新しいGC配列特異的DNA結合分子の開発と金属イオンによる結合の制御

开发新的 GC 序列特异性 DNA 结合分子并控制金属离子的结合

• 批准号: 09235227
• 负责人: 佐々木 茂貴
• 金额: $ 1.22万
• 依托单位: Kyushu University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
• 财政年份: 1997
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 1997 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-09235227/
• 关键词: DNA結合分子; ジアミノビステトラヒドロフラン; ジアミノフラン; DNA配列特異的結合; 認識分子; 遺伝子発現制御; 金属錯体

平成9年度はdiaminoBis-THF化合物(2)のアミノ基の立体化学が(R,R),(S,S)のものを選択的に合成した。また、diamino-bisfuran化合物(3)はアミノ基の立体化学は混合物としてアルキル鎖の長さの異なるリガンドを合成した。このように合成したリガンドdiaminoBis-THF(2)およびdiamino-bisfuran化合物(3)とDNAとの相互作用を数種類の2本鎖DNAを用いて測定した結果、以下のことが明らかになった。1)(R,R)-2はGC-richの2本鎖DNAを選択的に安定化し、C-G:C-rich3本鎖DNAも安定化した。2)(R,R)-2とGCrichなDNAとの結合はNaCl緩衝液中よりKCl緩衝液中の方が速やかに起こった。3)立体異性体の(S,S)-2はこのような安定化効果は全く見られず、配位子の立体化学がDNA認識に重要であることが示された。4)(R,R)-2はGC-richな2本鎖DNAとの相互作用によって大きな構造変化を引き起こした。5)diamino-bisfuran化合物(3)では選択性の転換が行われ、AT配列選択的な2本鎖DNAの安定化を示した。6)短いアルキル鎖を持つdiamino-bisfuran化合物(3)は全く2本鎖DNAを安定せず、DNA結合における長鎖アルキル基の重要性が示された。以上のように、類似する骨格のdiaminobis-THF(2)およびdiamino-bisfuran化合物(3)が全く異なる配列選択性を持ち、それぞれ選択的にGC-richDNAおよびAT-richDNAを認識できることが明らかになった。これらの部分は遺伝子発現制御で重要な配列によく見られることから、遺伝子発現の阻害を行う分子としての展開が期待される。

1997年，二维化合物（2）的氨基（2）的三维化学选择性合成（R，R），（S，S）。在Diamino-Bisfuran化合物（3）中，氨基组的三维化学是具有不同烷基链作为混合物的配体的混合物。由于测量了二敏倍数（2）与二氨基 - 野氨基化合物（3）和以这种方式合成的DNA之间的相互作用，因此揭示了以下内容。 1）（r，r）-2选择性地稳定了富含GC的两链DNA，并且C-G：C-Rich3链DNA也已稳定。 2）（R，R）-2和GCRICH DNA迅速发生在KCL缓冲液中，而不是在NACL缓冲液中。 3）三维反对（S，S）-2没有这种稳定的效果，表明配体的三维化学对于DNA识别很重要。 4）（r，r）-2通过与富含GC的两链DNA相互作用引起重大的结构变化。 5）Diamino-bisfuran化合物（3）显示出选择性的变化，表明具有选择AT序列的两链DNA的稳定。 6）具有短烷基链的Diamino-Bisfuran化合物（3）根本没有稳定两链DNA，表明长链烷基在DNA键合中的重要性。如上所述，据表明，相似的骨骼二肌thf（2）和二氨基 - 纤维素化合物（3）具有完全不同的序列选择，并且可以选择性地识别用于GC-RichDNA和RICHDNA。由于这些部分通常在基因表达控制中的重要阵列中看到，因此预计它们将作为抑制基因的分子发展。

项目成果

Nagatsugi,Fumi: "2-Aminopurine Derivatives with C6-Substi tuted Olefin as Novel Cross-Linkig Agents and the Synthesis of the Corresponding b-Phosphoramidite Precursors" Tetrahedron. 53(9). 3035-3044 (1997)

Nagatsugi,Fumi：“C6-取代烯烃的 2-氨基嘌呤衍生物作为新型交联剂以及相应的 b-亚磷酰胺前体的合成”四面体。

Sasaki,Shigeki: "In Vitro Antitumor Activities of New Synthetic Bistetrahydrofuran Derivatiaves as Analogs of Annonaceous Acetogenins" Chem.Pham.Bull. 46(1). 154-158 (1998)

Sasaki，Shigeki：“新型合成双四氢呋喃衍生物作为番荔枝苷类似物的体外抗肿瘤活性”Chem.Pham.Bull。

Nagatsugi,Fumi: "Novel Cross-Linking Reaction of Oligonuceotides Incorporation New Base Analogs with Selective Reactivity towad Cytidine" Nucleic Acids,Symp.Ser.37. 67-68 (1997)

Nagatsugi，Fumi：“寡核苷酸掺入新碱类似物的新型交联反应，对胞苷具有选择性反应性”核酸，Symp.Ser.37。

Nakashima,Shouji: "Synthesis and Evaluation of Oligonucleotides Incorporationg Novel Artificial Nucleobases for the Selective Formation of Non-Natural Type Triplexes" Nucleic Acids,Symp.Ser.37. 33-34 (1997)

Nakashima，Shouji：“用于选择性形成非天然型三链体的新型人工核碱基寡核苷酸的合成和评估”核酸，Symp.Ser.37。