Molekularbiologische, biochemische und biophysikalische Charakterisierung der posttranslationalen Prenylierung von Ypt/Rab Proteinen sowie deren Wechselwirkung mit Effektorproteinen

Ypt/Rab 蛋白翻译后异戊二烯化的分子生物学、生物化学和生物物理特征及其与效应蛋白的相互作用

基本信息

项目摘要

Die posttranslationale Geranylgeranylierung von Ypt/Rab Proteinen (Ypt7 [Hefe], Rab5 [Mensch] und Rab7 [Hund]) wird in allen Teilschritten der Komplexbildung, der Prenylierungsreaktion und dem Zerfall des Komplexes kinetisch, mechanistisch und strukturell untersucht. Die wesentlichen Untersuchungsmethoden werden Fluoreszenzspektroskopie, die chemo-enzymatische Synthese und die Röntgenstrukturanalyse sein. Wir werden das System aus Hefe (Ypt7:MRS6:Bet2-Bet4) und aus Säugetier (Rab7:REP-1:RabGGTase) vergleichend charakterisieren. Im Rahmen des Projekts werden die Ypt/Rab-spezifischen GDP/GTP-Austauschfaktoren (GNEF) Rabex-5 (Rab5), Vps9 (Ypt51) und Dss4 (Ypt1) kinetisch und strukturell untersucht. Neben der vergleichenden Charakterisierung mit anderen GNEFs werden Ypt/Rab-spezifische Fragestellungen (z.B. Abhängigkeit der Austauschaktivität von Prenylierung und Membranassoziation) bearbeitet. Die kinetische und strukturelle Charakterisierung von Ypt/Rab-spezifischen, GTPase aktivierenden Proteinen (GAP) ist ein weiterer Schwerpunkt für die Analyse der Regulation des GDP/GTP-Zyklus durch Ypt/Rab-spezifische Proteine. Wir werden hierfür das Modellsystem Ypt7:Gyp7 aus Hefe untersuchen. Weiterhin soll im Rahmen des Projekts die Wechselwirkung der Effektorproteine Rabaptin-5 bzw. Rabaptin-5ß und EEA1 mit den Rab-Proteinen Rab5 und Rab4 mit biophysikalischen Methoden untersucht werden. Schwerpunkt hierbei liegt auf der Strukturanalyse einzelner wechselwirkender Domänen mittels NMR und/oder Röntgendiffraktion.
翻译后的 Geranylgeranylierung von Ypt/Rab Proteinen(Ypt7 [Hefe]、Rab5 [Mensch] 和 Rab7 [Hund])在 allen Teilschritten der Komplexbildung、der Prenylierungsreaktion 和 dem Zerfall des Komplexes kinetisch、mechanisch und strukturell untersucht 中。 Im Rahmen des System aus Hefe (Ypt7:MRS6:Bet2-Bet4) 和 aus Säugetier (Rab7:REP-1:RabGGTase) Rabex-5 (Rab5)、Vps9 (Ypt51) 和 Dss4 (Ypt1) 的运动和结构。 Ypt/Rab-spezifische Fragestellungen (z.B. Abhängigkeit der Austauschaktivität von Prenylierung und Membranassoziation)对 GDP/GTP-Zyklus durch Ypt/Rab-spezifische Proteine 的监管进行分析。 Rabaptin-5ß 和 EEA1 与 Rab-Proteinen Rab5 和 Rab4 结合生物物理学方法。

项目成果

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