Basic and applied genomics of enterohemorrhagic Escherichia coli and related enteropathogens

肠出血性大肠杆菌及相关肠道病原体的基础和应用基因组学

• 批准号: 17019058
• 负责人: HAYASHI Tetsuya
• 金额: $ 97.15万
• 依托单位: University of Miyazaki
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
• 财政年份: 2005
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2005 至 2009
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-17019058/
• 关键词: 病原性大腸菌; 腸内常在菌; 多様性; 病原性; 腸炎ビブリオ; 疫学ツールの開発; 腸内常在菌叢; III型分泌系; 発現制御; O抗原合成遺伝子; 常在菌; バクテリオファージ

By performing a series of genome sequencing and functional analyses of enterohemorrhagic Ecsherichia coli (EHEC) and related enteropathogens. we succeeded in developing a rapid O157 EHEC strain typing system, obtaining the complete genome sequences of three major non-O157 EHECs, and improving our understanding of functions and evolution mechanisms of type III secretion mechanisms and other virulence systems of these pathogens. In addition, we succeeded in clarifying the genetic and functional differences of adult and infant gut microbiota by comparative metagenomic analysis and obtaining the complete genome sequences of 3 bacterial species (4 strains, including an unculturable bacterium) residing in intestine.

通过对肠出血性大肠杆菌 (EHEC) 和相关肠道病原体进行一系列基因组测序和功能分析。我们成功开发了O157肠出血性大肠杆菌快速菌株分型系统，获得了三种主要非O157肠出血性大肠杆菌的完整基因组序列，提高了我们对这些病原体的III型分泌机制和其他毒力系统的功能和进化机制的认识。此外，我们通过比较宏基因组分析，成功阐明了成人和婴儿肠道微生物群的遗传和功能差异，并获得了肠道内3种细菌（4个菌株，包括不可培养细菌）的完整基因组序列。

项目成果

High-level fluoroquinolone resistance in ophthalmic clinical isolates belonging to the species Corynebacterium macginleyi

• DOI: 10.1128/jcm.01741-07
• 发表时间: 2008-02-01
• 期刊: JOURNAL OF CLINICAL MICROBIOLOGY
• 影响因子: 9.4
• 作者: Eguchi, Hiroshi;Kuwahara, Tomomi;Shiota, Hiroshi
• 通讯作者: Shiota, Hiroshi

The biology of vibrios.

• DOI: 10.1128/9781555815714
• 发表时间: 2006
• 作者: F. Thompson;B. Austin;J. Swings

腸炎ビブリオの耐熱性溶血毒と2つのIII型分泌装置の細胞毒性と腸管毒性における役割.

副溶血弧菌的热稳定溶血素和两种 III 型分泌装置在细胞毒性和肠毒性中的作用。

• 发表时间: 2008
• 作者: 日吉大貴;その;他
• 通讯作者: 他

細菌の病原性と生残戦略との関連

细菌致病性与生存策略的关系

• 发表时间: 2007
• 作者: Iida;T.;(Keynote Lecture);飯田哲也(ワークショップ)
• 通讯作者: 飯田哲也(ワークショップ)

データベース/ソフトウェア:Escherichia coli O157:H7 Sakai genome database

数据库/软件：大肠杆菌 O157:H7 Sakai 基因组数据库