Study to develop novel genomic drugs by using superfunctional oligonucleotide analogues

利用超功能寡核苷酸类似物开发新型基因组药物的研究

基本信息

  • 批准号:
    12557201
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 7.81万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
  • 财政年份:
    2000
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    2000 至 2002
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

Antisense and antigene strategies are new methodology for genomic drugs discovery. An antisense oligonucleotide hybridizes with a target mRNA and inhibits gene expression sequence-selectively in a living cell. On the other hand, an antigene oligonucleotide (triplex-forming oligonucleotides, TFOs) binds with genomic dsDNA to result in gene expression control. We previously developed various kinds of conformationally locked nucleic acids (Bridged Nucleic Aclds, BNAs). Ologonucleotides modified with BNA monomers were widely used to evaluate physical and biological properties. These results are summarized below.1) TFOs containing the 2',4'-BNA monomers were found to stabilize significantly triplex formation with the homopurine-homopyrimidine dsDNA target under near physiological conditions.2) Efficient synthetic routes for the 2',4'-BNA monomers bearing unnatural nucleobases wore developed.3) There is no natural nucleoside to recognize a CG base pair, and this psoes a serious problem in antigene strategy. A novel nucleoside analogue, 2',4'-BNA with a 2-pyridone base-unit was designed, synthesized and proved to be excellent for recognition of a CG base pair.4) Another modification was made on a phosphodiester linkage or the sugar moiety of the 2',4'-BNA oligonucleotide. The newly modified oligonucleotides showed high binding affinity with dsDNA or ssRNA target. Excellent enzymatic stability of these oligonucleotide analogues was also observed.5) Antisense 2',4'-BNA oligonucleotides inhibited expression of the target gene in living cell with high sequence-selectivity and non-cytotxicity.
反义和抗基因策略是基因组药物发现的新方法。反义寡核苷酸与靶mRNA杂交,并在活细胞中抑制基因表达序列。另一方面,抗基因寡核苷酸(三核苷酸,TFOS)与基因组DSDNA结合,从而导致基因表达控制。我们以前开发了各种构象锁定的核酸(桥接核ACLD,BNA)。用BNA单体修饰的遗传核苷酸被广泛用于评估物理和生物学特性。在下面总结了这些结果。1)含有2'BNA单体的TFO,发现与同孕胺甲酰胺丁烷dsDNA靶标显着稳定,在接近生理条件下均具有三酰胺的合成途径。 PSOE在抗固国策略中是一个严重的问题。设计,合成并证明具有2-吡啶酮基单元的2',4'-BNA,具有2-吡啶酮碱基单位。新修饰的寡核苷酸与dsDNA或ssRNA靶标的高结合亲和力。还观察到了这些寡核苷酸类似物的出色酶促稳定性。5)反义2',4'-BNA寡核苷酸抑制了靶基因在活细胞中具有较高序列序列和非胞毒性的活细胞中的表达。

项目成果

期刊论文数量(188)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
H. Torigoe, S. Obika and T. Imanishi: "Promotion of triplex formation by a fixed N-form sugar puckering: Thermodynamic and kinetic studies"Nucleic Acids Symp. Ser.. 44. 241-242 (2000)
H. Torigoe、S. Obika 和 T. Imanishi:“固定 N 型糖褶皱促进三链体形成:热力学和动力学研究”核酸症状。
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  • 发表时间:
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  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
S. Obika, Y. Hari, T. Sugimoto, M. Sekiguchi and T. Imanishi: "Triplex-forming enhancement with high sequence selectivity by single 2'-O,4'-C-methylene bridged nucleic acid (2',4'-BNA) modification"Tetrahedron Lett.. 41-46. 8923-8927 (2000)
S. Obika、Y. Hari、T. Sugimoto、M. Sekiguchi 和 T. Imanishi:“通过单个 2-O,4-C-亚甲基桥接核酸 (2,4
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    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
Obika, S., Hari, Y., Sugimoto, T., Sekiguchi, M., Imanishi, T.: "Triplex-forming enhancement with high sequence selectivity by single 2'-O,4'-C-methylene bridged nucleic acid (2',4'-BNA) modification"Tetrahedron Lett.. 41. 8923-8927 (2000)
Obika, S.、Hari, Y.、Sugimoto, T.、Sekiguchi, M.、Imanishi, T.:“单 2-O,4-C-亚甲基桥核酸具有高序列选择性的三链体形成增强作用
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    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
Uchida, M., Hino, N., Yamanaka, T., Hukushima, H., Imanishi, T., uchiyama, Y., Kodama, T., Doi, T.: "Hepatitis C virus core protein binds to a C-terminal region of NS5B RNA polymerase"Hepatology Res.. 22. 297-306 (2002)
Uchida, M.、Hino, N.、Yamanaka, T.、Hukushima, H.、Imanishi, T.、uchiyama, Y.、Kodama, T.、Doi, T.:“丙型肝炎病毒核心蛋白与 C
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  • 作者:
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Yamanaka, T., Uchida, M., Doi, T.: "Innate form of HCV core protein plays an important role in the localization and the function of HCV core protein"Biochem.Biophys.Res.Commun.. 294. 521-527 (2002)
Yamanaka, T.、Uchida, M.、Doi, T.:“HCV 核心蛋白的天然形式在 HCV 核心蛋白的定位和功能中发挥着重要作用”Biochem.Biophys.Res.Commun. 294. 521-
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