Monitoring of plasmid behaviors in phytosphere in different climate zones

不同气候带植物圈中质粒行为的监测

基本信息

批准号：
20KK0128
负责人：
新谷政己
金额：
$ 11.9万
依托单位：
Shizuoka University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Fund for the Promotion of Joint International Research (Fostering Joint International Research (B))
财政年份：
2020
资助国家：
日本
起止时间：
2020-10-27 至 2024-03-31
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-20KK0128/
关键词：
プラスミド接合伝達宿主域植物体圏気候帯

项目摘要

植物の葉圏・根圏（植物体圏）が，プラスミドや薬剤耐性遺伝子の温床となっていることが示されている．昨年度，施肥条件が異なり，複数種類の作物を輪作している筑波大学の管理圃場の植物体圏からプラスミドキャプチャリングを実施し，IncP群とPromA群プラスミドを取得した．これらのプラスミドの存在量の変化を，PCR-サザンブロット法によって追跡し，IncP群は検出できたのに対し，PromA群プラスミドは検出限界以下であった．また各プラスミドの完全長塩基配列に基づく詳細な解析の結果，水銀耐性遺伝子群を含む複数のIncP群プラスミドや，新規IncP群（既存のIncP群プラスミドと不和合性を示すものの，各遺伝子の塩基配列の相同性が低く，新たな亜群に属する）プラスミド，発見数の限られたPromA群プラスミドが含まれることが判明した．本年度はこれに加えて，一部の対面交流ができるようになったため，ドイツ側との打ち合わせを経て，プラスミドの動態における共同研究の一環として，相手国側の研究者と，学会での共同発表を行った．また，気候帯の異なる土壌試料からのキャプチャリングとして，エジプトの根圏由来のプラスミドについて，塩基配列の解読の準備を進めた．さらに，植物体圏でのプラスミドの動態を追跡する実験については，プラスミド伝播を追跡するための材料として，GFPを発現する遺伝子を挿入したIncP群（種々の薬剤耐性遺伝子を伝播し，重要な亜群であると判明したイプシロン亜群）を作製し，ドイツ側での実験ができるようにした．

研究表明，植物的叶际和根际（植物圈）是质粒和抗药性基因的温床。去年，我们从筑波大学管理田地的植物圈中捕获质粒，这些田地的施肥条件不同，并且轮作多种作物，我们获得了IncP组和PromA组质粒。通过PCR-Southern印迹追踪这些质粒丰度的变化，虽然可以检测到IncP组，但PromA组质粒低于检测限。另外，根据各质粒的全长核苷酸序列进行详细分析，发现了几个含有汞抗性基因的IncP组质粒和新的IncP组质粒（尽管它们与现有的IncP组质粒不相容，但每个基因的核苷酸结果发现，其中包括序列同源性低且属于新亚组的质粒和已发现数量有限的PromA组质粒。除此之外，今年，由于现在可以进行一些面对面的互动，在与德方会面后，我们将与伙伴国的研究人员在学术会议上进行联合报告，作为联合研究的一部分我做了关于质粒动力学的研究。此外，还准备对来自埃及根际的质粒进行测序，以捕获来自不同气候区的土壤样本。此外，在追踪植物圈中质粒动态的实验中，我们使用了一组 IncP（传播各种耐药基因和重要亚型），其中插入了 GFP 表达基因作为追踪质粒传播的材料。事实证明，这个小组的成立是为了让德国方面能够进行实验。

项目成果

期刊论文数量（99）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

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发表时间：
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0
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静岡大学　金原・新谷研究室のホームページ

静冈大学金原新谷实验室主页

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0
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water-in-oil (w/o) dropletでPromA群プラスミドの「天然の宿主」を同定する

鉴定具有油包水（w/o）液滴的 PromA 组质粒的“天然宿主”

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发表时间：
2023
期刊：
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0
作者：
德田　真穂;鈴木　治夫;金原　和秀;新谷　政己;新谷政己，森内良太，道羅英夫，鈴木治夫，野尻秀昭，鈴木仁人;川北鈴香，陶山哲志，髙木妙子，大田悠里，野田尚宏，金原和秀，新谷政己
通讯作者：
川北鈴香，陶山哲志，髙木妙子，大田悠里，野田尚宏，金原和秀，新谷政己

ユリウス・クーン研究所(ドイツ)

朱利叶斯·库恩研究所（德国）

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0
作者：
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これまで見過ごされてきたPromA群プラスミドの性状解析

迄今为止被忽视的 PromA 组质粒的表征

DOI：
发表时间：
2023
期刊：
影响因子：
0
作者：
德田　真穂;鈴木　治夫;金原　和秀;新谷　政己;新谷政己，森内良太，道羅英夫，鈴木治夫，野尻秀昭，鈴木仁人;川北鈴香，陶山哲志，髙木妙子，大田悠里，野田尚宏，金原和秀，新谷政己;白木友博，上條達哉，新谷政己，金原和秀
通讯作者：
白木友博，上條達哉，新谷政己，金原和秀

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