Dynamic behavior and pathological significance of small RNA in outer membrane vesicles of periodontopathic bacteria

牙周病菌外膜囊泡小RNA的动态行为及病理意义

• 批准号: 21KK0164
• 负责人: 中尾 龍馬
• 金额: $ 12.15万
• 依托单位: National Institute of Infectious Diseases
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Fund for the Promotion of Joint International Research (Fostering Joint International Research (B))
• 财政年份: 2021
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2021-10-07 至 2025-03-31
• 项目状态: 未结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-21KK0164/
• 关键词: 細菌由来膜小胞; 細菌膜小胞; small RNA; 歯周病

Porphyromonas gingivalis (Pg)のRNAseqに関して、Pg 菌体 (WC) と外膜小胞 (OMV)からのRNA抽出方法を確立した。また、Pg WCとOMVに含まれるRNA成分をRNA-seqにより解析し、OMVs中に蓄積されるRNA成分が明らかになった。Pg WC由来RNAを使ってCappable-seqを行い、Pg ゲノム上の2,354ヵ所の転写開始点を同定できた。Pg WC OMVsをマウスへ静脈内投与した後の、各臓器 (blood, brain, heart, limb, liver, lung, kidney, spleen, pancreas) からDNAを抽出し、リアルタイムPCRで検出を試みたところ、PgのWC投与の場合、48時間後、調べた臓器のいずれからもからもDNAが検出されなかった。一方PgのOMVs投与の場合は、48時間後には、脳で検出されたが、その他の臓器からは検出されなかった。

关于牙龈卟啉单胞菌（Pg）的RNAseq，我们建立了从Pg细菌细胞（WC）和外膜囊泡（OMV）中提取RNA的方法。另外，通过RNA-seq对Pg WC和OMV中含有的RNA成分进行分析，明确了OMV中积累的RNA成分。使用 Cappable-seq 使用 Pg WC 衍生的 RNA，我们能够识别 Pg 基因组上的 2,354 个转录起始位点。给小鼠静脉注射Pg WC OMV后，从各器官（血液、脑、心脏、四肢、肝脏、肺、肾、脾、胰腺）中提取DNA，并通过实时PCR进行检测。在WC施用48小时后，在所检查的任何器官中均未检测到 DNA。另一方面，当Pg与OMV一起施用时，48小时后在大脑中检测到它，但在其他器官中没有检测到。

项目成果

ウシ型結核菌弱毒株BCG由来メンブレンヴェシクルを用いた新規結核ワクチン開発

使用源自减毒牛分枝杆菌菌株 BCG 的膜囊泡开发新型结核病疫苗

• 发表时间: 2023
• 作者: 山口雄大;寒川訓明;中尾龍馬;明田幸宏
• 通讯作者: 明田幸宏

Prospective vaccine strategy using bacterial membrane vesicles delivered into nasal cavity

使用细菌膜囊泡递送至鼻腔的前瞻性疫苗策略

• 发表时间: 2021
• 作者: 中尾龍馬;山口雄大;石原和幸;明田幸宏;Ryoma Nakao
• 通讯作者: Ryoma Nakao

プロバイオティクス大腸菌キメラ由来メンブレンヴェシクルによる莢膜保有病原体に対するワクチン

使用益生菌大肠杆菌嵌合体衍生的膜囊泡对抗荚膜病原体的疫苗

• 发表时间: 2023
• 作者: 中尾龍馬;岩渕佑介;川原一芳;明田幸宏;大西真
• 通讯作者: 大西真

Methods in Molecular Biology: Glycine Induction Method: Effective Production of Immunoactive Bacterial Membrane Vesicles with Low Endotoxin Content

分子生物学方法：甘氨酸诱导法：有效产生低内毒素含量的免疫活性细菌膜囊泡

• 发表时间: 2022
• 作者: Hirayama S;Nakao R.
• 通讯作者: Nakao R.

Scanning Electron Microscopy of Escherichia coli Encapsulated in a Spacerized Graphene Sandwich

扫描电子显微镜观察封装在间隔石墨烯三明治中的大肠杆菌

• DOI: 10.1093/jmicro/dfac010
• 发表时间: 2022
• 期刊: Microscopy
• 影响因子: 1.8
• 作者: Sasaki;Yuki; Hirayama;Satoru; Nakao;Ryoma
• 通讯作者: Ryoma