メンブレンベシクルゲノム解析による根圏細菌間相互作用の解明
通过膜囊泡基因组分析阐明根际细菌之间的相互作用
基本信息
- 批准号：22KJ3147
- 负责人：
- 金额：$ 2.83万
- 依托单位：
- 依托单位国家：日本
- 项目类别：Grant-in-Aid for JSPS Fellows
- 财政年份：2023
- 资助国家：日本
- 起止时间：2023-03-08 至 2025-03-31
- 项目状态：未结题
- 来源：
- 关键词：
项目摘要
本研究では細菌が生産するメンブレンベシクルに着目し、その植物根圏における細菌間遺伝子水平伝播への関与を明らかにすることを目的としている。モデル細菌叢を構築するため、タバコ根より20菌株の細菌を単離し、PacBioシークエンス解析によりその全ゲノム配列を決定した。一方で、シークエンスに十分な核酸をメンブレンベシクルから単離することが困難であったため、今後メンブレンベシクルの単離・精製法に改良が必要である。また、細菌から単離したメンブレンベシクルを宿主植物に接種する実験系を構築し、細菌間相互作用に加えメンブレンベシクルの宿主植物への影響を評価することが可能となった。
这项研究重点关注细菌产生的膜囊泡，旨在阐明它们在植物根际细菌之间水平基因转移中的参与。为了构建模型菌群，从烟草根中分离出 20 株细菌菌株，并通过 PacBio 序列分析确定了它们的全基因组序列。另一方面，从膜囊泡中分离出足够的核酸用于测序一直很困难，因此未来需要改进膜囊泡的分离和纯化方法。此外，我们构建了一个实验系统，在宿主植物中接种从细菌中分离的膜囊泡，使得除了细菌之间的相互作用之外，还可以评估膜囊泡对宿主植物的影响。
项目成果
期刊论文数量（3）
专著数量（0）
科研奖励数量（0）
会议论文数量（0）
专利数量（0）
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- DOI：
- 发表时间：2023
- 期刊：
- 影响因子：0
- 作者：島﨑 智久;Neumann Ulla;中野 亮平
- 通讯作者：中野 亮平
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