海洋微生物の多様性と物質循環フラックスに関する基礎的研究

海洋微生物多样性与物质循环通量基础研究

基本信息

批准号：
14656077
负责人：
浜崎恒二
金额：
$ 2.18万
依托单位：
Hiroshima University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Exploratory Research
财政年份：
2002
资助国家：
日本
起止时间：
2002 至 2003
项目状态：
已结题

项目摘要

(1)Single-cell BrdU法-特異的プローブとの併用:広島湾より約30種類の海洋細菌を分離し、16S rRNA塩基配列による系統解析を行った。この培養株を用いて、海洋の主要系統群に対するFISH法及びBrdU免疫染色法を行い、特異性の検討と条件設定を行った。(2)BrdU/DGGE法による活性細菌群集の解析:瀬戸内海及び、西部北太平洋(東大海洋研究所共同研究)、サロマ湖(北大低温科学研究所共同研究)を実施し、活性細菌群の時空間変動をモニタリングするための試料を採取した。瀬戸内海において常に出現する細菌種、適当な条件下で出現する細菌種等を特定し、特異的なプローブをデザインした。(3)Single-cel BrdU法によるモニタリング:天然海水にBrdUを加えて培養し、FISHプローブを用いて、活発に増殖する細菌種の生物量、増殖速度を測定する実験を行った。同時に、全BrdU取り込み量を免疫学的に測定し、群集増殖速度を推定するための実験も行った。東大海洋研究所白鳳丸のRI施設を用いて、BrdU法と従来の放射性チミジンを用いる海洋細菌生産量測定法との比較データを集めた。本研究の成果は、国内外の学会発表3件や招待講演2件として公開され(第6回国際バイオテクノロジー会議2003年9月、第19回日本微生物生態学会2003年10月、日仏ワークショップ招待講演2003年11月、第6回VNC研究会招待講演2004年2月、第10回国際微生物生態学会2004年8月)、解説一報、原著論文一報にまとめられた。

（1）与特定探针结合的单细胞BRDU方法：分离了广岛湾的大约30种海洋细菌，并进行了16S rRNA碱基序列的系统分析。使用这种培养物库存，对主要海洋群体进行了鱼类方法和BRDU免疫染色方法，并检查了特异性和条件。（2）通过BRDU/DGGE方法对活动细菌组进行分析：Seto Inland Sea和Western North Pacific（东海洋研究所的联合研究）和Saloma湖（北海道大学低温科学的联合研究）和AT活性细菌的时间。已经鉴定出在适当条件下出现的细菌物种总是出现在Seto内陆海洋中的细菌种类，并且已经设计了特定的探针。（3）通过单核BRDU方法进行监测：通过将BRDU添加到天然海水中，进行了一个实验，以使用鱼类探针来测量细菌种类的细菌种类和增殖速度。同时，进行了实验，以测量所有BRDU的量，以免疫学捕获并估计间隙速度。使用Hakuho Maru Maru Maru的RI设施，收集了BRDU方法与海洋细菌生产测量方法之间使用常规放射性嵌合的比较数据。这项研究的结果发表在日本和海外的3个演讲，以及2次受邀讲座（2003年9月的第六届国际生物技术会议，日本微生物经济学会第19个日本微生物经济学会，日本法国法国研讨会于2003年11月邀请讲座，第六届VNC。研究小组邀请讲座2004年2月，2004年8月第10届国际微生物经济学会），一份评论和最初的论文之一。