偶蹄目の家畜および野生動物における環境適応性に関する遺伝子のcSNPs探索

cSNP 寻找与家养和野生偶蹄动物环境适应性相关的基因

基本信息

批准号：
16710147
负责人：
田中和明
金额：
$ 1.86万
依托单位：
Azabu University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
财政年份：
2004
资助国家：
日本
起止时间：
2004 至 2005
项目状态：
已结题

项目摘要

1)家畜豚品種およびイノシシ数亜種において、β3アドレナリン受容体遺伝子コード領域の完全長配列を決定し、そこに存在する1塩基多型(SNPs)を探索した。その結果、終止コドンの5塩基上流にT(チミン)の1塩基挿入変異を発見した。この変異によりフレームシェフトが生じアミノ酸配列は変異型においてC末側2アミノ酸残基を欠く受容体を生産すると考えられる。この変異型遺伝子の商業用豚品種における分布を調査した結果、ランドレース種および一部の系統豚では、変異型を持つ個体が非常に少ないのに対し、系統造成の過程にあるデュロック種の集団には、高頻度で存在することが明らかになった。また、梅山豚において、新たな変異を発見した。β3アドレナリン受容体は脂肪細胞において、エネルギー収支の調節に重要な役割を担っており、このSNPsによって豚の産業的形質に差異が生じるかどうかさらなる研究の必要がある。2)ウシ属の家畜および野生動物に、加えて河川水牛およぶ沼沢水牛において、βグロビン遺伝子の完全長塩基配列を決定した。その結果、血液中のヘモグロビンの電気泳動的多型に対応するSNPsの存在を明らかにし、タンパク質の電気泳動マーカーをDNAマーカーに置き換えることに成功した。さらに、河川水牛と沼沢水牛間における多型を発見したことから、両者の交雑群における適正な選抜マーカーを提供することが可能となった。3)家畜牛およびガウールの家畜型であるミタンにおいて、セロトニンレセプター1b遺伝子のコード領域の配列を決定し多型を探索した、その結果、北方系牛であるヘレフォード種とトカラ牛の間には多型は存在しなかった。しかし、ミタンにおいては家畜牛との間にアミノ酸置換を伴う変異が存在することを明らかにした。またインド系牛ではこの遺伝子の配列決定にはいたらなかったが、北方系牛との間には遺伝子の上流域において変異があることが示唆された。

1）我们测定了家猪品种和野猪几个亚种的β3肾上腺素受体基因编码区的全长序列，并寻找其中存在的单核苷酸多态性（SNP）。结果，我们在终止密码子上游五个碱基处发现了一个 T（胸腺嘧啶）碱基插入突变。据认为，这种突变导致框架偏移并产生缺乏突变氨基酸序列中两个C端氨基酸残基的受体。通过调查该突变基因在商品猪品种中的分布情况，我们发现，在长白猪品种和部分血统猪中，携带该变异基因的个体很少，而在正在谱系过程中的杜洛克品种中，携带该变异基因的个体很少。据透露，它们经常发生。此外，在眉山猪中还发现了一种新的突变。 β3-肾上腺素能受体在调节脂肪细胞能量平衡中发挥重要作用，需要进一步研究以确定这些SNP是否会导致猪的工业性状差异。 2)测定了牛属家畜和野生动物以及河水牛和沼泽水牛的β-珠蛋白基因全长核苷酸序列。结果，他们揭示了与血液中血红蛋白电泳多态性相对应的SNP的存在，并成功用DNA标记取代了蛋白质电泳标记。此外，河流水牛和沼泽水牛之间多态性的发现使得为两者之间的杂交群体提供适当的选择标记成为可能。 3)对家牛Mitan和Gaur的5-羟色胺受体1b基因编码区进行测序并寻找多态性，未发现多态性。然而，据透露，Mitan 存在一种突变，涉及其与家牛之间的氨基酸替换。尽管该基因尚未在印度牛中进行测序，但有人认为它与北方牛之间的基因上游区域存在变异。

项目成果

期刊论文数量（4）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

Development and Characterization of CATS Markers for Genetic Linkage Mapping in the House Musk Shrew, Sunncus murinus.

用于家麝鼩 (Sunncus murinus) 遗传连锁图谱的 CATS 标记的开发和表征。

DOI：
发表时间：
2005
期刊：
Experimental Animal 54(2)
影响因子：
0
作者：
Adjei S;Sato A;Tanaka S;Kobayashi E;Tanaka K;Namikawa T;Ishikawa A
通讯作者：
Ishikawa A

A Tandem Gene Duplication Followed by Recruitment of a Retrotransposon Created the Paralogous Bucentaur Gene (bcntp97) in the Ancestral Ruminant.

串联基因复制和逆转录转座子的招募在祖先反刍动物中产生了旁系同源的 Bucentaur 基因 (bcntp97)。

DOI：
发表时间：
2006
期刊：
Molecular Biology and Evolution (印刷中)
影响因子：
0
作者：
Iwashita S;Ueno S;Nakashima K;Song SY;Ohshima K;Tanaka K;Endo H;Kimura J;Kurohmaru M;Fukuta K;David L;Osada N.
通讯作者：
Osada N.