Identification of immunotherapy-resistant biomarkers in head and neck cancer

头颈癌免疫治疗耐药生物标志物的鉴定

• 批准号: 22K16927
• 负责人: 三澤 由幾
• 金额: $ 3万
• 依托单位: Hamamatsu University School of Medicine
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
• 财政年份: 2022
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2022-04-01 至 2024-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-22K16927/
• 关键词: リキッドバイオプシー; 免疫チェックポイント阻害薬; 薬剤耐性; LY6D遺伝子; セルフリーDNA

癌細胞の不均一性獲得は、エピゲノムによる可塑性に起因するとされている。薬剤耐性や効果予測などに関与し治療過程で変化する癌の不均一性・可塑性の解明には、原発腫瘍からの遺伝子情報よりもリキッドバイオプシーからの遺伝子情報が有利である。我々研究グループは、cfDNAを使ったDNAメチル化解析でいくつかの新規性のある報告を行った。HPV関連中咽頭癌の研究では、細胞株、臨床検体からの網羅的DNAメチル化解析にて抽出したメチル化マーカー候補の21遺伝子から、喉頭、口腔、下咽頭、中咽頭の250サンプルのDNAメチル化解析で中咽頭のみに予後と関連した10遺伝子を抽出し、さらに正常コントロールのリキッドバイオプシーでもメチル化を認める7遺伝子を除外して、CALML5、DNAJC5G、LY6Dの3遺伝子が、HPV関連中咽頭癌における有効なメチル化マーカーでcfDNAからLY6D遺伝子のメチル化が消失（脱メチル化）するという、予想とは異なる現象で、ICI抵抗性を予測するバイオマーカーになると考えられた。本研究では、最近可能になったcfDNAの網羅的メチル化解析法を使って、ICI抵抗性を引き起こす脱メチル化遺伝子の抽出を行い、ICI抵抗性に関与し治療過程で変化する癌の不均一性・可塑性の解明とICI抵抗性を克服する治療法の探索を目指す。2023年度は、HPV関連中咽頭癌細胞株UMSCC47を使って、LY6D遺伝子をsiRNAでノックダウンした後、コロニー数、浸潤能の変化を測定ついて解析を行った。また、LY6D蛋白の免疫染色をHPV関連中咽頭癌ならびにICI治療を行った頭頸部癌症例に行い解析を行った。現在、これらの解析の評価を行っている。

据信，癌细胞中异质性的获取是由表观基因组的可塑性引起的。从原发性肿瘤的遗传信息中，来自液体活检的遗传信息是有利的，以阐明参与耐药性以及预测治疗过程中疗效和变化的癌症的异质性和可塑性。我们的研究小组使用CFDNA进行了一些有关DNA甲基化分析的新报告。在与HPV相关的口咽癌的研究中，从21个基因中提取了10个与预后相关的基因，是从21个候选甲基化标记的基因中提取的，这些基因从细胞系中提取的候选甲基化标志物和从DNA甲基化分析中提取的250个喉，口腔蛀牙，性咽nx和7个基因的DNA甲基化分析，以及三种基因，以及三种基因，是甲基菌株，以及三种基因，并在正常中，正常且含量为正常，是正常的，是正常的， Calml5，DNAJC5G和LY6D被认为是预测ICI耐药性的生物标志物，这是一种与预期的现象不同，其中Ly6d基因的甲基化标志物从CFDNA中消失了（脱甲基化），作为与HPV相关的类口荷马乳糖癌中有效的甲基化标记。这项研究旨在提取脱甲基化的基因，使用最近进行的全面的甲基化分析方法引起ICI耐药性，并阐明参与ICI耐药性和治疗过程中涉及的癌症的异质性和可塑性，并探索克服ICI耐药性的治疗方法。在2023财年，使用与HPV相关的口咽癌细胞系UMSCC47击倒LY6D基因后，通过测量菌落计数和侵入性能力的变化来进行分析。另外，对LY6D蛋白的免疫染色是在与HPV相关的口咽癌以及用ICI治疗的头颈癌病例上进行的。目前，正在评估这些分析。

项目成果

Novel prognostic value and potential utility of opioid receptor gene methylation in liquid biopsy for oral cavity cancer

• DOI: 10.1016/j.currproblcancer.2021.100834
• 发表时间: 2022-03-17
• 期刊: CURRENT PROBLEMS IN CANCER
• 影响因子: 2.6
• 作者: Ishikawa, Ryuji;Imai, Atsushi;Misawa, Kiyoshi
• 通讯作者: Misawa, Kiyoshi