繋留因子群の立体構造解析による膜融合制御機構の解明

通过束缚因子的三维结构分析阐明膜融合控制机制

基本信息

  • 批准号:
    16044214
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 4.16万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
  • 财政年份:
    2005
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    2005 至 2006
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

オルガネラ間の物質輸送は小胞を介して行われる.目的の部位に到達した小胞は,標的膜と融合することによって積荷を受け渡す.繋留因子は,膜融合の初期段階で,小胞とその標的膜とを特異的に繋留することによって輸送の特異性を保証する.繋留因子は,3-8個のサブユニットから構成されるタンパク質複合体であり,低分子量GTPaseとの相互作用によってヌクレオチド依存的に制御されている.本研究では,開口放出で働くExocyst複合体の立体構造をX線結晶構造解析あるいは電子顕微鏡によって決定し,繋留の物理的機構とその制御機構を明らかにする.さらに,変異体をつかって細胞レベル,in vitroでの解析を行い,機能の面からの裏付けを行う.今年度は,ほ乳類のExocyst複合体の電子顕微鏡による解析と,酵母のExocyst複合体と結合するSec4のGEFであるSec2のX線結晶構造解析を行なった.Exocyst複合体は,ブタ脳あるいはラット脳から精製し,電子顕微鏡をつかって,酢酸ウラニルによる負染色像を観察した.当初は,粒子の均一性に問題があったが,調製方法を改善することにより,Exocyst複合体全体と考えられる約150Åの大きさの粒子を多く観察できるようになった.しかしながら,解離した複合体と考えられる約60Åと120Åの大きさの粒子が依然として残っており,解析の妨げとなっている.粒子の均一性を高めることにより,単粒子解析が可能な試料調製法を確立することが,今後の課題である.また,Exocyst複合体と相互作用するRalのGTPase活性化タンパク質を新規に同定した.in vitroでの活性測定を終え,現在は,細胞レベルでの解析を行なっている.一方,Sec2については,Sec4との相互作用領域の結晶構造を3.0Å分解能で決定した.Sec2のSec4結合領域は,200Åの長さをもつトロポミオシン様のcoiled coilを形成していた.現在,立体構造にもとついてin vitroでの機能解析を進めている.
细胞器之间的物质运输是通过囊泡进行的。到达目标位点的囊泡通过与目标膜融合来转移货物。在膜融合的初始阶段,束缚因子与囊泡相互作用。通过将其特异性束缚于囊泡,确保了运输的特异性。目标膜是由 3 至 8 个亚基组成的蛋白质复合物。在本研究中,我们通过X射线晶体学或电子显微镜确定了在胞吐作用中发挥作用的Exocyst复合体的三维结构,并研究了其束缚的物理机制及其控制机制。此外,我们将使用突变体。为了研究细胞水平,我们将进行体外分析来支持该功能。今年,我们将对哺乳动物 Exocyst 复合物进行电子显微镜分析,并对 Sec2(与酵母 Exocyst 复合物结合的 Sec4 的 GEF)进行 X 射线结晶。从猪脑或大鼠脑中纯化Exocyst复合物,并使用电子显微镜观察乙酸双氧铀负染色图像,最初,颗粒的均匀性存在问题,但通过改进制备方法,E。可以观察到许多尺寸约为 150 Å 的颗粒,这些颗粒被认为是整个 xocyst 复合体。然而,尺寸约为 60 Å 和 120 Å 的颗粒(被认为是解离的复合体)仍然存在,这妨碍了隔壁的分析。未来的挑战是建立一种样品制备方法,通过提高颗粒均匀性来实现单颗粒分析。此外,我们将开发一种新的 Ral GTPase 激活蛋白,它与 in.in 中鉴定的 Exocyst 复合物相互作用。完成体外活性测量后,我们目前正在进行细胞水平的分析。另一方面,对于Sec2,我们以3.0 Å的分辨率确定了与Sec4相互作用区域的晶体结构。Sec2的Sec4结合区域它形成了一个类似原肌球蛋白的卷曲线圈,长度为200 Å。目前,我们正在进行基于三维结构的体外功能分析。

项目成果

期刊论文数量(8)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Structural basis for lysidine formation by ATP pyrophosphatase accompanied with a lysine-specific loop and a tRNA-recognition domain.
ATP 焦磷酸酶伴随赖氨酸特异性环和 tRNA 识别域形成赖氨酸的结构基础。
Structural basis for sulfur relay to RNA mediated by heterohexametric TusBCD complex
异六角TusBCD复合物介导的硫向RNA传递的结构基础
  • DOI:
  • 发表时间:
    2005
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Numata;T.;Fukai;S.;Ikeuchi;Y.;Suzuki;T.;Nureki;O.
  • 通讯作者:
    O.
Structural basis for anticodon recognition by methionyl-tRNA synthetase
Roles of conserved amino acid sequence motifs in the SpoU (TrmH) RNA methyltransferase family
  • DOI:
    10.1074/jbc.m411209200
  • 发表时间:
    2005-03-18
  • 期刊:
  • 影响因子:
    4.8
  • 作者:
    Watanabe, K;Nureki, O;Hori, H
  • 通讯作者:
    Hori, H
{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ patent.updateTime }}

深井 周也其他文献

ユビキチン研究の新潮流:ユビキチンコードを識る・操る
泛素研究新趋势:理解和操纵泛素代码
  • DOI:
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    深井 周也;村田 茂穂;大竹 史明;Lillan Fennell;徳永 暉;沖米田 司;伊藤 拓水;内藤 幹彦 (オーガナイザー:佐伯 泰;岩井 一宏)
  • 通讯作者:
    岩井 一宏)
RalGAPの同定
RalGAP的鉴定
  • DOI:
  • 发表时间:
    2007
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Sato;Y.;Fukai;S.;Nureki;O.;佐藤裕介;深井 周也;深井周也;深井周也;白川龍太郎
  • 通讯作者:
    白川龍太郎
マグネシウム輸送体MgtEのX線結晶構造解析
镁转运蛋白 MgtE 的 X 射线晶体结构分析
  • DOI:
  • 发表时间:
    2007
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    服部 素之;田中 良樹;深井 周也;石谷 隆一郎;濡木 理
  • 通讯作者:
    濡木 理
重金属輸送体ZitBのX線結晶構造解析
重金属转运蛋白ZitB的X射线晶体结构分析
  • DOI:
  • 发表时间:
    2007
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    服部 素之;田中 良樹;深井 周也;石谷 隆一郎;濡木 理
  • 通讯作者:
    濡木 理
開口放出を制御するRabGTPase Sec4p活性化の構造的基盤
控制胞吐作用的 RabGTPase Sec4p 激活的结构基础
  • DOI:
  • 发表时间:
    2007
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Sato;Y.;Fukai;S.;Nureki;O.;佐藤裕介;深井 周也;深井周也;深井周也
  • 通讯作者:
    深井周也

深井 周也的其他文献

{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

{{ truncateString('深井 周也', 18)}}的其他基金

PTPδとIL-1受容体様タンパク質の複合体によるシナプス形成誘導の構造基盤の解明
阐明 PTPδ 和 IL-1 受体样蛋白复合物诱导突触形成的结构基础
  • 批准号:
    23K27113
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 4.16万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
PTPδとIL-1受容体様タンパク質の複合体によるシナプス形成誘導の構造基盤の解明
阐明 PTPδ 和 IL-1 受体样蛋白复合物诱导突触形成的结构基础
  • 批准号:
    23H02420
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 4.16万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
BRCC36複合体によるK63結合型ユビキチン鎖特異的切断メカニズムの解明
BRCC36 复合物对 K63 连接的泛素链特异性切割机制的阐明
  • 批准号:
    15F15386
  • 财政年份:
    2015
  • 资助金额:
    $ 4.16万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows
Exocyst複合体の再構成と構造解析
Exocyst复合体的重建和结构分析
  • 批准号:
    20051008
  • 财政年份:
    2008
  • 资助金额:
    $ 4.16万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
Yipタンパク質ファミリーの結晶構造解析
Yip蛋白家族的晶体结构分析
  • 批准号:
    19036005
  • 财政年份:
    2007
  • 资助金额:
    $ 4.16万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
開口放出で働く繋留因子Exocyst複合体の立体構造解析
在胞吐作用中发挥作用的束缚因子 Exocyst 复合物的三维结构分析
  • 批准号:
    18054009
  • 财政年份:
    2006
  • 资助金额:
    $ 4.16万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
分子シャペロンのX線結晶構造解析
分子伴侣的X射线晶体结构分析
  • 批准号:
    17028014
  • 财政年份:
    2005
  • 资助金额:
    $ 4.16万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
開口放出を制御するタンパク質複合体群の立体構造解析
控制胞吐作用的蛋白质复合物的三维结构分析
  • 批准号:
    17053007
  • 财政年份:
    2005
  • 资助金额:
    $ 4.16万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
X線結晶構造解析に基づく嗅覚・味覚・温覚レセプターの情報変換メカニズムの解明
基于X射线晶体结构分析阐明嗅觉、味觉、热感受器的信息转换机制
  • 批准号:
    17048007
  • 财政年份:
    2005
  • 资助金额:
    $ 4.16万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
高度好熱菌バリルtRNA合成酵素および基質との三重複合体のX線結晶構造解析
超嗜热菌重晶tRNA合成酶与底物三元复合物的X射线晶体结构分析
  • 批准号:
    99J10300
  • 财政年份:
    1999
  • 资助金额:
    $ 4.16万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows

相似国自然基金

酿酒酵母中ESCRT复合体在自噬前体闭合中的作用及机制研究
  • 批准号:
    31871428
  • 批准年份:
    2018
  • 资助金额:
    25.0 万元
  • 项目类别:
    面上项目
Munc18b和Munc18c调控GLUT4胞吐的机制研究
  • 批准号:
    31871425
  • 批准年份:
    2018
  • 资助金额:
    60.0 万元
  • 项目类别:
    面上项目
膜蛋白TMED10调节非经典分泌分子机制的研究
  • 批准号:
    31872832
  • 批准年份:
    2018
  • 资助金额:
    59.0 万元
  • 项目类别:
    面上项目
TBC1d23调节细胞器互作及突变引起脑桥小脑发育不全的机制研究
  • 批准号:
    91854121
  • 批准年份:
    2018
  • 资助金额:
    89.0 万元
  • 项目类别:
    重大研究计划
细胞分泌的调控及相关肠炎的机理研究
  • 批准号:
    31871429
  • 批准年份:
    2018
  • 资助金额:
    59.0 万元
  • 项目类别:
    面上项目

相似海外基金

マウス骨格筋における膜小胞輸送関連タンパク質の機能に関する形態学的解明
小鼠骨骼肌膜囊泡转运相关蛋白功能的形态学阐明
  • 批准号:
    20K19507
  • 财政年份:
    2020
  • 资助金额:
    $ 4.16万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
Mechanisms for the development of cardiac diastolic dysfunction in diabetic hearts; From the view point of Mitochondria-SR network.
糖尿病心脏舒张功能障碍的发生机制;
  • 批准号:
    19K08509
  • 财政年份:
    2019
  • 资助金额:
    $ 4.16万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
Mechanism of myokine release in response to plasma membrane disruption
响应质膜破坏的肌因子释放机制
  • 批准号:
    18K10822
  • 财政年份:
    2018
  • 资助金额:
    $ 4.16万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
Novel mechanisms of protein quality control mediated by the cooperation of ERp44 and zinc ions in the early secretory pathway
早期分泌途径中 ERp44 和锌离子合作介导的蛋白质质量控​​制新机制
  • 批准号:
    18H03978
  • 财政年份:
    2018
  • 资助金额:
    $ 4.16万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
Investigation of the therapeutics for neuropathic pain through GABAergic transmission
通过 GABA 能传递治疗神经性疼痛的研究
  • 批准号:
    17K07078
  • 财政年份:
    2017
  • 资助金额:
    $ 4.16万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
{{ showInfoDetail.title }}

作者:{{ showInfoDetail.author }}

知道了