Development of information system for functional annotation of genomic sequence alterations by using protein 3D structures

利用蛋白质 3D 结构开发基因组序列改变功能注释的信息系统

基本信息

批准号：
18K06194
负责人：
Shirota Matsuyuki
金额：
$ 2.83万
依托单位：
Tohoku University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份：
2018
资助国家：
日本
起止时间：
2018-04-01 至 2021-03-31
项目状态：
已结题

项目摘要

项目成果

期刊论文数量（6）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

Development of genome variant annotation system with protein 3D structures and applications to variants in Japanese population

开发具有蛋白质 3D 结构的基因组变异注释系统及其在日本人群变异中的应用

DOI：
发表时间：
2018
期刊：
影响因子：
0
作者：
Saitoh Yasuaki;Katane Masumi;Miyamoto Tetsuya;Sekine Masae;Sakamoto Taro;Imai Hirotaka;Homma Hiroshi;Matsuyuki Shirota
通讯作者：
Matsuyuki Shirota

Comprehensive and Up-to-date Annotation of Nonsynonymous Single Nucleotide Variants of Human Genome with Protein Structure Information

具有蛋白质结构信息的人类基因组非同义单核苷酸变异体的全面和最新注释

DOI：
发表时间：
2020
期刊：
影响因子：
0
作者：
Hanai Toshihiko;Katane Masumi;Homma Hiroshi;Matsuyuki Shirota
通讯作者：
Matsuyuki Shirota

蛋白質立体構造を用いたゲノムバリアントのアノテーション法の開発と日本人集団バリアントへの応用

使用蛋白质 3D 结构开发基因组变异注释方法及其在日本人群变异中的应用

DOI：
发表时间：
2018
期刊：
影响因子：
0
作者：
Saitoh Yasuaki;Katane Masumi;Miyamoto Tetsuya;Sekine Masae;Sakamoto Taro;Imai Hirotaka;Homma Hiroshi;Matsuyuki Shirota;Zhiying You;城田松之
通讯作者：
城田松之

Analysis on nonsynonymous variations with possible structural and functional impact on loss-of-function intolerant proteins

分析对功能丧失不耐受蛋白可能产生结构和功能影响的非同义变异

DOI：
发表时间：
2019
期刊：
影响因子：
0
作者：
Hanai Toshihiko;Katane Masumi;Homma Hiroshi;Matsuyuki Shirota;Matsuyuki Shirota
通讯作者：
Matsuyuki Shirota

Development of a genome annotation system based on protein three-dimensional structures

基于蛋白质三维结构的基因组注释系统开发

DOI：
发表时间：
2018
期刊：
影响因子：
0
作者：
Hanai Toshihiko;Katane Masumi;Homma Hiroshi;Matsuyuki Shirota;Matsuyuki Shirota;Matsuyuki Shirota
通讯作者：
Matsuyuki Shirota

DOI：
{{ item.doi }}
发表时间：
{{ item.publish_year }}
期刊：
{{ item.journal_name }}
影响因子：
{{ item.factor }}
作者：
{{ item.authors }}
通讯作者：
{{ item.author }}

数据更新时间：{{ journalArticles.updateTime }}

作者：
{{ item.author }}

数据更新时间：{{ monograph.updateTime }}

作者：
{{ item.author }}

数据更新时间：{{ sciAawards.updateTime }}

作者：
{{ item.author }}

数据更新时间：{{ conferencePapers.updateTime }}

作者：
{{ item.author }}

数据更新时间：{{ patent.updateTime }}

Shirota Matsuyuki其他文献

GWAS Identified IL4R and the Major Histocompatibility Complex Region as the Associated Loci of Total Serum IgE Levels in 9,260 Japanese Individuals

GWAS 确定 IL4R 和主要组织相容性复合体区域是 9,260 名日本人血清总 IgE 水平的相关位点

DOI：
10.1016/j.jid.2021.02.762
发表时间：
2021
期刊：
Journal of Investigative Dermatology
影响因子：
6.5
作者：
Shido Kosuke;Kojima Kaname;Shirota Matsuyuki;Yamasaki Kenshi;Motoike Ikuko N.;Hozawa Atsushi;Ogishima Soichi;Minegishi Naoko;Tanno Kozo;Katsuoka Fumiki;Tamiya Gen;Aiba Setsuya;Yamamoto Masayuki;Kinoshita Kengo
通讯作者：
Kinoshita Kengo

A novel variant in the transmembrane 4 domain of ANO3 identified in a two-year-old girl with developmental delay and tremor

在一名患有发育迟缓和震颤的两岁女孩中发现了 ANO3 跨膜 4 结构域的新变异

DOI：
10.1038/s10038-022-01082-5
发表时间：
2022
期刊：
Journal of Human Genetics
影响因子：
3.5
作者：
Aihara Yu;Shirota Matsuyuki;Kikuchi Atsuo;Katata Yu;Abe Yu;Niihori Tetsuya;Funayama Ryo;Nakayama Keiko;Aoki Yoko;Kure Shigeo
通讯作者：
Kure Shigeo

高精度放射線治療における局所制御の意義

局部控制在高精度放疗中的意义

DOI：
发表时间：
2021
期刊：
影响因子：
0
作者：
Inoue-Shibui Aya;Niihori Tetsuya;Kobayashi Michio;Suzuki Naoki;Izumi Rumiko;Warita Hitoshi;Hara Kenju;Shirota Matsuyuki;Funayama Ryo;Nakayama Keiko;Nishino Ichizo;Aoki Masashi;Aoki Yoko;木村智樹
通讯作者：
木村智樹

Current status of the availability of three-dimensional structures for interpretation of missense variants in human genome

用于解释人类基因组错义变异的三维结构可用性的现状

DOI：
发表时间：
2022
期刊：
影响因子：
0
作者：
Nakano Tomohiro;Sasahara Yoji;Kikuchi Atsuo;Moriya Kunihiko;Niizuma Hidetaka;Niihori Tetsuya;Shirota Matsuyuki;Funayama Ryo;Nakayama Keiko;Aoki Yoko;Kure Shigeo;Matsuyuki Shirota
通讯作者：
Matsuyuki Shirota

Heterozygous calcyclin-binding protein/Siah1-interacting protein (CACYBP/SIP) gene pathogenic variant linked to a dominant family with paucity of interlobular bile duct

杂合钙周期蛋白结合蛋白/Siah1相互作用蛋白（CACYBP/SIP）基因致病性变异与缺乏小叶间胆管的显性家族相关

DOI：
10.1038/s10038-022-01017-0
发表时间：
2022
期刊：
Journal of Human Genetics
影响因子：
3.5
作者：
Kanno Miyako;Suzuki Mitsuyoshi;Tanikawa Ken;Numakura Chikahiko;Matsuzawa Shu-ichi;Niihori Tetsuya;Aoki Yoko;Matsubara Yoichi;Makino Satoshi;Tamiya Gen;Nakano Satoshi;Funayama Ryo;Shirota Matsuyuki;Nakayama Keiko;Mitsui Tetsuo;Hayasaka Kiyoshi
通讯作者：
Hayasaka Kiyoshi