Update and expansion of the website "nucleotide sequence analysis (with R)"

网站“核苷酸序列分析（用R）”的更新和扩展

• 批准号: 18K11521
• 负责人: KADOTA Koji
• 金额: $ 2.91万
• 依托单位: The University of Tokyo
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2018
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2018-04-01 至 2022-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-18K11521/
• 关键词: R; 研究倫理; 発現変動解析; RNA-seq; 発現解析; データ正規化; Rパッケージ; パッケージ; ウェブサーバ; 文献調査; ガイドライン; カウントデータ; バイオインフォマティクス; 統計解析

项目成果

(Rで)塩基配列解析

碱基序列分析（R 中）

(Rで)塩基配列解析のサブ

碱基序列分析子（R 中）

TCC-GUI: a Shiny-based application for differential expression analysis of RNA-Seq count data

TCC-GUI：基于 Shiny 的应用程序，用于 RNA-Seq 计数数据的差异表达分析

• DOI: 10.1186/s13104-019-4179-2
• 发表时间: 2019
• 影响因子: 1.8
• 作者: Su Wei;Sun Jianqiang;Shimizu Kentaro;Kadota Koji
• 通讯作者: Kadota Koji

(Rで)塩基配列解析

碱基序列分析（R 中）

Accurate Classification of Differential Expression Patterns in a Bayesian Framework With Robust Normalization for Multi-Group RNA-Seq Count Data.

贝叶斯框架中差异表达模式的准确分类以及多组 RNA-Seq 计数数据的稳健标准化。

• DOI: 10.1177/1177932219860817
• 发表时间: 2019
• 作者: Osabe T; Shimizu K; Kadota K
• 通讯作者: Kadota K