放線菌の遺伝情報発現制御に関する因子の解析

放线菌遗传信息表达调控相关因素分析

基本信息

批准号：
63560097
负责人：
高橋秀夫
金额：
$ 1.15万
依托单位：
The University of Tokyo
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for General Scientific Research (C)
财政年份：
1988
资助国家：
日本
起止时间：
1988 至无数据
项目状态：
已结题

项目摘要

放線菌は、原核生物の中でも最も複雑な形態的変化を行う微生物として知られており、その遺伝情報の発現制御機構の解明は、基礎、応用の両面において極めて重要である。現在、放線菌の標準株の一つとなっている。§.Coeli color A3(2)をについて、転写機構の中でプロモーターの特異性決定という最も重要な役割を担っているRNAポリメラーゼの主要シグマ因子遺伝子の構造の解析を行った。大腸菌と枯草菌は唯一の主要シグマ因子遺伝子を持っており、それらの塩基配列から両者の間には高い保存性が認められている。大腸菌と枯草菌の主要シグマ因子(rpdD遺伝子産物)の間に認められる共通配列の中で特に主要シグマ因子の機能に重要と考えられる領域より、シグマ因子検出のための合成DNAプローブを作成し、各種の細菌のDNAを用いてジェノミック・サザーン解析を行った。その結果、放線菌群の細菌は、例外なく複数の主要シグマ因子遺伝子を持っていることが示唆された。§.Coeli color A3(2)に認められた4つのシグナルに対応するDNA領域について、クローン化と塩基配列の決定を行った。いずれの領域にも大腸菌および枯草菌のrpoD遺伝子産物と類似の配列を持つORFが発見された。これらのORFから予想されるアミノ酸配列について種々の比較および解析を行った結果、4つの領域は§.Coeli color A3(2)のrpoD相同配列(hrdA〜Dと命名:homolog of rpoD)であると結論された。特に大腸菌、枯草菌のrpoD産物との間で13アミノ酸からなる共通配列が見付かり"rpoD Box"と呼ぶことにした。mRNAレベルでの発現の解析からこれらの遺伝子は、放線菌の形態的な変化と密接な関係があることが示唆された。

放线菌被称为原核生物的最复杂的微生物，就基本和应用而言，它非常重要，以阐明其遗传信息的表达控制机制。目前，它是放线菌的标准菌株之一。 §.CoeliColor A3（2）分析了RNA聚合酶的主要Sigma因子基因的结构，该结构在确定转录机械内启动子特异性方面起着最重要的作用。大肠杆菌和枯草芽孢杆菌仅携带主要的Sigma因子基因，核苷酸序列在它们之间显示高度保存。从大肠杆菌和枯草芽孢杆菌（RPDD基因产物）之间的共有序列制备了Sigma因子的合成DNA探针，这些探针对于主要Sigma因子的功能特别重要，并且使用来自各种细菌的DNA进行基因组南分析。结果表明，放线菌组中的细菌携带多个主要的Sigma因子基因，无一例外。 §。将与A3（2）中观察到的四个信号相对应的Coeli颜色DNA区域克隆并确定测序。在两个区域都发现了具有类似于大肠杆菌和枯草芽孢杆菌的RPOD基因产物的序列的ORF。对这些ORF预测的氨基酸序列的各种比较和分析得出的结论是，这四个区域是§的RPOD同源序列（命名为HRDA-D：RPOD的HRDA-D：同源物）。 Coeli颜色A3（2）。特别是，在大肠杆菌和枯草芽孢杆菌的RPOD产物之间发现了由13个氨基酸组成的共识序列，我们决定将其称为“ RPOD盒”。在mRNA水平上表达的分析表明，这些基因与放线菌的形态变化密切相关。