Comprehensive analysis of allelic imbalance by using high-densitysingle nucleotide polymorphism array in hepatocellular carcinoma

高密度单核苷酸多态性芯片综合分析肝细胞癌等位基因失衡

• 批准号: 18590717
• 负责人: KANAI Fumihiko
• 金额: $ 2.62万
• 依托单位: Chiba University (2008)The University of Tokyo (2006-2007)
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2006
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2006 至 2008
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-18590717/
• 关键词: マイクロアレイ; ゲノム; 肝細胞癌; ダノム; SNP

我々は、肝細胞癌の細胞株から抽出したゲノムDNAや、肝細胞癌および非癌部肝組織をレーザーマイクロダイセクションにより切り出し、抽出したゲノムDNAについて、100kまたは500k chipを用いて共通の遺伝子増幅および欠失領域やLOHの有無を解析してきた。肝細胞癌において染色体8q22.3領域が高頻度に遺伝子増幅をおこし、その染色体領域にコードされるGRHL2遺伝子増幅が、肝細胞癌の早期再発に相関していることを見出した。RNAiにより肝癌培養細胞の内在性GRHL2をknock downすると細胞増殖が抑制されることからも、GRHL2の増幅は、肝細胞癌再発の予測因子となる可能性が示唆された。

我们使用激光显微解剖切除了从肝细胞癌细胞系和肝细胞癌癌和非癌性肝组织中提取的基因组DNA，并使用100K或500K芯片分析了提取的基因组DNA的常见基因扩增和LOH的共同基因扩增和LOH的存在。已经发现，8q22.3染色体区域在肝细胞癌中经常进行基因扩增，并且在染色体区域中编码的GRHL2基因扩增与肝细胞癌的早期复发相关。自从用RNAi培养的肝癌细胞中内源性GRHL2敲低以来，抑制细胞的增殖，已经提出GRHL2的扩增可能是肝细胞癌复发的预测指标。

项目成果

高密度オリゴヌクレオチドアレイによる肝細胞癌の生物学的特性・再発に関連するゲノム異常解析

利用高密度寡核苷酸芯片分析与肝细胞癌生物学特征和复发相关的基因组异常

• 发表时间: 2008
• 作者: 田中康雄;ら
• 通讯作者: ら

Gain of GRHL2 is associated with early recurrence of hepatocellular carcinoma

• DOI: 10.1016/j.jhep.2008.06.019
• 发表时间: 2008-11-01
• 期刊: JOURNAL OF HEPATOLOGY
• 影响因子: 25.7
• 作者: Tanaka, Yasuo;Kanai, Fumihiko;Omata, Masao
• 通讯作者: Omata, Masao

Copy Number Analysis of Hepatocellular Carcinoma Using Ten Genes Derived from GeneChip Data Set of Hepatoma Cell Lines

使用源自肝癌细胞系基因芯片数据集的十个基因对肝细胞癌进行拷贝数分析

• 发表时间: 2007
• 作者: Tanaka Y;Kanai F;Tada M;Tateishi R;Shiina S;Kobashi H;Kawabe T;Yokosuka O;Ogawa S;Omata M
• 通讯作者: Omata M