Basic and applied genomics of enterohemorrhagic Escherichia coli and related enteropathogens

肠出血性大肠杆菌及相关肠道病原体的基础和应用基因组学

• 批准号: 17019058
• 负责人: HAYASHI Tetsuya
• 金额: $ 97.15万
• 依托单位: University of Miyazaki
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
• 财政年份: 2005
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2005 至 2009
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-17019058/
• 关键词: 病原性大腸菌; 腸内常在菌; 多様性; 病原性; 腸炎ビブリオ; 疫学ツールの開発; 腸内常在菌叢; III型分泌系; 発現制御; O抗原合成遺伝子; 常在菌; バクテリオファージ

By performing a series of genome sequencing and functional analyses of enterohemorrhagic Ecsherichia coli (EHEC) and related enteropathogens. we succeeded in developing a rapid O157 EHEC strain typing system, obtaining the complete genome sequences of three major non-O157 EHECs, and improving our understanding of functions and evolution mechanisms of type III secretion mechanisms and other virulence systems of these pathogens. In addition, we succeeded in clarifying the genetic and functional differences of adult and infant gut microbiota by comparative metagenomic analysis and obtaining the complete genome sequences of 3 bacterial species (4 strains, including an unculturable bacterium) residing in intestine.

通过进行一系列基因组测序和对肠hag的ecsherichia coli（EHEC）和相关肠病毒的功能分析。我们成功地开发了快速的O157 EHEC菌株分型系统，获得了三个主要非O157 EHEC的完整基因组序列，并提高了我们对这些病原体的III型分泌机制和其他毒力系统的功能和进化机制的理解和进化机制。此外，我们通过比较的元基因组分析成功阐明了成人和婴儿肠道菌群的遗传和功能差异，并获得了居住在纯料中的3种细菌种类（包括4种菌株，包括不可培养细菌）的完整基因组序列。

项目成果

High-level fluoroquinolone resistance in ophthalmic clinical isolates belonging to the species Corynebacterium macginleyi

• DOI: 10.1128/jcm.01741-07
• 发表时间: 2008-02-01
• 期刊: JOURNAL OF CLINICAL MICROBIOLOGY
• 影响因子: 9.4
• 作者: Eguchi, Hiroshi;Kuwahara, Tomomi;Shiota, Hiroshi
• 通讯作者: Shiota, Hiroshi

Functional analyses of the late region genes of Stx2 phage from O157:H7 Sakai.

O157:H7 Sakai Stx2 噬菌体晚期区域基因的功能分析。

• 发表时间: 2010
• 作者: Md.R.Islam;et al.
• 通讯作者: et al.

Fosmid mapping法とWhole genome PCR scanning法を用いた腸管病原性大腸菌B171株のgenomic islandの網羅的な同定と配列決定.

使用 Fosmid 作图和全基因组 PCR 扫描对致病性大肠杆菌 B171 菌株的基因组岛进行全面鉴定和测序。

• 发表时间: 2009
• 作者: 小椋義俊;他
• 通讯作者: 他

STECにおいてISの転移に関与する因子の同定

STEC IS 转移相关因素的鉴定

• 发表时间: 2009
• 作者: 楠本正博;他
• 通讯作者: 他

腸管出血性大腸菌O157 : H7における核様体構造変化による病原性遺伝子発現活性化

肠出血性大肠杆菌 O157：H7 中核结构变化导致致病基因表达激活

• 发表时间: 2009
• 作者: 戸邉亨;他
• 通讯作者: 他