Improving Coarse-Grained Molecular Models through the Combination of All-Atom Models and Machine Learning Methods

通过全原子模型和机器学习方法的结合改进粗粒度分子模型

基本信息

  • 批准号：
    19K06535
  • 负责人：
    Kanada Ryo
  • 金额：
    $ 1.75万
  • 依托单位：
    Institute of Physical and Chemical Research
  • 依托单位国家：
    日本
  • 项目类别：
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
  • 财政年份：
    2019
  • 资助国家：
    日本
  • 起止时间：
    2019-04-01 至 2023-03-31
  • 项目状态：
    已结题

项目摘要

项目成果

期刊论文数量（6）
专著数量（0）
科研奖励数量（0）
会议论文数量（0）
专利数量（0）
Efficient Conformational Sampling with an Adaptive Coarse-Grained Elastic Network Model using Dynamic Cross-Correlation Coefficient
使用动态互相关系数的自适应粗粒度弹性网络模型的高效构象采样
  • DOI：
  • 发表时间：
    2022
  • 期刊：
  • 影响因子：
    0
  • 作者：
    Ryo Kanada;Kei Terayama;Atsushi Tokuhisa;Shigeyuki Matsumoto;Yasushi Okuno
  • 通讯作者：
    Yasushi Okuno
A Heart simulator coupling the molecular dynamics with the finite element model: Cross-scale integration of our knowledge on heart
将分子动力学与有限元模型耦合的心脏模拟器：心脏知识的跨尺度整合
  • DOI：
  • 发表时间：
    2019
  • 期刊：
  • 影响因子：
    0
  • 作者：
    Seiryo Sugiura;Ryo Kanada;Takumi Washio;Xiaoke Cui;Jun-ichi Okada;Yasushi Okuno;Toshiaki Hisada
  • 通讯作者：
    Toshiaki Hisada
Cross-linking of UT-Heart simulator and coarse-grained molecular simulation
UT-Heart模拟器与粗粒度分子模拟的交联
  • DOI：
  • 发表时间：
    2019
  • 期刊：
  • 影响因子：
    0
  • 作者：
    Ryo Kanada;Takumi Washio,Seiryo Sugiura,Jun-ichi Okada,Shoji Takada,Yasushi Okuno,and Toshiaki Hisada
  • 通讯作者：
    Takumi Washio,Seiryo Sugiura,Jun-ichi Okada,Shoji Takada,Yasushi Okuno,and Toshiaki Hisada
Efficient Conformational Sampling with an Adaptive Coarse-Grained Elastic Network Model using Bayesian Optimization.
使用贝叶斯优化的自适应粗粒度弹性网络模型进行高效构象采样。
  • DOI：
  • 发表时间：
    2022
  • 期刊：
  • 影响因子：
    0
  • 作者：
    Ryo Kanada;Kei Terayama;Atsushi Tokuhisa; and Yasushi Okuno
  • 通讯作者：
    and Yasushi Okuno
Exploring Successful Parameter Region for Coarse-Grained Simulation of Biomolecules by Bayesian Optimization and Active Learning
  • DOI：
    10.3390/biom10030482
  • 发表时间：
    2020-03-01
  • 期刊：
    BIOMOLECULES
  • 影响因子：
    5.5
  • 作者：
    Kanada, Ryo;Tokuhisa, Atsushi;Terayama, Kei
  • 通讯作者：
    Terayama, Kei
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  • 通讯作者：
    〇山形優香,　坂野彰則,　齊藤輝,　金子敦巳,　古川和広,　中馬吉郎
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    2022
  • 期刊：
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    3
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  • 通讯作者：
    Tanaka Shigenori

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