プラスミドpCAR1の複製・接合伝達機構の解明

阐明质粒pCAR1的复制和接合转移机制

• 批准号: 05J11509
• 负责人: 新谷 政己
• 金额: $ 1.15万
• 依托单位: The University of Tokyo
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for JSPS Fellows
• 财政年份: 2005
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2005 至 2006
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-05J11509/
• 关键词: 分解プラスミド; 接合伝達; カルバゾール; 水平伝播

申請者は,カルバゾール(CAR)分解プラスミドpCAR1が宿主内で安定に保持されるためにparWAB産物が必要であることを明らかにした.またプラスミドの分配に際して必要なparB産物の結合サイト(parSと命名)の探索・同定を共同研究により行い,parA-parBの間の領域に存在することを確かめた.pCAR1の分配に関与する遺伝子領域は,pCAR1の属する不和合性群IncP-7プラスミド間で高度に保存されており,本研究の結果はIncP-7群に普遍的なものと考えられる.また,CARによるモデル汚染環境を作製し,プラスミド保持菌株接種後の挙動解析を行った.接種した菌株自身とプラスミドが接合伝達した菌株(transconjugant)とを区別する赤色蛍光タンパク質を利用するシステムを導入し,土壌(黒ボク土)および河川水(荒川中流域より採取)より作製した実環境モデル内におけるpCAR1の水平伝播現象をモニタリングした.このとき各サンプルの全菌体数,生育菌体数の変化,およびCARの消長についても経時的に解析した.その結果,河川水サンプルにおいてpCAR1の接合伝達現象を検出することに成功し,特にCAR(DMSO溶液)を添加したサンプルで,transconjugantの出現率が劇的に増加した.このとき,CARはtransconjugantの出現数と同調的に分解が進んでおり,CARの添加による(1)接種した菌株自身の増加,(2)受容菌となりうる菌株の増加,(3)transconjugantの増加,の3つの影響が考えられた.また得られたtransconjugantの90%以上がPseudomonas属細菌であったが,河川水等に存在するStenotrophomonas属細菌も見出された.これはIncP-7群プラスミドがPseudomonas属以外の菌株に接合伝達したことを示した初めての例である.

申请人表明，calvazole（CAR）分解质粒PCAR1也需要在宿主中稳定，这是分布质粒的PARB乘积结合位置（通过联合研究中的搜索和识别）。 para-parb之间的面积是在此中储存的，这项研究的结果被认为是Incp-7组的通用，并准备了一个模型的环境. Introducing a system that uses red fluorescent proteins that distinguishes the bacteria strain (Transconjugant) transmitted by plasmid and plasmid, and in the real environment model created from soil (black soil) and river water (collected from the Arakawa basin). The horizo​​ntal propagation目前监测了PCAR1的现象，每个样本的可可症数量，繁殖细菌的数量变化以及汽车首长的结果。跨性别的速率与类似物的样品急剧增加（DMSO溶液），目前将CAR分解为与跨性别的数量同步（1）由于添加了CAR（2） （3）跨性别的跨性别型，但也发现了第一个示例，这是第一个例子。这表明将Incp-7组质粒传达给假单胞菌以外的细菌。

项目成果

Characterization of replication, partition, and transfer functions of an IncP-7 plasmid pCAR1 carrying carbazole/dioxin degradative genes.

携带咔唑/二恶英降解基因的 IncP-7 质粒 pCAR1 的复制、分区和转移功能的表征。

• 期刊: Applied and Environment Microbiology 掲載予定
• 作者: Shintani;M.;Yano;H.;Habe;H.;Omori;T.;Yamane;H.;Tsuda M.;Nojiri;H.
• 通讯作者: H.

The Sphingomonas Plasmid pCAR3 Is Involved in Complete Mineralization of Carbazole

• DOI: 10.1128/jb.01486-06
• 发表时间: 2006-12
• 期刊: Journal of Bacteriology
• 影响因子: 3.2
• 作者: M. Shintani;Masaaki Urata;Kengo Inoue;Kaori Eto;H. Habe;T. Omori;H. Yamane;H. Nojiri

Characterization of replication, partition, and transfer functions of an IncP-7 plasmid pCAR1 carrying carbazole and dioxin degradative genes."

携带咔唑和二恶英降解基因的 IncP-7 质粒 pCAR1 的复制、分区和转移功能的表征。"

• 发表时间: 2006
• 期刊: Applied and Environment Microbiology 67
• 作者: Shintani;M.;Yano;H.;Habe;H.;Omori;T.;Yamane;H.;Tsuda M.;Nojiri;H.
• 通讯作者: H.