肝細胞におけるFunctionalGenomics解析系の確立

肝细胞功能基因组分析体系的建立

基本信息

批准号：
13470118
负责人：
金子周一
金额：
$ 3.46万
依托单位：
Kanazawa University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
财政年份：
2001
资助国家：
日本
起止时间：
2001 至 2003
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-13470118/
关键词：
肝臓慢性肝炎肝細胞癌遺伝子ゲノミクス DNAチップ

项目摘要

遺伝子技術の進歩によって、細胞あるいは臓器において発現している数万種におよぶ遺伝子を同時に包括的に解析する(Genomics)ことが可能となった。肝臓における遺伝子発現の変化は慢性肝炎や肝細胞がんだけでなく、代謝を中心とした肝臓機能の変化とも密接に関連している。本研究では各種の疾病における肝臓の構造および機能とGenomicsとの関連を明らかにするFunctional genomicsの研究開発を行った。正常肝、HBVおよびHCV感染慢性肝炎、肝硬変、肝細胞癌よりなる5種類のSAGEライブフリーを作製し、これらの発現遺伝子のデータベースを構築した。各種の病態における発現遺伝子プロファイルを明らかにし、ウイルス性の慢性肝炎では免疫関連およびストレス関連の遺伝子が亢進しているものの、肝臓機能を示す多くの遺伝子プロファイルは保たれていることを示した。また癌に至ると癌関連の遺伝子が変動するだけでなく、肝臓特有の遺伝子の多くの発現が低下してくることを明らかにした。それらの病態において発現している遺伝子の違いを示した。さらにGenBankに登録されていない多数の新規の遺伝子候補を得て、ヒトゲノム情報を用いた解析を開始した。また細胞回転、癌化、ストレスや免疫関連の遺伝子を選択したDNAチップを作製し、多数例の慢性肝炎および肝細胞癌における発現遺伝子プロファイルの解析を行った。HBVおよびHCVにおける慢性肝炎例のhierarchial clulstering解析では両者が大きく異なる発現遺伝子プロファイルを有していることを示した。また肝細胞癌の解析では、癌の分化度と一致する遺伝子群を明らかにした。これらの解析により、functional genomicsを用いて慢性肝炎および肝細胞癌の診断あるいは治療の選択に役立つ手法を確立できる可能性が示された。

遗传技术的进步使得可以全面地分析在细胞或器官（基因组学）中表达的数万个基因。肝脏中基因表达的变化不仅与慢性肝炎和肝细胞癌密切相关，而且与肝功能的变化，主要是代谢。这项研究进行了功能基因组学的研究和开发，该研究阐明了各种疾病和基因组学中肝结构与功能之间的关系。制备了五种由正常肝脏，HBV和HCV感染的慢性肝炎，肝硬化和肝细胞癌的五种类型的无活体生物，并构建了这些表达基因的数据库。我们已经揭示了在各种病理条件下表达的基因谱，并且表明，尽管在病毒慢性肝炎中增强了与免疫相关和应激相关的基因，但许多表现出肝功能的基因谱。还表明，与癌症相关的基因不仅在发生癌症时会发生变化，而且还会降低肝脏特有的许多基因的表达。显示了这些病理中表达的基因的差异。此外，获得了大量未在GenBank注册的新基因候选者，并开始使用人类基因组信息进行分析。此外，准备DNA芯片以选择与细胞旋转，癌症，胁迫和免疫相关基因相关的基因，并在许多慢性肝炎和肝细胞癌癌中分析了表达的基因谱。 HBV和HCV中慢性肝炎病例的层次结构分析表明，两者都具有非常不同的表达基因谱。此外，肝细胞癌分析揭示了一组与癌症分化水平相匹配的基因。这些分析表明，功能基因组学可用于建立可用于诊断或选择慢性肝炎和肝细胞癌治疗的技术。