Analyses of interaction between the reconstituted chromatin fiber and the nuclear matrix

重建染色质纤维与核基质之间相互作用的分析

• 批准号: 18770131
• 负责人: HIZUME Kohji
• 金额: $ 2.5万
• 依托单位: Kyoto University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
• 财政年份: 2006
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2006 至 2008
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-18770131/
• 关键词: タンパク質; 核酸の構造; 動態; 機能; クロマチン; ヌクレオソーム; AFM; 核マトリクス

遺伝情報を担うDNA分子を含むクロマチンファイバーが、細胞核内部の骨格構造とどのように相互作用しているのかを明らかにするため、その構造を試験管内で人工的に再構築し、原子間力顕微鏡による観察を行った。その結果、核内骨格の構成因子であるtopo IIタンパク質を加えることで、クロマチンファイバーがたぐり寄せられるように集合し、ループ状構造を形成することを明らかにした。また、クロマチンのアセチル化修飾を引き金に、クロマチンファイバーが弛緩して細くなり、更に、核内骨格から遊離し易い(自由度の高い)状態へと変化することを示唆する実験結果を得た。

为了阐明含有遗传信息的DNA分子的染色质纤维如何与细胞核内的骨骼结构有着相互作用，人工地重建了试管中的结构并人为地重建原子力显微镜。观察到。结果，据揭示了添加核骨架中的topo II蛋白，该蛋白是核骨骼中的一个构型蛋白，以形成环状结构，从而破碎染色质纤维。此外，已经获得了实验结果，即染色质触发的乙酰化使染色质纤维放松并变得更薄，并从核骨架变为易于分离的状态（高度自由度）。

项目成果

Topoisomerase II, scaffold component, promotes chromatin compaction in vitro in a linker-histone H1-dependent manner

• DOI: 10.1093/nar/gkm116
• 发表时间: 2007-04-01
• 期刊: NUCLEIC ACIDS RESEARCH
• 影响因子: 14.9
• 作者: Hizume, Kohji;Araki, Sumiko;Takeyasu, Kunio
• 通讯作者: Takeyasu, Kunio

Removal of histone tails from nucleosome dissects the physical mechanisms of salt-induced aggregation, linker histone H1-induced compaction, and 30-nm fiber formation of the nucleosome array

• DOI: 10.1016/j.ultramic.2009.03.014
• 发表时间: 2009-07-01
• 期刊: ULTRAMICROSCOPY
• 影响因子: 2.2
• 作者: Hizume, Kohji;Nakai, Tonau;Takeyasu, Kunio
• 通讯作者: Takeyasu, Kunio

Transcriptional coactivator PC4, a chromatin-associated protein, induces chromatin condensation

• DOI: 10.1128/mcb.00887-06
• 发表时间: 2006-11-01
• 期刊: MOLECULAR AND CELLULAR BIOLOGY
• 影响因子: 5.3
• 作者: Das, Chandrima;Hizume, Kohji;Kundu, Tapas K.
• 通讯作者: Kundu, Tapas K.

Chromosome Nano-science and Technology, (Hizume K, Kobori T, Yoshimura S.H, Takeyasu K.(分担)"Mechanisms of higher-order chromatin folding revealed by AFM observation of in vitro reconstituted chromatin.")

染色体纳米科学与技术，（Hizume K、Kobori T、Yoshimura S.H、Takeyasu K.（撰稿人）“体外重构染色质的 AFM 观察揭示的高阶染色质折叠机制。”）

• 发表时间: 2007
• 作者: Fukui K;Ushiki T;(編)
• 通讯作者: (編)

Nuclear architecture and chromatin dynamics revealed by atomic force microscopy in combination with biochemistry and cell biology

• DOI: 10.1007/s00424-007-0431-z
• 发表时间: 2008-04-01
• 期刊: PFLUGERS ARCHIV-EUROPEAN JOURNAL OF PHYSIOLOGY
• 影响因子: 4.5
• 作者: Hirano, Yasuhiro;Takahashi, Hirohide;Takeyasu, Kunio
• 通讯作者: Takeyasu, Kunio