中生動物の小環状ミトコンドリアDNAによる分子系統位置と暗号進化に関する研究

利用中生动物小环状线粒体DNA研究分子系统发育位置和密码进化

基本信息

  • 批准号:
    09740637
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 1.28万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
  • 财政年份:
    1997
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    1997 至 1998
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

中生動物の二胚虫類は、その体制の単純さから原生動物と後生動物の中間に位置する生物と考えられているが、一方で扁形動物の吸虫類が退化した生物とする仮説もある。本研究ではミトコンドリアの遺伝暗号とゲノム変異圧のパターンから二胚虫類の系統位置の推定を試みている。前年度までにミサキニハイチュウのミトコンドリアCO1,CO2遺伝子は、それぞれ単独で1.7kb,1.6kbのミニサークルDNA上にコードされていることが分かっていたが、本年度の研究により、さらにCO3,ND1,ND2,LrRNA遺伝子が、それぞれ単独で0.7kb〜1.8kbのミニサークルDNA上にコードされていることが明らかになった。また、CO2ミニサークルの非コード領域に2種類のtRNA遺伝子(Arg,Gly)を見いだした。通常、後生動物のミトコンドリアDNAは14〜16kbの大きな環状DNA上に複数の遺伝子が並んでコードされている。二胚虫のように遺伝子が1つ1つ分断されている例は報告されておらず新発見となった。また、得られた塩基配列から二胚虫ミトコンドリアの全遺伝暗号を明らかにした。ミトコンドリアの変則暗号は系統樹のどこで生じたかが分かっているので、門レベルの系統位置を決める良い指標になる。原生動物から後生動物が出現する際に、AUA及びAGRコドンで暗号変化が起っている。また、扁形動物の枝で独自にUAA,AAAコドンが変化している。さらに扁形動物のプラナリアを調べ(発表論文)これを確かめた。本研究で調べた二胚虫の遺伝暗号は扁形動物のものではなかった。これらより二胚虫類は扁形動物の退化生物でなく、より原生動物に近い原始的な多細胞動物であると考えられる。CO2ミニサークルの2つのtRNA遺伝子は暗号変化を起こしたコドンのtRNAではなかったが、さらに解析を進めて次年度は系統位置決定の手がかりとなるtRNA遺伝子を探す。
由于系统的简单性,中生代的生物胚种被认为是位于原生动物和后生动物之间的某个地方的生物,但也有一个假设是扁虫是变性的生物。这项研究试图从线粒体遗传密码和基因组突变压力模式中估算两个胚胎爬行动物的系统发育位置。到上一年,已知Misakini hach​​imea的线粒体CO1和CO2基因分别在1.7 kb和1.6 kb的微量圆形DNA上编码,但今年的研究表明,CO3,ND1,ND2,ND2和LRRNA基因在0.7 kb of 0.7 kb of 0.7 kb ordna con con sodister con sodirty consed con conse contery con。另外,在二氧化碳的非编码区域中发现了两种类型的tRNA基因(arg,gly)。通常,后生动物中的线粒体DNA由多个基因并排编码在14-16 kb的大圆形DNA上。尚未发现尚未发现基因的病例除以一个胚胎。此外,从获得的碱基序列中揭示了两个胚胎线粒体的整个遗传密码。线粒体异常代码已知在系统发育树中的位置,使其成为系统发育定位的良好指标。当后生动物从原生动物出现时,AUA和AGR密码子上的代码更改发生。此外,UAA和AAA密码子在扁虫的分支中独立变化。此外,我们研究了扁虫(发表论文)中的Planaria,以确认这一点。这项研究中检查的两个胚胎的遗传代码不是扁虫的遗传代码。这些表明,生物晶爬行动物不是扁虫的变性生物,而是靠近原生动物的原始多细胞动物。二氧化碳小路中的两个tRNA基因不是经历了代码变化的密码子的tRNA,但是将进一步进行分析,明年我们将寻找将作为系统发育定位的线索的TRNA基因。

项目成果

期刊论文数量(2)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Bessho Y: "Planarian mitochondria sequence heterogeneity" Molecular Ecology. 6・2. 129-136 (1997)
Bessho Y:“涡虫线粒体序列异质性”分子生态学 6・2(1997)。
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ patent.updateTime }}

別所 義隆其他文献

Crystal structure and mutational study of a unique SpoU family archaeal methylase that forms 2'-O-methvlcytidine at position56 of tRNA
在 tRNA 56 位形成 2-O-甲基胞苷的独特 SpoU 家族古菌甲基化酶的晶体结构和突变研究
細胞変形動態の数理モデリング
细胞变形动力学的数学建模
  • DOI:
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    西野 吉則;鈴木 明大;新井田 雅学;別所 義隆;城地 保昌;斉藤稔
  • 通讯作者:
    斉藤稔
Verification of RNA-directed transcriptional silencing (RdTS) in human cells
人类细胞中 RNA 指导的转录沉默 (RdTS) 的验证
  • DOI:
  • 发表时间:
    2007
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    倉谷 光央;吉川 由香;別所 義隆;東島 今日子;石井 健;柴田 理恵;高橋 征三;油谷 克英;横山 茂之;倉谷光央;Takeshi Haraguchi;Nobutake Yamamichi;Takeshi Haraguchi;Shuji Fujita;原口 健;原口 健
  • 通讯作者:
    原口 健
多様な溶液内生物試料イメージングに向けたパルス状コヒーレント X 線溶液散乱法の高度化
脉冲相干X射线溶液散射方法对溶液中多种生物样品成像的进展
  • DOI:
  • 发表时间:
    2015
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    佐々木 智也;木村 隆志;城地 保昌;別所 義隆;西野 吉則
  • 通讯作者:
    西野 吉則
Structural basis of the initial binding of tRNA^<ne> lysidine synthetase TilS with ATP and L-lysine
tRNA^<ne>赖氨酸合成酶 TilS 与 ATP 和 L-赖氨酸初始结合的结构基础
  • DOI:
  • 发表时间:
    2007
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    倉谷 光央;吉川 由香;別所 義隆;東島 今日子;石井 健;柴田 理恵;高橋 征三;油谷 克英;横山 茂之
  • 通讯作者:
    横山 茂之

別所 義隆的其他文献

{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

{{ truncateString('別所 義隆', 18)}}的其他基金

Time-resolved XFEL crystallography for DNA photolyase
DNA 光裂合酶的时间分辨 XFEL 晶体学
  • 批准号:
    21K06042
  • 财政年份:
    2021
  • 资助金额:
    $ 1.28万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
ミトコンドリアの遺伝暗号とゲノム変異圧による中生動物の系統的位置の解析
基于线粒体遗传密码和基因组突变压力的中生动物系统发育位置分析
  • 批准号:
    08740666
  • 财政年份:
    1996
  • 资助金额:
    $ 1.28万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
二胚虫ミトコンドリアDNAによる中生動物の系統的位置と遺伝暗号の解析
利用间胚动物线粒体 DNA 分析中生动物的系统发育位置和遗传密码
  • 批准号:
    07740659
  • 财政年份:
    1995
  • 资助金额:
    $ 1.28万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
プラナリアのミトコンドリアDNAによる遺伝暗号の進化とゲノムの多型現象の解析
使用涡虫线粒体 DNA 分析遗传密码进化和基因组多态性
  • 批准号:
    05740454
  • 财政年份:
    1993
  • 资助金额:
    $ 1.28万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)

相似海外基金

Convergent evolution in morphological characters of dicyemids
双酶类形态特征的趋同进化
  • 批准号:
    26440216
  • 财政年份:
    2014
  • 资助金额:
    $ 1.28万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
ミトコンドリアの遺伝暗号とゲノム変異圧による中生動物の系統的位置の解析
基于线粒体遗传密码和基因组突变压力的中生动物系统发育位置分析
  • 批准号:
    08740666
  • 财政年份:
    1996
  • 资助金额:
    $ 1.28万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
二胚虫ミトコンドリアDNAによる中生動物の系統的位置と遺伝暗号の解析
利用间胚动物线粒体 DNA 分析中生动物的系统发育位置和遗传密码
  • 批准号:
    07740659
  • 财政年份:
    1995
  • 资助金额:
    $ 1.28万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
{{ showInfoDetail.title }}

作者:{{ showInfoDetail.author }}

知道了