クリックケミストリーを応用した2本鎖DNA結合分子の新規検索法の開発

利用点击化学开发双链 DNA 结合分子的新搜索方法

基本信息

批准号：
19659001
负责人：
永次史
金额：
$ 2.11万
依托单位：
Tohoku University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Exploratory Research
财政年份：
2007
资助国家：
日本
起止时间：
2007 至 2008
项目状态：
已结题

项目摘要

遺伝子の根幹である2本鎖DNAを認識する分子は生命の基本原理を理解するためのツールとしてだけではなく、遺伝子発現の選択的な制御によるくすりとしての開発も期待されるため、2本鎖DNAの配列情報に基づく一般的なルールの確立に関する研究が多くなされてきた。しかしそのルールの確立にはまだ至っていないのが現状である。さらに研究が進むにつれ、DNAの高次構造が遺伝子発現制御機構に重要な役割を果たしている可能性が次々と示されているが、DNA高次構造の認識分子を論理的に分子設計するのは非常に困難であると考えられる。そこで本研究では、クリックケミストリーを応用したコンビナトリアル化学を用いて、2本鎖DNA認識分子の新しい検索法の開発を検討することとした。昨年度までにインターカレーターであるアクリジン誘導体及び2本鎖DNAに結合することがしられているペプチドを用いて、2本鎖DNAをテンプレートとした、クリックケミストリー反応が進行することを明らかにした。本年度はまず得られたペプチド結合型アクリジン誘導体についてそのDNAに対する結合能の評価を行なった。その結果、得られたペプチド結合型アクリジン誘導体は、ペプチドのみに比べてDNAに対する結合能が向上すること、さらにアクリジンのみに比べても若干ではあるが結合能が上がることがわかった。また固相上に固定化した末端アルキンを導入したペプチドとアクリジン誘導体の間でもクリックケミストリー反応が進行し、ビーズが蛍光を持つことが示された。この蛍光はDNA結合性ペプチドをもたないビーズとアクリジン誘導体の間では観測されないことから、ペプチドを結合させたビーズとアクリジンを用いたランダムスクリーニングによるDNA結合分子の検索法として展開できる可能性を示すことができた。

识别双链DNA的分子，即基因的根，不仅是理解基本生命原理的工具，而且还可以通过选择性控制基因表达来作为药物开发为药物，因此已经对基于双链DNA的序列信息进行了许多关于一般规则的研究。但是，目前的情况是尚未制定规则。随着进一步的研究的进行，据表明，高阶DNA结构在基因表达调节机制中可能起重要作用，但是人们认为，在逻辑上设计DNA结构的分子将非常困难。因此，在这项研究中，我们决定使用使用点击化学的组合化学反应来开发一种新的搜索方法，用于双链DNA识别分子。据揭示，使用双链DNA作为模板的单击化学反应，使用aCRIDINE衍生物，这些敏捷衍生物是介导剂，并且已被鉴定为与双链DNA结合到去年的肽。今年，首先评估了肽键入的邻胺衍生物的结合能力的DNA。结果，发现所获得的肽键入的邻氨酸衍生物与单独的肽相比提高了DNA的结合能力，并且它具有单独的Acridine的结合能力。此外，单击化学反应在固定相和脆皮衍生物上固定的末端藻类的肽之间进行了进展，表明珠子具有荧光。由于在没有DNA结合肽和杂氨酸衍生物的珠子之间未观察到这种荧光，因此已证明可以通过使用已与肽和ac缩ac的珠子结合的珠子进行随机筛选来作为DNA结合分子的搜索方法开发。

项目成果

期刊论文数量（46）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

DNAの構造制御を目指した分子モーター導入オリゴDNAの合成とその機能評価

分子马达引入的寡聚DNA的合成及其功能评估

DOI：
发表时间：
2008
期刊：
影响因子：
0
作者：
小林麻衣子;永谷直人;桑原俊介;永次史
通讯作者：
永次史

Synthesis of the new nucleoside analogue connecting 2-amino-6-vinylpurine to the 2'-deoxyribose skeleton via the methylene linker

通过亚甲基接头将 2-氨基-6-乙烯基嘌呤连接至 2-脱氧核糖骨架的新型核苷类似物的合成

DOI：
发表时间：
2008
期刊：
影响因子：
0
作者：
Kurose Y.;Taniguchi Y.;Nagatsugi F.;Sasaki S
通讯作者：
Sasaki S

Efficient Synthesis of 6-Substituted Purine Derivatives Using Pd-Catalyzed Cross-Coupling Reactions with 2'-Deoxyguanosine O^6-Tosylate

利用 Pd 催化与 2-脱氧鸟苷 O^6-甲苯磺酸盐的交叉偶联反应高效合成 6-取代嘌呤衍生物

DOI：
发表时间：
2007
期刊：
Heterocycles 73
影响因子：
0
作者：
Sato;S.;et al.;Tomonori Mori;Takahiro Ichige;Masahito Watanabe;Tomonori Mori;Takahiro Ichige;Masaya Nakata;Nagatsugi F.
通讯作者：
Nagatsugi F.

Synthesis and Evaluation of the Luciferase-Oligodeoxynucleotide for the Sequences-Selective Detection of Nucleic Acids

用于核酸序列选择性检测的荧光素酶寡脱氧核苷酸的合成和评价