Rapid conformational change results in attractive interactions between biomolecules

快速构象变化导致生物分子之间有吸引力的相互作用

基本信息

批准号：
24651244
负责人：
MURATA Michio
金额：
$ 2.58万
依托单位：
Osaka University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
财政年份：
2012
资助国家：
日本
起止时间：
2012-04-01 至 2014-03-31
项目状态：
已结题

项目摘要

Hydrophobic interactions are known to be essential for biomolecular recognition. In this project, our hypothesis that concerted bimolecular movements lead to stabilization of complexation was confirmed by experimental data. Fatty acid and fatty-acid binding proteins were subjected to the structural determination by X-ray analysis. The results clearly showed that fatty acids with an alkyl chain longer than C14 have highly flexible conformation around their terminal methyl group. These movements of alkyl chains hardly prevent high affinity of fatty acids, thus supporting that a rapid movements of ligand molecules do not always decrease bimolecular affinity but stabilize the ligand binding.

已知疏水相互作用对于生物分子识别至关重要。在这个项目中，我们的假设是通过实验数据证实了一致的双分子运动导致络合的稳定。通过X射线分析对脂肪酸和脂肪酸结合蛋白进行结构测定。结果清楚地表明，烷基链的脂肪酸比C14更长的脂肪酸在其末端甲基周围具有高度柔韧的构象。这些烷基链的运动几乎不能阻止脂肪酸的高亲和力，因此支持配体分子的快速运动并不总是会降低双分子亲和力，而是稳定了配体结合。

项目成果

期刊论文数量（24）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

重水素個体ＮＭＲによる脂質ラフトにおけるスフィンゴミエリンの運動性解析

氘固态核磁共振分析脂筏中的鞘磷脂运动

DOI：
发表时间：
2013
期刊：
影响因子：
0
作者：
安田智一;土川博史;松森信明;村田道雄
通讯作者：
村田道雄

Structure of the human muscle fatty acid-binding protein complexed with competitive inhibitor

与竞争性抑制剂复合的人肌肉脂肪酸结合蛋白的结构

DOI：
发表时间：
2013
期刊：
影响因子：
0
作者：
Mika Hirose;Shigeru Sugiyama;Hanako Ishida;Daisuke Matsuoka;Toshiaki Hara;Eiichi Mizohata;Tsuyoshi Inoue;Shigeru Matsuoka;Michio Murata
通讯作者：
Michio Murata

Coexistence of two liquid crystalline phases in dihydrosphingomyelin and dioleoylphosphatidylcholine binary mixtures

DOI：
10.1016/j.bbamem.2014.01.017
发表时间：
2014-05-01
期刊：
BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA ACTA-BIOMEMBRANES
影响因子：
3.4
作者：
Kinoshita, Masanao;Matsumori, Nobuaki;Murata, Michio
通讯作者：
Murata, Michio

Design and Synthesis of Labeled Compounds for Conformation Analysis of Fatty Acids Bound to Proteins

用于蛋白质结合脂肪酸构象分析的标记化合物的设计和合成

DOI：
发表时间：
2013
期刊：
影响因子：
0
作者：
Lethu;S.;Matsuoka;S.;Murata;M.
通讯作者：
M.

親水性脂肪酸類縁体と脂肪酸結合タンパク質の結合様式

亲水性脂肪酸类似物与脂肪酸结合蛋白的结合方式

DOI：
发表时间：
2014
期刊：
影响因子：
0
作者：
Umegawa;Y.;Adachi;T.;Matsumori;N.;Murata;M.;隅田有人,原田龍,細谷孝充;大塚康平・松岡茂・廣瀬未果・佐藤文憲・溝端栄一・杉山成・井上豪・村田道雄
通讯作者：
大塚康平・松岡茂・廣瀬未果・佐藤文憲・溝端栄一・杉山成・井上豪・村田道雄