乳児腸内フローラの形成機構の包括的理解と新規制御法への応用

全面认识婴儿肠道菌群形成机制及新防治方法的应用

• 批准号: 22KJ1790
• 负责人: 小酒井 智也
• 金额: $ 2.83万
• 依托单位: Kyoto University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for JSPS Fellows
• 财政年份: 2023
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2023-03-08 至 2025-03-31
• 项目状态: 未结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-22KJ1790/
• 关键词: ビフィズス菌; 腸内細菌叢; 共生; 乳児

乳児期における有益な細菌叢形成は、生涯にわたり宿主の健康に影響を及ぼすことがわかっている。本研究では、乳児期の腸内細菌叢の形成メカニズムの解明、および有益な菌叢の形成手法の確立を目的とする。乳児期の有益な腸内細菌叢の形成メカニズムの解明にあたり、2022年度は、乳児腸内に棲息する腸内細菌種の特定を実施した。具体的には、数名の健康な母乳栄養児の糞便サンプルから様々な培養条件によって腸内細菌種の単離を行った。種の同定は、完全長の16S rRNA配列を決定することで行った。その結果、乳児腸内でよく検出される既報の細菌種（いくつかのBifidobacterium種やStaphylococcus aureus、Staphylococcus epidermidis、Enterococcus faecalisなど）が大多数を占めていたものの、新種と推定されるBacteroides種も単離することに成功した。本年度は、さらに上記の新種と推定されるBacteroides種について解析を実施した。具体的にはまず、次世代シークエンサーを用いてゲノム解析を実施した。その結果、3つのコンティグから構成されるクオリティの高いゲノム配列を取得することに成功した。また、当該ゲノム配列を公開されている既存のゲノム配列とAverage nucleotide identity解析により比較したところ、高くても95 %の配列類似性しか示さないことが明らかとなった。以上のことから、本菌種は、新種の可能性が高く、本菌種の性状を今後さらに解析することは、乳児期の腸内細菌叢を理解するうえで重要であることが示唆された。

婴儿期有益微生物群的建立已被证明会影响宿主一生的健康。本研究的目的是阐明婴儿期肠道菌群的形成机制，并建立一种形成有益菌群的方法。为了阐明婴儿期有益肠道菌群的形成机制，2022财年，我们鉴定了婴儿肠道内生活的肠道细菌类型。具体来说，我们使用不同的培养条件从几个健康母乳喂养婴儿的粪便样本中分离出肠道细菌种类。通过确定全长 16S rRNA 序列进行物种鉴定。因此，虽然之前报道的婴儿肠道中常见的细菌种类（如几种双歧杆菌、金黄色葡萄球菌、表皮葡萄球菌和粪肠球菌）占大多数，但被认为是新物种的拟杆菌属也被发现我成功放手了。今年，我们对上述拟杆菌属物种进行了进一步分析，推测其为新物种。具体来说，我们首先使用下一代测序仪进行基因组分析。结果，他们成功获得了由三个重叠群组成的高质量基因组序列。此外，当使用平均核苷酸同一性分析将该基因组序列与现有公开的基因组序列进行比较时，发现该序列最多仅显示95％的序列相似性。上述结果表明该菌种很可能是一个新菌种，进一步分析该菌种的特性对于了解婴儿肠道菌群具有重要意义。