Refinement of protein structure prediction by using simulation and database analyses

通过模拟和数据库分析完善蛋白质结构预测

基本信息

批准号：
16K16142
负责人：
Shirota Matsuyuki
金额：
$ 2.5万
依托单位：
Tohoku University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
财政年份：
2016
资助国家：
日本
起止时间：
2016-04-01 至 2018-03-31
项目状态：
已结题

项目摘要

项目成果

期刊论文数量（7）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

NGSで見つかる選択的マイクロエクソンとタンパク質構造・機能への影響

NGS 发现的选择性微外显子及其对蛋白质结构和功能的影响

DOI：
发表时间：
2017
期刊：
影响因子：
0
作者：
Sakura Rai;Mayu Aoki;Yutaka Shimada;Kantaro Fujiwara;and Tohru Ikeguchi;城田松之
通讯作者：
城田松之

Annotation of missense genomic variations based on various protein 3D structures

基于各种蛋白质 3D 结构的错义基因组变异注释

DOI：
发表时间：
2017
期刊：
影响因子：
0
作者：
小山直毅;田中一晶;小川浩平;石黒浩;Matsuyuki Shirota
通讯作者：
Matsuyuki Shirota

Structural and functional analysis of alternative microexons of proteins observed in RNA-seq studies.

RNA-seq 研究中观察到的蛋白质替代微外显子的结构和功能分析。

DOI：
发表时间：
2017
期刊：
影响因子：
0
作者：
小原宗一郎;田中一晶;小川浩平;吉川雄一郎;石黒浩;岡夏樹;Matsuyuki Shirota
通讯作者：
Matsuyuki Shirota

Cold adaptation of organisms and the evolution of protein sequences

生物体的冷适应和蛋白质序列的进化

DOI：
发表时间：
2016
期刊：
影响因子：
0
作者：
Naoki Koyama;Kazuaki Tanaka;Kohei Ogawa;Hiroshi Ishiguro;城田松之
通讯作者：
城田松之

Regulation and structure-function relationship of alternative microexons in proteins

蛋白质中替代微外显子的调控和结构功能关系

DOI：
发表时间：
2017
期刊：
影响因子：
0
作者：
大城健太郎;田中一晶;中西英之;Masahiro Kasahara;Matsuyuki Shirota
通讯作者：
Matsuyuki Shirota

DOI：
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作者：
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Shirota Matsuyuki其他文献

GWAS Identified IL4R and the Major Histocompatibility Complex Region as the Associated Loci of Total Serum IgE Levels in 9,260 Japanese Individuals

GWAS 确定 IL4R 和主要组织相容性复合体区域是 9,260 名日本人血清总 IgE 水平的相关位点

DOI：
10.1016/j.jid.2021.02.762
发表时间：
2021
期刊：
Journal of Investigative Dermatology
影响因子：
6.5
作者：
Shido Kosuke;Kojima Kaname;Shirota Matsuyuki;Yamasaki Kenshi;Motoike Ikuko N.;Hozawa Atsushi;Ogishima Soichi;Minegishi Naoko;Tanno Kozo;Katsuoka Fumiki;Tamiya Gen;Aiba Setsuya;Yamamoto Masayuki;Kinoshita Kengo
通讯作者：
Kinoshita Kengo

A novel variant in the transmembrane 4 domain of ANO3 identified in a two-year-old girl with developmental delay and tremor

在一名患有发育迟缓和震颤的两岁女孩中发现了 ANO3 跨膜 4 结构域的新变异

DOI：
10.1038/s10038-022-01082-5
发表时间：
2022
期刊：
Journal of Human Genetics
影响因子：
3.5
作者：
Aihara Yu;Shirota Matsuyuki;Kikuchi Atsuo;Katata Yu;Abe Yu;Niihori Tetsuya;Funayama Ryo;Nakayama Keiko;Aoki Yoko;Kure Shigeo
通讯作者：
Kure Shigeo

Current status of the availability of three-dimensional structures for interpretation of missense variants in human genome

用于解释人类基因组错义变异的三维结构可用性的现状

DOI：
发表时间：
2022
期刊：
影响因子：
0
作者：
Nakano Tomohiro;Sasahara Yoji;Kikuchi Atsuo;Moriya Kunihiko;Niizuma Hidetaka;Niihori Tetsuya;Shirota Matsuyuki;Funayama Ryo;Nakayama Keiko;Aoki Yoko;Kure Shigeo;Matsuyuki Shirota
通讯作者：
Matsuyuki Shirota

高精度放射線治療における局所制御の意義

局部控制在高精度放疗中的意义

DOI：
发表时间：
2021
期刊：
影响因子：
0
作者：
Inoue-Shibui Aya;Niihori Tetsuya;Kobayashi Michio;Suzuki Naoki;Izumi Rumiko;Warita Hitoshi;Hara Kenju;Shirota Matsuyuki;Funayama Ryo;Nakayama Keiko;Nishino Ichizo;Aoki Masashi;Aoki Yoko;木村智樹
通讯作者：
木村智樹

Heterozygous calcyclin-binding protein/Siah1-interacting protein (CACYBP/SIP) gene pathogenic variant linked to a dominant family with paucity of interlobular bile duct

杂合钙周期蛋白结合蛋白/Siah1相互作用蛋白（CACYBP/SIP）基因致病性变异与缺乏小叶间胆管的显性家族相关

DOI：
10.1038/s10038-022-01017-0
发表时间：
2022
期刊：
Journal of Human Genetics
影响因子：
3.5
作者：
Kanno Miyako;Suzuki Mitsuyoshi;Tanikawa Ken;Numakura Chikahiko;Matsuzawa Shu-ichi;Niihori Tetsuya;Aoki Yoko;Matsubara Yoichi;Makino Satoshi;Tamiya Gen;Nakano Satoshi;Funayama Ryo;Shirota Matsuyuki;Nakayama Keiko;Mitsui Tetsuo;Hayasaka Kiyoshi
通讯作者：
Hayasaka Kiyoshi