Monitoring of plasmid behaviors in phytosphere in different climate zones

不同气候带植物圈中质粒行为的监测

• 批准号: 20KK0128
• 负责人: 新谷 政己
• 金额: $ 11.9万
• 依托单位: Shizuoka University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Fund for the Promotion of Joint International Research (Fostering Joint International Research (B))
• 财政年份: 2020
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2020-10-27 至 2024-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-20KK0128/
• 关键词: プラスミド; 接合伝達; 宿主域; 植物体圏; 気候帯; プラスミド; 接合伝達; 宿主域; 植物体圏; 気候帯

植物の葉圏・根圏（植物体圏）が，プラスミドや薬剤耐性遺伝子の温床となっていることが示されている．昨年度，施肥条件が異なり，複数種類の作物を輪作している筑波大学の管理圃場の植物体圏からプラスミドキャプチャリングを実施し，IncP群とPromA群プラスミドを取得した．これらのプラスミドの存在量の変化を，PCR-サザンブロット法によって追跡し，IncP群は検出できたのに対し，PromA群プラスミドは検出限界以下であった．また各プラスミドの完全長塩基配列に基づく詳細な解析の結果，水銀耐性遺伝子群を含む複数のIncP群プラスミドや，新規IncP群（既存のIncP群プラスミドと不和合性を示すものの，各遺伝子の塩基配列の相同性が低く，新たな亜群に属する）プラスミド，発見数の限られたPromA群プラスミドが含まれることが判明した．本年度はこれに加えて，一部の対面交流ができるようになったため，ドイツ側との打ち合わせを経て，プラスミドの動態における共同研究の一環として，相手国側の研究者と，学会での共同発表を行った．また，気候帯の異なる土壌試料からのキャプチャリングとして，エジプトの根圏由来のプラスミドについて，塩基配列の解読の準備を進めた．さらに，植物体圏でのプラスミドの動態を追跡する実験については，プラスミド伝播を追跡するための材料として，GFPを発現する遺伝子を挿入したIncP群（種々の薬剤耐性遺伝子を伝播し，重要な亜群であると判明したイプシロン亜群）を作製し，ドイツ側での実験ができるようにした．

已经表明，植物的叶子和根际（植物球）是质粒和耐药基因的温床。去年，从托苏库大学的托管领域的植物领域进行了质粒捕获，那里的施肥条件不同，旋转了多种农作物，并获得了INCP组和Proma组的质粒。通过PCR-南印迹跟踪这些质粒的丰度变化，并且可以检测到INCP组，而Proma组质粒则低于检测极限。此外，基于每个质粒的全长核苷酸序列的详细分析表明，它包括包含汞抗性基因组的多个INCP组质粒，新的INCP组（尽管与现有的INCP组质粒不兼容，但每个基因的基础序列均低，并且属于一个新的亚基组和Praya组的质粒数量有限的数量。除此之外，今年有一些面对面的互动已经成为可能，因此在与德国人会面后，我们在会议上与来自其他国家的研究人员进行了联合演讲，这是我们对质粒动态的联合研究的一部分。此外，作为来自具有不同气候区域的土壤样品的捕获，进行了制剂，以破解源自埃及根际的质粒的碱基序列。此外，为了跟踪植物体内质粒动力学的实验，我们创建了一个INCP组（Epsilon亚组被认为是一个重要的亚组，它是传播各种耐药性基因的重要亚组，并被认为是一个重要的亚组），以跟踪质粒传播，以跟踪质体传播，以跟踪质粒传播，从而使实验可以表现出侧面表演的一部分。