ナメクジウオの鰓裂関連遺伝子群を用いた鰓裂の進化学的研究

利用文昌鱼鳃缝相关基因进行鳃缝进化研究

基本信息

批准号：
16770179
负责人：
小笠原道生
金额：
$ 2.05万
依托单位：
Chiba University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
财政年份：
2004
资助国家：
日本
起止时间：
2004 至 2005
项目状态：
已结题

项目摘要

頭索類ナメクジウオは、下等脊索動物のなかでも脊索動物の基本的体制を終生保持し続ける動物群であり、ゲノム構造がシンプルであることから脊索動物に共通するボディープランを研究する上で有用な動物群だと考えられている。前年度においては、ナメクジウオ成体の咽頭領域のcDNAライブラリーをベースに、多検体切片ISH法を用いて多数の鰓裂関連遺伝子を見いだした。本年度は、これらの遺伝子のシークエンス解析を行った結果、cytochrome oxidase subunit I(cosI)およびdermatopontinがナメクジウオの鰓葉で顕著に発現していることを見いだした。このナメクジウオの鰓におけるcosIの顕著な発現が下等脊索動物ホヤでも共通して見られるかどうかを解析したところ、カタユウレイボヤ幼若体の鰓孔周縁細胞群でも顕著な発現が見られ、鰓におけるcosIの顕著な発現は下等脊索動物間で保存されていることがわかった。一方、細胞外マトリックス分子をコードしコラーゲン繊維の形成機構に関与すると考えられているdermatopontinは、進化的には海綿・カタツムリから脊椎動物まで多くの生物種での存在が明らかになっているにもかかわらず、ホヤ関連のESTおよびゲノムデータベースから相同遺伝子を見いだすことは出来なかった。ナメクジウオの他の鰓裂関連遺伝子に関しては、シークエンス解析の結果クローン内のcDNA長が短かいことがわかり、cDNAライブラリーのスクリーニングを行ったが、鰓裂関連遺伝子のクローンの多くが不完全長であることがわかった。そこで今後は、ナメクジウオゲノムの解読後のアノテーション作業に参加することで、鰓裂関連遺伝子の全体像を効率的に明らかにすることを目指すことを予定している。

头足体的sl鱼是一群动物，它们在其余生中继续维持弦的基本状态，并且由于其基因组结构的简单性，它们被认为是研究弦弦共同的身体计划中的一组有用的动物。在上一年，使用基于成年slugfish咽部区域的cDNA图书馆的多分析物ISH方法发现了许多与g裂相关的基因。今年，我们对这些基因进行了测序分析，发现细胞色素氧化物亚基I（COSI）和皮肤桥蛋白在Slugfish的Gill叶片中显着表达。当我们分析在下脊髓松鼠中常见的Slugfish ill中COSI的明显表达时，我们发现在少年Slugfish的Gill外周细胞组中也发现了明显的表达，并且在下和弦中保守了COSI在Gills中的明显表达。另一方面，编码细胞外基质分子并被认为参与胶原蛋白纤维的形成的皮肤桥蛋白在许多物种上都是显而易见的，从海绵和蜗牛到脊椎动物，但没有可能从养育型和基因组合的基因中找到同源基因。关于Slugfish的其他与g相关的基因，测序分析表明，克隆内的cDNA长度很短，并且筛选了cDNA文库，但是发现与Gill相关基因的许多克隆都不完整。因此，将来，我们计划通过破译Slugfish基因组后参与注释工作，有效地阐明与Gill Cleft相关的基因的整体情况。