータに基づいた1p,10q,19qなどのLOHの陽性群陰性群の比較検討、EGFRのamplification有無での検討、またMSPによるMGMTのメチル化の有無での検討、更には予後(生存期間、薬剤感受性)などの因子に関しても比較検討している。これらの結果により、ゲノム異常に関連すると考えられる蛋白の同定を行い、マーカーとして有用かどうか検討するのみでなく、治療標的としても対象となりうるかどうか検討した(検討症例21例)。

在一项关于脑肿瘤的研究中，我一直在想，通过基于病理诊断的每个亚型之间进行全面的蛋白质表达搜索，并进一步分析，我们可以进一步进一步进步这些分析，以及数据库的每个脑肿瘤（尤其是GlioMas）的特征（尤其是GlioMas）和每个亚型之间的特征作为蛋白质层模式。例如，如果产生了这种“脑肿瘤文件”，例如，如果难以从病理上诊断，则可能是可能的，例如从蛋白质组学分析中确定病理诊断。此外，长期以来，人们一直认为，胶质母细胞瘤和其他物质仍需要分类为详细的亚型，但是人们认为，通过将这些病理诊断方法和蛋白质组学分析方法结合在一起，可以将它们分为小部分。 2008年，通过累积我们到目前为止的信息，我们继续为脑肿瘤构建蛋白质组学数据库。尝试使用此构建的蛋白质组学数据库来尝试病理诊断。基于这些结果，我们分析了本研究中获得的蛋白质组学模式与病理诊断之间的关系。接下来，我们使用基因组微阵列基于基因组数据进行了比较并检查了诸如1p，10q和19q的阳性基团的负基团，检查了EGFR是否被放大，检查了MSSS的MGMT甲基化是否通过MSP进行了检查，以及是否比较并进行了比较和检查和检查的因素（例如生存期，药物敏感性）。基于这些结果，我们确定了被认为与基因组异常有关的蛋白质，不仅检查了它们是否作为标记物有用，而且还检查了它们是否可以作为治疗靶标的靶向（21例研究）。