The new method to identify small molecules binding proteins by usingmutants and genome sequences

利用突变体和基因组序列识别小分子结合蛋白的新方法

基本信息

批准号：
19380066
负责人：
菅原二三男
金额：
$ 12.73万
依托单位：
Tokyo University of Science
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
财政年份：
2007
资助国家：
日本
起止时间：
2007 至 2009
项目状态：
已结题

项目摘要

The present study aimed at the identification of the action new and in vivo target protein of the establishment of the new medicine receptivity evaluation method that used gene mutation Drosophila melanogaster and CPT that used it.CPT-20-B connecting peptide (NSASRGGSQRGRGEH) is identified by using the T7 phage display method with crystal departure pendulum microbalance (QCM) device. This peptide sequencing showed each array and the homology of human HshnRNP A1 and Drosophila melanogaster DmHrb87F. CPT united from the bead pull-down examination that used HeLa cell meltable picture with HshnRNP A1. CPT made HshnRNP A1-GST united changing protein, did the QCM interaction analysis, and was HshnRNP A1 and was dissociation constant 82.7 nM.As a result of the microbial sensitivity test, by gene loss Drosophila melanogaster, two Hrb87FKG02089 and Hrb87FBG02743 that was the DmHrb87F gene mutant showed CPT high receptivity compared with the wild strain. Topo I has working that cancels a super-coil of plasmid DNA. This topology change was observed under CPT and the HshnRNP A1 existence. CPT obstructed the topo I revitalization as reported. Moreover, hnRNP A1 also similarly obstructed the topo I revitalization. In addition, CPT has improved the topo I active inhibition to HshnRNP A1 under both existence.HshnRNP A1 or DmHrb87F united from the above-mentioned result with CPT, and the possibility of adjusting the topo I revitalization was suggested.

本研究旨在鉴定新的和体内的靶蛋白在建立新的医学接受性评估方法中，该方法使用了使用基因突变的果蝇Melanogaster和CPT。使用T7 Phage Display Display display for Crystal Expranceance（n sasrggsqrgrgergeh）CPT-20-B连接肽（NSASRGGSQRGRGRGEH）。该肽测序显示了每个阵列和人类HSHNRNP A1和果蝇Melanogaster DMHRB87F的同源性。 CPT通过珠子下拉检查，使用HSHNRNP A1使用HeLa Cell融化图片。 CPT进行了HSHNRNP A1-GST统一变化的蛋白质，进行了QCM相互作用分析，并为Hshnrnp A1进行了分析，并且由于微生物敏感性测试的结果是分解恒定的82.7 nm.NM.NM.NM.NM drosophila Melanogaster，通过两个HRB87FKG02089和HRB87FB87FBGBG02734343434343434343434343434343434343。与野生应变相比，CPT高接受度。 Topo I的工作可以取消质粒DNA的超级圆柱。在CPT和HSHNRNP A1存在下观察到了这种拓扑变化。据报道，CPT阻塞了Topo I的振兴。此外，HNRNP A1也类似地阻碍了Topo I的振兴。此外，CPT在两者存在下都改善了对HSHNRNP A1的主动抑制。HSHNRNPA1或DMHRB87F联合通过上述结果与CPT相关的结果，并建议调整TOPO I REVITATION。

项目成果

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Structure-activity relationship of a glycolipid, sulfoquinovosyl diacylglycerol, with the DNA binding activity of p53.

糖脂、磺基喹诺酰二酰基甘油与 p53 的 DNA 结合活性的构效关系。

DOI：
发表时间：
2007
期刊：
Int J Mol Med. 19(1)
影响因子：
0
作者：
Iijima H;Kasai N;Chiku H;Takeuchi T;Kuramochi K;Hanashima S;Kobayashi S;Sugawara F;Sakaguchi K;Yoshida H;Mizushina Y.
通讯作者：
Mizushina Y.

エポラクタエン及び誘導体の化学と生物:全合成から作用機構解析

eporactaene及其衍生物的化学和生物学：从全合成到作用机制分析

DOI：
发表时间：
2010
期刊：
影响因子：
0
作者：
倉持幸司;他
通讯作者：
他

クラーク分子生物学

克拉克分子生物学

DOI：
发表时间：
2007
期刊：
影响因子：
0
作者：
Sakata T;Ferdous G;Tsuruta T;Satoh T;Baba S;Muto T.;et.al.;松野健治
通讯作者：
松野健治

Novel azaphilones, kasanosins A and B, which are specific inhibitors of eukaryotic DNA polymerases beta and lambda from Talaromyces sp.

DOI：
10.1016/j.bmc.2008.02.037
发表时间：
2008-04
期刊：
Bioorganic & medicinal chemistry
影响因子：
3.5
作者：
Takuma Kimura;Masayuki Nishida;Kouji Kuramochi;F. Sugawara;H. Yoshida;Y. Mizushina
通讯作者：
Takuma Kimura;Masayuki Nishida;Kouji Kuramochi;F. Sugawara;H. Yoshida;Y. Mizushina

Identification of cyclosporin A binding protein CSBP that plays a critical role in hepatitis C virus genome replication

鉴定在丙型肝炎病毒基因组复制中起关键作用的环孢菌素A结合蛋白CSBP