Analysis of SNPs susceptible to Parkinson's disease

帕金森病易感 SNP 分析

基本信息

批准号：
19590990
负责人：
MIZUTA Ikuko
金额：
$ 2.91万
依托单位：
Osaka University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份：
2007
资助国家：
日本
起止时间：
2007 至 2008
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-19590990/
关键词：
パーキンソン病一塩基多型疾患感受性遺伝子関連解析

项目摘要

孤発性パーキンソン病(PD)の発症には、複数の遺伝子および環境因子が関与すると考えられている。これまで我々は121 個の候補遺伝子上の268 個のSNP_s(一塩基多型)を用いた大規模な関連解析により、α-synuclein (P=5.1x10^<-14>, オッズ比 OR = 2.23)を確実なパーキンソン病感受性遺伝子として同定し、報告した。また、白人でPD との関連が報告されていたFGF20 (P =0.0053, OR = 1.24)の日本人での再現性も確認した。本研究では、新たなPD 遺伝子同定のために、さらに候補遺伝子を増やして合計137 個の候補遺伝子上の302 個のSNP_sの関連解析を行った。遺伝子型タイピングは患者1403人、対照1938人を対象にTaqMan 法で行った。その結果、新たなPD 感受性遺伝子calbindin1 を同定した (P = 7.1x10^<-5>, OR = 1.34)。さらに、α-synuclein,calbindin1, FGF20の3個のPD遺伝子のうち、最も強くPD と関連するα-synuclein を中心にして、統計学的組み合わせ解析を行った。calbindin1 はα-synuclein のリスクを持たない群でPDと強く相関し(OR = 1.70)、逆にFGF20 はα-synuclein のリスクアレルを持つ群でPD とより強く関連した(OR = 1.76)。Calbindin1 はカルシウム結合蛋白であり、PD 患者の黒質でcalbindin1陰性神経の脱落が陽性神経の脱落よりも強いことから、神経保護作用を持つと考えられている。組み合わせ解析から、calbindin1 はα-synuclein とは独立に、一方、FGF20 はα-synuclein と相乗的に、PD 発症に関与していることが示唆される。

人们认为多种基因和环境因素与零星帕金森氏病（PD）的发展有关。到目前为止，我们通过大规模关联分析使用268个SNP_S（单核苷酸多态性的）在121个候选基因上鉴定并报道了α-突触核蛋白（P = 5.1x10^<-14>，优势比OR = 2.23）为可靠的帕金森氏病敏感性基因。我们还证实了FGF20（p = 0.0053，OR = 1.24）的可重复性，据报道，这与白种人在日语中与PD相关。在这项研究中，我们进一步增加了候选基因的数量，以分析总共137个候选基因的302个SNP_S的关联，以鉴定新的PD基因。在1403例患者和1938年对照组中，使用Taqman方法进行了基因分型。结果，我们确定了一个新的PD敏感性基因Calbindin1（p = 7.1x10^<-5>，OR = 1.34）。此外，统计组合分析主要在α-突触核蛋白，calbindin1和FGF20上进行，这是与PD最密切相关的与α-突触核蛋白有关的。 Calbindin1与没有α-突触核蛋白风险（OR = 1.70）的组中的PD密切相关，而FGF20与具有α-突触核蛋白的风险（OR = 1.76）的组中的PD更加密切相关。 Calbindin1是一种结合钙的蛋白质，被认为具有神经保护特性，因为PD患者的黑质中calbindin1阴性神经的丧失比正神经阳性神经强。组合分析表明，Calbindin1与α-核蛋白无关，而FGF20协同参与PD的发展。

项目成果

期刊论文数量（0）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

Calbindin 1, fibroblast growth factor 20, and α-synuclein in sporadic Parkinson's disease

DOI：
10.1007/s00439-008-0525-5
发表时间：
2008-08-01
期刊：
HUMAN GENETICS
影响因子：
5.3
作者：
Mizuta, Ikuko;Tsunoda, Tatsuhiko;Toda, Tatsushi
通讯作者：
Toda, Tatsushi

Mutations for Gaucer disease confer high susceptibility to Parkinson disease.

Gaucer 病的突变赋予帕金森病的高易感性。

DOI：
发表时间：
期刊：
Archives of Neurology (In press)
影响因子：
0
作者：
Jun Mitsui;Ikuko Mi zuta;Atsushi Toyoda;et al.
通讯作者：
et al.

Genome-wide association study of Parkinson's disease by 550K SNP Array.

通过 550K SNP 阵列进行帕金森病的全基因组关联研究。

DOI：
发表时间：
2008
期刊：
影响因子：
0
作者：
Satake W;Nakabayashi Y;Mizuta I;et al.
通讯作者：
et al.

Mutations for Gaucer disease confer highsusceptibility to Parkinson disease

戈塞病突变导致帕金森病高度易感

DOI：
发表时间：
2009
期刊：
Arch Neurol 66
影响因子：
0
作者：
Mitsui J;Mizuta I;Toyoda A;Ashida R;Takahashi Y;Goto J;Fukuda Y;Date H;Iwata A;Yamamoto M;Hattori N;Murata M;Toda T;Tsuji S.
通讯作者：
Tsuji S.

多数の候補遺伝子アプローチによるパーキンソン病感受性遺伝子calbindin1の同定日本人類遺伝学会

使用多候选基因方法鉴定帕金森病易感基因 calbindin1日本人类遗传学会