紫外線損傷DNAの修復を目的とした機能性分子の開発

开发旨在修复紫外线损伤 DNA 的功能分子

• 批准号: 05J09932
• 负责人: 橋本 安希 (稲瀬 安希)
• 金额: $ 1.73万
• 依托单位: Osaka University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for JSPS Fellows
• 财政年份: 2005
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2005 至 2007
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-05J09932/
• 关键词: 紫外線損傷; (6-4)光産物; distamycin A; CDスペクトル; DNA; cyclic polyamide

本研究は紫外線損傷である(6-4)光産物を塩基除去修復に載せるための始めの反応を引き起こす薬物を開発し、紫外線損傷に対する人工的な修復系を創成することを最終目標とする。前年度はゲル電気泳動による構造解析を行い、distamycin Aの結合により(6-4)光産物を有するDNAは大きく構造変化を起こさないことを報告した。この結果を受け、distamycinの認識はヒトDDBタンパクとは異なった認識であると予想し、様々なタイプの損傷DNAを用いてdistamycinとの結合の解析をSPRにより行い比較検討した。本年度では、SPRで特異的に結合が見られた損傷DNAを用いて、 CDスペクトルによりさらに詳細に結合の解析を行った。CDスペクトルではSPRと同様に結合を示すシグナルがはっきりと観測され、そのデータを基に結合解離定数とストイキオメトリーを求めたところ、結合の強さの順はSPRの結果から推測されるものと一致し、そのストイキオメトリーはいずれも1:1を示した。SPRの結果とCDスペクトルの結果から、損傷DNAのminor groove側に水素結合のacceptorとなる原子があり、かつ、立体障害がない場合のみdistamycinは結合することがわかり、その認識は通常のターゲットサイトであるAATTに対する認識と同様に、損傷DNAのminor grooveの塩基対の化学構造を認識していることが明らかとなった。また(6-4)光産物に対しては3'ピリミドン環の02原子が水素結合のacceptorとなり、その効果でdistamycinが結合していると結論付けた。

这项研究是开发一种药物，该药物引起对基础去除修复中的光学产品的第一反应，并创建人工修复系统，以实现紫外线损伤。在上一个财政年度，结构分析是通过凝胶电泳进行的，据报道，由于大霉素A的组合，具有光学产物（6-4）的DNA不会在结构上发生变化。结果，巨霉素的识别预计与人DDB蛋白不同，并使用SPR使用各种类型的损伤DNA分析了与纵横霉素的结合。在这个财政年度，使用在SPR中特异性发现的DNA进一步分析了组合。在CD频谱中，表明键的信号清楚地观察到SPR中的SPR，并基于数据，结合解剖的数量和stoikiemementry，从SPR的结果估算了结合强度的阶。他们同意，所有的Stoikiemetry均显示1：1。从SPR的结果和CD谱结果的结果来看，事实证明，只有在受损DNA的小凹槽侧成为原子的原子，将仅当原子成为氢键的绝经剂时才合并在一起，并且识别是正常的靶标站点类似于AATT的感知，它揭示了它识别出受损DNA的小凹槽的基本化学结构。对于（6-4），3'Pirimidon环02原子是一个氢键的帐户，并得出结论是二霉素是结合的。