トランスクリプトーム技術を用いた肝細胞がんの早期診段開発研究

利用转录组技术开展肝细胞癌早期诊断的研究

基本信息

批准号：
14030029
负责人：
金子周一
金额：
$ 3.71万
依托单位：
Kanazawa University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份：
2002
资助国家：
日本
起止时间：
2002 至无数据
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-14030029/
关键词：
肝細胞がんトランスクリプトーム DNAチップ HCV HBV 慢性肝炎発現遺伝子

项目摘要

本研究では、前がん病変あるいは早期の肝細胞がんにおける、病理学的変化と、発現遺伝子プロファイルとの関連を明らかにし、前がん病変と肝細胞がんを鑑別する方法を確立することを目的とする。肝炎ウイルス関連の肝細胞がんおよび背景の肝硬変組織を用いて、SAGE法によるトランスクリプトーム解析を行った。これまでの正常肝臓、C型肝炎ウイルス(HCV)関連肝細胞がんに加えて、今年度はB型肝炎ウイルス(HBV)関連肝細胞がんの解析を行った。これらSAGEライブラリーはひとりの症例から得られたものであった。そこで正常肝臓、HBV, HCV関連肝細胞癌および背景肝病変についてそれぞれ複数の症例を混合し新たに5つのSAGEライブラリーを作製しトランスクリプトームプロファイルを得た。これによって作製された肝臓由来のライブラリー数は10個(全部で約50万発現遺伝子tag)となり、世界最大の系統的な肝臓発現遺伝子情報を有した。本年度の研究によって正常肝臓、慢性肝炎(HBV、HCV)、肝細胞がん(HBV、HCV)を代表する発現遺伝子プロファイルが得られた。国際的には肝がん由来培養細胞株のEST、正常肝臓のEST、正常肝臓の2つのSAGEライブラリーおよび、断片的な肝細胞がんのESTとSAGE情報がある。しかしこれらの発現遺伝子情報は、はるかに規模が小さく、臨床情報も十分でない。今回のデータベースは50万発現tagを超え、10の異なるSAGEライブラリーであり、臨床情報も揃った世界最大の肝臓発現遺伝子情報である。がん化にいたる過程におけるトランスクリプトーム情報を得ると同時に、変動する多数の遺伝子を明らかにした。またマウスを用いた実験からFasの系をブロックすることによって発がんが抑制できることを示した。

本研究旨在阐明癌前病变或早期肝细胞癌的病理变化与表达基因谱的关系，建立区分癌前病变和肝细胞癌的方法。使用与肝炎病毒相关的肝细胞癌和背景肝硬化组织进行 SAGE 方法的转录组分析。除了正常肝脏和丙型肝炎病毒（HCV）相关的肝细胞癌外，今年我们还分析了乙型肝炎病毒（HBV）相关的肝细胞癌。这些 SAGE 文库是从单个病例中获得的。因此，通过混合多个正常肝脏、HBV、HCV相关肝细胞癌和背景肝脏病变病例创建了五个新的SAGE文库，并获得了转录组谱。结果，创建的肝脏来源文库数量达到10个（总共约50万个表达基因标签），其中包含了世界上最大的系统肝脏表达基因信息。今年的研究产生了代表正常肝脏、慢性肝炎（HBV、HCV）和肝细胞癌（HBV、HCV）的表达基因谱。国际上有肝癌来源培养细胞系的EST、正常肝脏的EST、正常肝脏的两个SAGE文库以及肝细胞癌的碎片EST和SAGE信息。然而，这些表达基因的信息规模要小得多，临床信息也不足。该数据库包含超过500,000个表达标签、10个不同的SAGE库，是世界上最大的肝脏表达基因信息（包括临床信息）的集合。同时，我们获得了导致癌变过程中的转录组信息，并阐明了大量发生波动的基因。此外，小鼠实验表明，通过阻断 Fas 系统可以抑制致癌作用。