ダニ類最後のエニグマ（謎）：ニセササラダニ類の進化的変遷

螨虫最后的谜团：沙拉假螨的进化变化

• 批准号: 18K06392
• 负责人: 島野 智之
• 金额: $ 2.75万
• 依托单位: Hosei University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2018
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2018-04-01 至 2024-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-18K06392/
• 关键词: 系統分類学; ダニ学; 動物分類学; 汎ケダニ目; 汎ササラダニ目; 胸板ダニ上目; 胸板ダニ類; 系統的位置; 記載分類; ケダニ類; ニセササラダニ類

昨年に引き続き，胸板ダニ類の系統推定において，核遺伝子では18S rRNAや28S rRNA(主にD3領域)，EF1-alpha，HSP82が，ミトコンドリア遺伝子ではCOIが主に用いられている.今年度行ったショットガンシーケンスでは，最小5ngの抽出DNAよりほぼすべての上述のマーカーを含む塩基配列決定が可能であった.個体が小さいためDNA およびRNA量の確保が難しい分類群であるダニ類において，エタノール固定された1個体からでも系統推定に十分な配列を確保する方法を運用している．超並列シークエンサーから出力される配列データは以下の流れでの配列決定方法を確立した.出力ファイル(fastq)をfastpでのフィルター処理の後，GetOrganelleでのアセンブリを行う.続いて，Ugeneでのde noveアセンブリを行い，その結果をBandageに読み込ませ，各種遺伝子配列捜索を行い.さらにCLC Genomics Work Benchでのde novoアセンブリとmap readによる確定を行っている．これらに基づいた，分岐年代推定の方法を確立した．現在，それぞれの分類群の分岐年代の推定に，取り組んでいる．また，ミトコンドリアの遺伝子配列についても，考察をすすめている．また，ヤワスジダニ科のカタツムリダニの2新亜種について記載を行った(Waki et al., 2022)．日本産のトキについていたウモウダニ2種の再記載（Waki and Shimano, 2022），コアホウドリから得られた2種のウモウダニの再記載と記録をおこなった（Waki et al., 2022）．市民科学と生物種の保全のためSNSを媒体としたササラダニの新種記載を行った（Pfingstl et al, 2022）．

从去年开始，在估计胸螨的估计中，18S rRNA，28S rRNA（主要是D3区域），EF1-Alpha和Hsp82用于核基因，COIS主要用于线粒体基因。今年的shot弹枪序列能够确定几乎包含上述标记的基础测序，而不是最低5ng提取的DNA。在螨虫中，由于最小的个体而难以保护DNA和RNA量的分类单元，我们正在使用一种方法来确保足够的序列估算一个甚至一个乙醇固定的个体。在以下过程中已经建立了从大规模并行序列仪中输出的序列数据。输出文件（FASTQ）由FASTP过滤，然后使用getorganelle执行汇编。接下来，使用UGENE进行DE Nove组装，将结果加载到绷带中，并搜索各种基因序列。此外，使用CLC基因组学工作台和地图读取从头组装进行。基于这些，建立了一种估计分支年龄的方法。目前，我们正在努力估计每个分类单元的差异年龄。我们还在考虑线粒体基因序列。此外，已经描述了来自Azumadae家族的蜗牛螨的两种新亚种（Waki等，2022）。重新描述并记录了两种在日本成语（Waki and Shimano，2022）上发现的玉米螨，并从核心面糊中获得两种玉米螨（Waki等，2022）。为了保护公民科学和物​​种，使用社交媒体作为媒介描述了一种新的螨虫（Pfingstl等，2022）。

项目成果

Redescription of two parasitic feather mites sampled from the last two Crested Ibises, Nipponia nippon (Temminck, 1835) (Pelecaniformes: Threskiornithidae), lived in Japan

对生活在日本的最后两只朱鹮 Nipponia nippon（Temminck，1835）（鹈鹕目：Threskiornithidae）取样的两种寄生羽螨的重新描述

• DOI: 10.11646/zootaxa.5116.1.7
• 发表时间: 2022
• 期刊: Zootaxa
• 影响因子: 0.9
• 作者: Waki Tsukasa;Shimano Satoshi
• 通讯作者: Shimano Satoshi

Supplementary descriptions of Pergalumna amamiensis Aoki, 1984 (Acariformes, Galumnoidea) from Ryukyu Islands.

来自琉球群岛的 Pergalumna amamiensis Aoki，1984（螨形目，Galumnoidea）的补充描述。

• DOI: 10.11646/zootaxa.4647.1.24
• 发表时间: 2019
• 期刊: Zootaxa
• 影响因子: 0.9
• 作者: Hagino;W. and Shimano;S.
• 通讯作者: S.

<i>Riccardoella</i> mites infecting six land snail species, referred to in the Red Data List and the Red Data Book

感染红色数据列表和红色数据手册中提到的六种陆地蜗牛的<i>Riccardoella</i>螨

• DOI: 10.19004/taxa.46.0_34
• 发表时间: 2019
• 期刊: Taxa, Proceedings of the Japanese Society of Systematic Zoology
• 作者: 脇 司;島野 智之;浅見 崇比呂
• 通讯作者: 浅見 崇比呂

A new species of the genus Arrup from a limestone cave in Akiyoshi-dai, Western Japan (Chilopoda, Geophilomorpha, Mecistocephalidae)

日本西部秋吉台石灰岩洞穴中的阿鲁普属新种（Chilopoda、Geophilomorpha、Mecistocephalidae）

• DOI: 10.3897/zookeys.830.33060
• 发表时间: 2019
• 期刊: ZooKeys
• 影响因子: 1.3
• 作者: Tsukamoto Sho;Shimano Satoshi;Murakami Takashi;Hiruta Shimpei F.;Yamasaki Takeshi;Eguchi Katsuyuki
• 通讯作者: Eguchi Katsuyuki

A new species of Japanese oribatid mite, Zachvatkinibates erimo sp. nov., showing sexual dimorphism (Acariformes: Oribatida: Punctoribatidae).

日本甲螨新种 Zachvatkinibates erimo sp.

• DOI: 10.11646/zootaxa.4647.1.22
• 发表时间: 2019
• 期刊: Zootaxa
• 影响因子: 0.9
• 作者: Shimano;S. and Aoki;J.
• 通讯作者: J.