ライム病ボレリアの進化遺伝学的研究と媒介マダニの系統解析
莱姆病疏螺旋体的进化遗传学研究及媒介蜱的系统发育分析
基本信息
- 批准号:08640897
- 负责人:
- 金额:$ 1.22万
- 依托单位:
- 依托单位国家:日本
- 项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
- 财政年份:1996
- 资助国家:日本
- 起止时间:1996 至 无数据
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
マダニ属ダニ11種(タネガタマダニ、I.pavlovskyi、シュルツエマダニ、フサマダニ、アサヌママダニ、I.ricinus、タヌキマダニ、ヒトツトゲマダニ、アカコッコマダニ、ヤマトマダニ、I.garnulatus)55個体からDNAを抽出して、PCR法によりリボソームRNA遺伝子間のスペーサー領域の増幅、塩基配列を解析した。配列は約700塩基対からなりそれぞれのマダニ種に特異的な配列を有していた。これらの配列からそれぞれ塩基置換率を計算、similarity matrixを作成さらに近接結合法により系統樹を作成した。またこの系統樹には北米大陸に分布するI.pacificusおよびI.scapularisも加えた。この系統樹において、Ixodes ricinus species complexに属するマダニはすべて近縁でそれぞれ10%以内のクラスターを形成したが、その他のマダニ種はそれ以上、最大70%の差が認められた。さらにこれまでマダニ属での位置づけが明確でなかったフサマダニはマダニ属において最も遺伝的に差の大きい種であることが明らかにされた。これまでマダニの分類は形態による分類のみであったが、本実験による塩基配列を用いた分類はこの形態分類によく一致し、しかも遺伝的距離関係が数値で表せるという利点が有り有用であることが明らかになった。さらに、以前の我々のボレリアに関する研究結果と併せて考察すると、ボレリアの種別とマダニの分類は完全に一致しており、マダニの進化分化につれて寄生ボレリアも適応進化してきたことが本実験によって明らかにすることができた。
DNA was extracted from 55 individuals of 11 species of the genus ticks (I. pavlovskyi, Schulzimus ticks, Schulzimus ticks, Asanuma ticks, I. ricinus, raccoon ticks, human ticks, red-tailed ticks, red-tailed ticks, Yamato ticks, I. garnulatus), and the amplification and nucleotide sequence of the spacer region between ribosomal通过PCR分析RNA基因。该序列由大约700个碱基对组成,并具有针对每个壁虱物种的序列。从这些序列计算基础取代率,并创建了相似性矩阵,并使用接近度耦合方法创建了系统发育树。还添加了该系统发育树。在这种系统发育树中,所有属于ixodes ricinus物种复合物的壁虱均形成小于10%的簇,而其他壁虱物种的差异进一步差异高达70%。此外,已经揭示了该物种尚未被清楚地定义为壁虱属中的物种,是壁虱属中最不同的物种。到目前为止,壁虱仅按形态进行了分类,但是在本实验中使用基本序列的分类与这种形态学分类非常匹配,并且已被证明是有用的,因为它可以在数值上表示为遗传距离关系。此外,当我们检查先前关于伯氏菌的研究的结果时,疏螺旋体的类型和tick的分类是完全一致的,该实验表明,随着tick虫的发展,寄生虫也已经自适应地发展。
项目成果
期刊论文数量(1)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Hamase,A.,Takahashi,Nohgi,K.et al.: "Homology of varicble major protein genes between Borrelia hermsii and Borrelia miyamotoi" FEMS Microbiology Letters. 140(2). 131-137 (1996)
Hamase,A.,Takahashi,Nohgi,K.et al.:“Borrelia Hermsii 和 Borrelia miyamotoi 之间的 varicble 主要蛋白基因的同源性”FEMS 微生物学快报。
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