Maintenance of diatom bloom by viruses

通过病毒维持硅藻华

基本信息

批准号：
19H00956
负责人：
外丸裕司
金额：
$ 28.87万
依托单位：
Fisheries Research and Education Agency
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
财政年份：
2019
资助国家：
日本
起止时间：
2019-04-01 至 2024-03-31
项目状态：
已结题

项目摘要

過年度の研究成果により、増殖モデルの計算から培養個体群に占めるウイルス感染率の推定を行う事に成功した。今年度はさらに、培養個体群に占めるウイルス感染細胞の割合を直接的に検出する手法の構築に着手した。ウイルスを接種された珪藻個体群の培養からセルソーターを用いて1細胞ずつ分離し、それら細胞のウイルス感染有無をqPCR法またはPCR法を基に評価した。その結果、培養液から1細胞を分離し、細胞の存在を検出できることが明らかになった。また、プライマーの調整など検出手法に関する技術的検討は残るものの、ウイルス感染したと思われる細胞の検出にも成功した。Chaetoceros tenuissimusの培養実験の結果からは、当該種が様々な形態の有機物をリン源として増殖に利用できる可能性が示され、各種分解系酵素を有しているものと推察された。また、RNAウイルスの感染速度の測定を実施した。RNAウイルスは、感染して殺せる宿主には吸着していく様子が理解できたが、感染して殺せない相手には吸着している事が確認できなかった。これは、RNAウイルスの感染条件として、先ず同種の珪藻であっても株によって吸着の可否が存在することを示唆している。本成果は今後の珪藻・ウイルス関係を考えていく上でも貴重な成果となった。また、連続培養装置についても新規構築を図った。さらにメタボローム解析を用いた実験では、珪藻の細胞培養が定常期に入ると、細胞の糖/アミノ酸比率が劇的に上昇する現象を見出し、その成果を論文化した。

根据前几年的研究成果，我们成功地利用增殖模型进行了计算，估算了培养群体中的病毒感染率。今年，我们还开始构建一种直接检测培养群体中病毒感染细胞比例的方法。使用细胞分选仪从接种了病毒的硅藻群体的培养物中逐个分离细胞，并基于qPCR或PCR评估这些细胞中是否存在病毒感染。结果表明，可以从培养基中分离出单个细胞并检测该细胞的存在。该团队还成功地检测到了被认为感染了病毒的细胞，尽管引物调整等技术考虑因素仍然存在。对细角毛藻的培养实验结果表明，该物种可能能够利用多种形式的有机物作为磷源进行生长，并推测其具有多种降解酶。我们还测量了RNA病毒的感染率。据了解，RNA病毒会吸附到它们可以感染和杀死的宿主上，但他们无法证实它们会吸附到它们无法感染和杀死的宿主上。这表明，作为RNA病毒感染的条件，即使是同一种类，根据硅藻的种类不同，能否吸附也存在差异。这一结果对于考虑硅藻和病毒之间的未来关系也很有价值。我们还建造了一个新的连续培养装置。此外，在使用代谢组分析的实验中，他们发现当硅藻细胞培养物进入稳定期时，细胞糖/氨基酸比率急剧增加，并在论文中发表了他们的发现。

项目成果

期刊论文数量（36）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

Transcriptional Responses of the Marine Planktonic Diatom Chaetoceros tenuissimus to Nitrogen- and Phosphorus-deficient States

海洋浮游硅藻<i>Chaetoceros tenuissimus</i>对氮磷缺乏状态的转录反应

DOI：
10.6090/jarq.56.295
发表时间：
2022
期刊：
影响因子：
0
作者：
YAMAGUCHI Haruo;INOUE Minoru;TANIMOTO Yuko;SUMIDA Narumi;ADACHI Masao;KIMURA Kei;TOMARU Yuji
通讯作者：
TOMARU Yuji

海産珪藻Chaetoceros tenuissimusのゲノム中に見られた感染性ウイルス遺伝子の挿入履歴

海洋硅藻 Chaetoceros tenuissimus 基因组中发现的感染性病毒基因的插入历史