トランスクリプトーム技術を用いた肝細胞がんの早期診段開発研究

利用转录组技术开展肝细胞癌早期诊断的研究

基本信息

批准号：
14030029
负责人：
金子周一
金额：
$ 3.71万
依托单位：
Kanazawa University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份：
2002
资助国家：
日本
起止时间：
2002 至无数据
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-14030029/
关键词：
肝細胞がんトランスクリプトーム DNAチップ HCV HBV 慢性肝炎発現遺伝子

项目摘要

本研究では、前がん病変あるいは早期の肝細胞がんにおける、病理学的変化と、発現遺伝子プロファイルとの関連を明らかにし、前がん病変と肝細胞がんを鑑別する方法を確立することを目的とする。肝炎ウイルス関連の肝細胞がんおよび背景の肝硬変組織を用いて、SAGE法によるトランスクリプトーム解析を行った。これまでの正常肝臓、C型肝炎ウイルス(HCV)関連肝細胞がんに加えて、今年度はB型肝炎ウイルス(HBV)関連肝細胞がんの解析を行った。これらSAGEライブラリーはひとりの症例から得られたものであった。そこで正常肝臓、HBV, HCV関連肝細胞癌および背景肝病変についてそれぞれ複数の症例を混合し新たに5つのSAGEライブラリーを作製しトランスクリプトームプロファイルを得た。これによって作製された肝臓由来のライブラリー数は10個(全部で約50万発現遺伝子tag)となり、世界最大の系統的な肝臓発現遺伝子情報を有した。本年度の研究によって正常肝臓、慢性肝炎(HBV、HCV)、肝細胞がん(HBV、HCV)を代表する発現遺伝子プロファイルが得られた。国際的には肝がん由来培養細胞株のEST、正常肝臓のEST、正常肝臓の2つのSAGEライブラリーおよび、断片的な肝細胞がんのESTとSAGE情報がある。しかしこれらの発現遺伝子情報は、はるかに規模が小さく、臨床情報も十分でない。今回のデータベースは50万発現tagを超え、10の異なるSAGEライブラリーであり、臨床情報も揃った世界最大の肝臓発現遺伝子情報である。がん化にいたる過程におけるトランスクリプトーム情報を得ると同時に、変動する多数の遺伝子を明らかにした。またマウスを用いた実験からFasの系をブロックすることによって発がんが抑制できることを示した。

这项研究旨在阐明癌性病变或早期肝细胞癌的病理变化与表达基因谱之间的关系，并建立一种方法来区分前癌性病变和肝细胞癌。使用肝炎病毒相关的肝细胞癌和背景肝硬化组织进行转录组分析。除了正常的肝脏和丙型肝炎病毒（HCV）相关的肝细胞癌外，今年我们分析了与乙型肝炎病毒（HBV）相关的肝细胞癌。这些鼠尾草库是从单个情况下获得的。因此，准备了5个新的鼠尾草文库来通过混合正常肝脏，HBV，HCV相关的肝细胞癌和背景肝脏病变的多种病例来获得转录组轮廓。这产生了10个肝脏衍生的文库（总计约500,000个基因表达标签），并且包含世界上最大的系统表达肝脏基因信息。今年的研究提供了正常肝脏，慢性肝炎（HBV，HCV）和肝细胞癌（HBV，HCV）的代表性基因谱。在国际上，有源自肝癌的培养细胞系，正常肝脏的EST和两个正常肝脏的鼠尾草文库，以及用于碎片的肝细胞癌的EST和SAGE信息。但是，这些表达的基因信息要小得多，临床信息不足。当前的数据库包含超过500,000个表达式标签，是10个不同的鼠尾草库，并且是世界上最大的肝脏表达基因信息，并提供临床信息。在癌症发展过程中获得转录组信息的同时，我们还揭示了大量可变基因。此外，使用小鼠的实验表明，阻断FAS系统可以抑制癌变。