Diversity and transcription of 16S rRNA genes on the genome of halophilic archaea

嗜盐古菌基因组16S rRNA基因的多样性和转录

基本信息

批准号：
23657016
负责人：
KIMURA Hiroyuki
金额：
$ 2.41万
依托单位：
Shizuoka University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
财政年份：
2011
资助国家：
日本
起止时间：
2011 至 2012
项目状态：
已结题

项目摘要

Halophilic archaea have a few types of 16S rRNA gene on their genome. The prokaryotes, which live in high temperature, commonly have high G+C content of 16S rRNA genes, whereas the prokaryotes, which live in normal or low temperature, have low G+C content of 16S rRNA genes. In this study, we determined the growth temperatures and transcription amount of 16S rRNA genes of the halophilic archaeal strains in several temperature conditions. The low G+C content of 16S rRNAs showed significant upregulation in 25-30℃. On the other hand, high G+C content of 16S rRNAs were expressed at significantly higher levels in high temperature condition, 40-50℃.

嗜盐古菌的基因组上有几种类型的16S rRNA基因，生活在高温下的原核生物通常具有较高的16S rRNA基因G+C含量，而生活在常温或低温下的原核生物则具有较低的G含量。本研究测定了嗜盐古菌菌株在几种低温条件下的生长温度和16S rRNA基因的转录量。 16S rRNAs的G+C含量在25-30℃下表现出显着的上调，而16S rRNAs的高G+C含量在高温条件下（40-50℃）表达水平显着升高。

项目成果

期刊论文数量（17）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

好塩性古細菌Haloarcula の多様な 16S rRNA 遺伝子と生育温度

嗜盐古菌Haloarcula的多样化16S rRNA基因和生长温度

DOI：
发表时间：
2013
期刊：
影响因子：
0
作者：
佐藤悠;木村浩之
通讯作者：
木村浩之

Growth temperatures of archaeal communities can be estimated from the guanine-plus-cytosine contents of 16S rRNA gene fragments

DOI：
10.1111/1758-2229.12035
发表时间：
2013-06-01
期刊：
ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY REPORTS
影响因子：
3.3
作者：
Kimura, Hiroyuki;Mori, Kousuke;Ishibashi, Jun-Ichiro
通讯作者：
Ishibashi, Jun-Ichiro

微生物分子温度計による地下圏の温度プロファイリング

使用微生物分子温度计对地下球体进行温度分析

DOI：
发表时间：
2012
期刊：
月刊地球
影响因子：
0
作者：
Shohei Hattori;Hiroaki Nashimoto;Hiroyuki Kimura;Keisuke Koba;Keita Yamada;Mikio Shimizu;Hiroshi Watanabe;Muneoki Yoh;Naohiro Yoshida;木村浩之
通讯作者：
木村浩之

プロテオロドプシンを有する海洋細菌の光エネルギー利用と代謝メカニズム

具有蛋白视紫红质的海洋细菌的光能利用及代谢机制

DOI：
发表时间：
期刊：
影响因子：
0
作者：
木村浩之;Young C;Martinez A;DeLong EF;木村浩之
通讯作者：
木村浩之

Hydrogen and carbon isotope fractionation by thermophilic hydrogenotrophic methanogens from a deep aquifer under coculture with fermenters

DOI：
10.2343/geochemj.1.0161
发表时间：
2012-06
期刊：
Geochemical Journal
影响因子：
0.8
作者：
S. Hattori;Hiroaki Nashimoto;Hiroyuki Kimura;K. Koba;Keita Yamada;Mikio Shimizu;Hiroshi Watanabe;M. Yoh;N. Yoshida
通讯作者：
S. Hattori;Hiroaki Nashimoto;Hiroyuki Kimura;K. Koba;Keita Yamada;Mikio Shimizu;Hiroshi Watanabe;M. Yoh;N. Yoshida