タンパク結合プロファイルに基づいた染色体代謝ネットワークの解析

基于蛋白质结合谱的染色体代谢网络分析

• 批准号: 16013250
• 负责人: 白髭 克彦
• 金额: $ 4.48万
• 依托单位: Tokyo Institute of Technology
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
• 财政年份: 2004
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2004 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-16013250/
• 关键词: DNAチップ; 染色体動態; ゲノム解析; 動態シミュレーション

出芽酵母、および、分裂酵母の全染色体についてもChIP-chip法により染色体上のタンパクの配置を解析可能なシステムを構築した。このシステムを用い、出芽酵母染色体上での姉妹染色体分体間接着タンパク、コヒーシンの配置メカニズムの解析と、DNA二本鎖切断時に於ける配置の変化を追跡した。まず、コヒーシンが転写と排他的に染色体上で棲み分けていることを明らかにした。さらに、DNA二本鎖切断時にはダイナミックにコヒーシンが切断部位へ移動して行くことを通じ、コヒーシン複合体のDNA修復への関与を明らかにした。コヒーシンの修復機能はコヒーシンを染色体に結合させる上で必要不可欠なScc2蛋白に依存しており、二本鎖切断時にはScc2の新たな結合が、セントロメアおよび、切断部位に検出される。現在、コヒーシンのDNA切断時に於ける配置変化に必要な因子を検索中である。一方、分裂酵母染色体ではコヒーシンの配置は、必ずしも転写と排他的にはならず、その配置原理は出芽酵母と異なる。分裂酵母染色体はそのレプリコン構造に於いても、出芽酵母染色体とは異なることが示されている。現在、分配装置の配置を始め種々の染色体高次構造形成因子についての解析を通し、真核生物染色体に共通の構築原理を明らかにすると共に、この二つの酵母の染色体構造を比較することにより、大きなサイズの染色体の構築のために必要な因子とその役割について明らかにしようと考えている。

对于分裂酵母菌的整个染色体和全染色体的整个染色体，该系统可以通过Chip-Chip方法构建染色体上的染色体放置在染色体上的系统。使用该系统，跟踪了对姊妹染色体织物粘合剂蛋白的分析，发芽的酵母染色体上的粘着蛋白放置机制以及DNA双链切割中的位置变化。首先，据揭示了cohysin与转移并仅在染色体上分离。此外，当DNA双重链切割时，通过将粘着蛋白动态移至切割位点，粘蛋白复合物参与了DNA修复。 Chesin的修复功能取决于与染色体结合粘着蛋白的必需SCC2蛋白，并且在双链切割过程中在Centromere和Cutter位置检测到SCC2的新键。目前，我们正在寻找在DNA断开粘着素连接时排列更改所必需的因素。另一方面，粘着蛋白的放置不一定不受酵母染色体的转移的排他性，而放置原理与粘合酵母不同。结果表明，即使在复制子结构中，分裂酵母染色体也不同于胚芽酵母染色体。当前，通过分析分布设备的排列，各种染色体和更高的阶结构形成因素，清除了两个酵母染色体结构的比较，并比较了这两个酵母的染色体。建造大型染色体。

项目成果

RSC Nucleosome-remodeling complex plays prominent roles in transcriptional regulation throughout budding yeast gametogenesis.

RSC 核小体重塑复合物在芽殖酵母配子发生过程中的转录调控中发挥着重要作用。

• 发表时间: 2004
• 期刊: Biosci Biotechnol Biochem. 68
• 作者: H.Koyama;T.A.Nagao;T.Inai;K.Miyahara;Y.Hayasida;K.Shirahige;E.Tsuchiya
• 通讯作者: E.Tsuchiya

Reciprocal association of the budding yeast ATM-related proteins Tel1 and Mec1 with telomeres in vivo.

芽殖酵母 ATM 相关蛋白 Tel1 和 Mec1 与体内端粒的相互关联。

• 发表时间: 2004
• 期刊: Mol.Cell 14
• 作者: H.Takata;Y.Kanoh;N.Gunge;K.Shirahige;Akira Matsuura
• 通讯作者: Akira Matsuura

Cohesin relocation from sites of chromosomal loading to places of convergent transcriptions.

粘连蛋白从染色体装载位点迁移到聚合转录位点。

• 发表时间: 2004
• 期刊: Nature 430
• 作者: A.Lengronne;Y.Katou;S.Mori;S.Yokobayashi;G.Kelly;T.Itoh;Y.Watanabe;K.Shirahige^*;F.Uhlmann^* (^*equally contributed author)
• 通讯作者: F.Uhlmann^* (^*equally contributed author)