Functional Genomics based upon mouse inter-subspecific consomic strain

基于小鼠亚种间康体菌株的功能基因组学

• 批准号: 17018033
• 负责人: SHIROISHI Toshihiko
• 金额: $ 114.75万
• 依托单位: National Institute of Genetics
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
• 财政年份: 2005
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2005 至 2009
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-17018033/
• 关键词: C57BL; 6; MSM; Ms; コンソミック系統; SNP; ゲノム多型性; 表現型多様性; QTL; サブコンソミック系統; マウス亜種; 表現型スクリーニング; エネルギー代謝; 行動特性; 遺伝学; ゲノム; 行動学; 進化; 糖尿病; マウス; 表現型; SNP解析

Based upon large genomic and phenotypic differences between two mouse subspecies, we have developed an analytic platform for mouse functional genomics. Systematic phenotyping of a full set of mouse inter-subspecific consomic strains, in which each chromosome of a standard inbred strain C57BL/6J is replaced by its counter part of Japanese wild mice-derived MSM/Ms, successfully detected more than 200 QTLs that affect growth, metabolism, and behavioral complex traits. Beside, we have constructed genome and phenotype databases, integrating SNPs and the QTLs detected by the consomic strains. These databases are now open to public.

基于两种小鼠亚种之间的大基因组和表型差异，我们开发了一个用于小鼠功能基因组学的分析平台。一组全套鼠标间的综合菌株的系统表型，其中标准的近交菌株C57BL/6J的每个染色体都被其日本野生小鼠衍生的MSM/MS的柜台部分取代，成功地检测到了200 QTLS生长，代谢和行为复杂性状。除此之外，我们还构建了基因组和表型数据库，整合了由综合菌株检测到的SNP和QTL。这些数据库现在向公众开放。

项目成果

Genetic analysis of inter-male aggression using consomic mouse strains established from C57BL/6J and MSM

使用 C57BL/6J 和 MSM 建立的体体小鼠品系进行雄性间攻击行为的遗传分析

• 发表时间: 2008
• 作者: Takahashi;A.;Tomihara;K.;Shiroishi;T.;Koide;T.
• 通讯作者: T.

Aberrant neurological development caused by genetic incompatibility between two wild-derived mouse strains.

两种野生小鼠品系之间的遗传不相容性导致神经发育异常。

• 发表时间: 2007
• 作者: Umemori;J.;Kondou;R.;Uno;T.;Yuasa;S.;Koide;T.:
• 通讯作者: T.:

Complex genetic architecture of social interaction and aggressive behavior clarified using consomic strains derived from MSM and C57BL/6.

使用源自 MSM 和 C57BL/6 的染色体菌株阐明了社会互动和攻击行为的复杂遗传结构。

• 发表时间: 2008
• 作者: Takahashi;A.;Sugimoto;H.;Kimura;S.;Tomihara;K.;Tsuchiya;T.;Kakihara;S.;Tanemura;M.;Shiroishi;T.;Koide;T.
• 通讯作者: T.

糖尿病研究におけるforward geneticsアプローチ

糖尿病研究中的正向遗传学方法

• 发表时间: 2008
• 作者: Takeo Suzuki;Tomoyuki Numata;Takuo Osawa;Tsutomu Suzuki;城石俊彦
• 通讯作者: 城石俊彦

多因子表現型の遺伝解析系としてのマウス亜種間コンソミック系統の樹立と応用

小鼠亚种间染色体株多因素表型遗传分析系统的建立及应用

• 发表时间: 2006
• 作者: 高田豊行;三田晃彦;前野哲輝;岡彩子;田村勝;坂井隆浩;設楽浩志;吉川欣亮;森脇和郎;米川博通;城石俊彦
• 通讯作者: 城石俊彦