Search for bioactive substances of tropical rare actinomycetes derived from Thailand based on genomic microbiology

基于基因组微生物学寻找泰国热带珍稀放线菌生物活性物质

基本信息

批准号：
21KK0101
负责人：
小谷真也
金额：
$ 12.15万
依托单位：
Shizuoka University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Fund for the Promotion of Joint International Research (Fostering Joint International Research (B))
财政年份：
2021
资助国家：
日本
起止时间：
2021-10-07 至 2026-03-31
项目状态：
未结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-21KK0101/
关键词：
希少放線菌タイ生理活性物質熱帯放線菌

项目摘要

熱帯地域は、生物多様性の観点から、豊富な微生物資源を含む。放線菌は抗生物質の探索源であり、これまで単離の難しかった希少放線菌が新たな探索源として注目されている。熱帯土壌には希少放線菌が分布していることが知られており、新たな抗生物質の探索研究の格好の標的である。このような背景の元、新規生理活性物質の発見を目的とし、タイチュラロンコン大学の放線菌研究者と共同研究で希少放線菌に標的を定めタイの微生物資源の開発を行うことが、本研究の目的である。実験に先立ち、MTAをチュラロンコン大学との間に締結し、研究用渡航ビザを取得した。2022年11月に日本人研究者の3名がタイのバンコクに渡航し、チュラロンコン大学理学部の先生と、一連の共同研究を行った。渡航中に、チュラロンコン大学の学生が参加するセミナーを行い、研究発表を行った。チュラロンコン大学では、大学敷地内で菌分離のための試料をサンプリングした。誘引物質としてスキンミルクを用い、土壌及び枯れた植物の葉っぱなどを用いて、フィルターを通過する遊走性のある胞子を集積した。遊走性胞子を集積した溶液をＨＶ寒天培地に塗布し、1-2週間培養を行い、コロニーを検出した。その結果、100株程度の放線菌を単離した。それぞれの株に関して、16S rDNA遺伝子の配列を決定し、解析したところ、ほとんどが、希少放電菌であり、新種の可能性のある株が複数見られた。現在、植物防疫所の植物病原性の解除の申請を行っているところであり、解除が出来次第、生理活性物質の単離実験を行う予定である。

从生物多样性角度来看，热带地区蕴藏着丰富的微生物资源。放线菌是抗生素的发现源，而难以分离的稀有放线菌作为新的发现源正在引起人们的关注。已知稀有放线菌分布在热带土壤中，使其成为发现新抗生素的理想研究目标。在此背景下，本研究以发现新的生理活性物质为目的，通过与泰楚拉隆功大学放线菌研究人员的联合研究，以稀有放线菌为目标，开发泰国的微生物资源。在实验之前，我们与朱拉隆功大学签订了MTA并获得了研究旅行签证。 2022年11月，三名日本研究人员前往泰国曼谷，与朱拉隆功大学理学院教授进行了一系列联合研究。访问期间，他举办了一场由朱拉隆功大学学生参加的研讨会，并做了研究报告。在朱拉隆功大学，用于细菌分离的样本是在大学校园内取样的。使用皮乳作为引诱剂，使用土壤和枯萎植物的叶子来收集可以通过过滤器的迁移孢子。将含有累积的迁移孢子的溶液施加到HV琼脂培养基上，培养1-2周，并检测菌落。结果，分离出约100株放线菌。当我们对每个菌株的16S rDNA基因进行测序和分析时，我们发现它们大部分是稀有排出菌，并且发现了几个可能是新物种的菌株。我们目前正在申请植物保护局解除植物致病状态，计划解除后立即进行生理活性物质的分离实验。