大腸癌における静止期癌幹細胞および共局在細胞の解析

结直肠癌中固定癌症干细胞和共定位细胞的分析

• 批准号: 22K16487
• 负责人: 廣瀬 遥香
• 金额: $ 2.91万
• 依托单位: Nagoya University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
• 财政年份: 2022
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2022-04-01 至 2024-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-22K16487/
• 关键词: オミクス解析; 細胞周期

本研究では、大腸癌幹細胞維持機構における静止期幹細胞の性質と果たす役割をインフォマティクスの手法も交えて明らかにすること で、幹細胞を標的とした新規治療戦略の開発を目的としている。ヒト骨肉腫細胞株を用いた事前検討で、細胞周期から外れた細胞集団が観察された。これらの集団に特異的な発現変動遺伝子(DEG)は十分に存在するにも関わらず、共通する pathwayが検出されなかった。これは、この集団が積極的にquiescentにとどまる細胞や老化細胞といった性質の違う細胞の集合であるためと考えられる。本年度はこの検証のため、これはアゾキシメタン/デキストラン硫酸ナトリウムにより大腸に作製した腫瘍部と正常部のシングルセルRNAseq公開データセットを取得し、解析に用いた。本研究課題では、正常部と腫瘍部を比較する事でこのquiescentな亜集団に特異的に発現する遺伝子群をsignatureとして抽出した。また、幹細胞の周囲には幹細胞を支えるニッチと呼ばれる細胞や因子が、空間的に近接して存在すると考えられている。 そこで本研究課題ではsingle cell RNAseqのデータに加えて、空間的トランスクリプトームの公開データを取得し解析することで、上記quiescentな細胞集団の腫瘍組織上での局在の様子を推定した。より高精度な解析実現のため最先端の空間オミクス解析技術を習得した。並行して、空間的に近接する細胞同士の相互作用に関わる分子候補の抽出を行っているところである。

这项研究旨在通过阐明固定干细胞在结肠癌干细胞维持机理中的特性和作用（包括信息学技术）中的特性和作用来制定针对干细胞的新型治疗策略。在使用人骨肉瘤细胞系的初步研究中，观察到超出细胞周期的细胞群。尽管这些人群特有的表达变量基因（DEG）存在充足，但未检测到共同的途径。这被认为是因为该人群是不同特性的细胞的集合，例如积极保留在静态或衰老细胞中的细胞。在今年的验证中，我们使用了甲氧基甲烷/葡萄糖硫酸钠，获得了在大肠中产生的单细胞RNASEQ发布的肿瘤和正常肿瘤数据集，并用于分析。在本研究主题中，我们比较了正常和肿瘤区域，并提取了在这种静止亚群中特异性表达的基因组。还认为，在干细胞周围的空间接近性中存在支持干细胞的细胞和称为壁ches的因素。因此，在本研究主题中，除了单细胞RNASEQ数据外，我们还从空间转录组中获得并分析了已发布的数据，并估计了静态细胞群在肿瘤组织上的定位。他已经获得了尖端的空间法分析技术，以实现更高的准确性分析。同时，我们目前正在提取参与空间相邻细胞之间相互作用的分子候选者。