MALDI-TOF MS(質量分析器)による黒色真菌迅速同定

使用MALDI-TOF MS（质谱仪）快速鉴定黑真菌

• 批准号: 22K16271
• 负责人: 二ッ谷 剛俊
• 金额: $ 1.08万
• 依托单位: Kanazawa Medical University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
• 财政年份: 2022
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2022-04-01 至 2024-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-22K16271/
• 关键词: MALDI-TOF MS; 黒色真菌; Exophiala; 質量分析

黒色真菌症は稀であるが、皮膚のみでなく全身に播種し致死的であることから発展途上国を中心に世界中で問題となっている。黒色真菌症は菌種により治療法が異なり迅速に菌種を同定することが重要であるが、菌種同定は専門性が高く、時間を要する点が問題であった。質量分析器（MALDI-TOF MS）を用いた菌種同定法は迅速・簡便であり、すでに細菌同定に実用化されている。本研究は、MALDI-TOF MSを用いて黒色真菌の迅速同定を確立するものである。黒色真菌症の中でも頻度の高いExophiala属を対象としてMALDI-TOF MSの有用性を検討した。現在販売されているライブラリ(データベース)には黒色真菌の登録がほぼない状態であることから、基準となる菌株を登録しin-houseライブラリを作成した。検査の前処理法としては、現在使用されているMALDI-TOF MSで糸状菌同定する際の前処理方法は繁雑で時間を要することから、斜面培地で造成したコロニーを直接利用する前処理法と、コロニーを触接検査する最も迅速な方法を比較検討した。従来の方法と比較し、検査結果のスコアは前者の方が後者に比べて従来法との差が少なく、実臨床に適していると考えた。この前処理法を使用して、当施設に同定依頼となったExophiala属をMALDI-TOF MSで検査を行った。照合するデータベースは従来のライブラリに加え、上記の新たに登録したin-houseライブラリを使用した。結果として、30/31株で最もスコアの高い菌種は遺伝子同定の菌種と一致した。MALDI-TOF MSのライブラリの充実と前処理法の工夫により、Exophiala属については同定が可能であると示唆された。

尽管黑色素菌病很少见，但它是世界各地问题的原因，尤其是在发展中国家，因为它不仅在皮肤中而且在整个身体中都播种。对于黑色素菌病，治疗方法因细菌的种类而有所不同，很重要的是要快速识别该物种，但问题在于它是高度专业化的，需要时间。使用质量分析仪（MALDI-TOF MS）的细菌物种鉴定方法快速简便，并且已经被用于细菌鉴定的实际用途。这项研究使用MALDI-TOF MS建立了对黑色真菌的快速鉴定。我们研究了MALDI-TOF MS在分娩属中的有用性，这在黑色素菌病中最常见。由于目前出售的库（数据库）几乎没有黑色真菌注册，因此已注册标准应变并创建了内部库。至于用于测试的预处理方法，目前使用的预处理方法与MALDI-TOF MS鉴定丝状真菌是复杂且耗时的，因此我们比较并检查了预处理方法，该方法直接利用了在坡度培养基中创建的菌落，并且是colonies催化性测试的最快方法。与常规方法相比，测试结果的先前得分与常规方法的分数与后者的分数差异更大，并且被认为更适合实际的临床实践。使用这种预处理方法，使用MALDI-TOF MS检查了在我们的设施中识别的杂源属。除了传统库外，上面提到的新注册的内部库还用作要匹配的数据库。结果，在30/31菌株中得分最高的物种与基因鉴定的物种一致。 MALDI-TOF MS文库的增强和预处理的创造力表明，可以识别出雌性属。

项目成果

MALDI-TOF MS(質量分析器)による黒色真菌迅速同定

使用MALDI-TOF MS（质谱仪）快速鉴定黑真菌

• 发表时间: 2022
• 作者: Tanaka Yuka;Ito Takamichi;Tanegashima Keiko;Tsuji Gaku;Nakahara Makiko;Nakahara Takeshi;二ッ谷 剛，村 竜輝，安澤 数史，望月 隆，清水 晶，飯沼 由嗣
• 通讯作者: 二ッ谷 剛，村 竜輝，安澤 数史，望月 隆，清水 晶，飯沼 由嗣