Contribution to African food security by domestication of a giant rodent and development of a new experimental animal

通过驯化巨型啮齿动物和开发新实验动物为非洲粮食安全做出贡献

基本信息

批准号：
19KK0177
负责人：
小出剛
金额：
$ 11.23万
依托单位：
National Institute of Genetics
依托单位国家：
日本
项目类别：
Fund for the Promotion of Joint International Research (Fostering Joint International Research (B))
财政年份：
2019
资助国家：
日本
起止时间：
2019-10-07 至 2025-03-31
项目状态：
未结题

项目摘要

本プロジェクトでは、研究代表者らがマウスを用いて確立してきた選択交配による家畜化法を用いて、グラスカッターの家畜化を進めると共に、その表現型、特に繁殖・行動・免疫・組織学的特徴について解析し、新たな実験動物としての可能性について検討するものである。2022年度は、グラスカッターの全ゲノムシーケンスデータを用いて遺伝子のアノテーション解析結果をまとめた。また、グラスカッターが属するヤマアラシ亜目の動物種も含めて嗅覚受容体遺伝子、フェロモン受容体遺伝子、更に苦み感受性遺伝子について、ゲノム情報から同定し、その遺伝子数やパラログ及びオーソログ解析を進めた結果をまとめた。更に、多型情報を用いて、進化的な位置づけに関する解析を進めた結果についてまとめた。これらの結果について、投稿論文としてまとめて国際誌に投稿した。ガーナ在来のグラスカッターにおいては、家畜化を進めるために、継続して繁殖を進めた。この繁殖はガーナ大学の飼育施設を用いて行っている。現在、繁殖は順調に進んでおり、生まれた個体のテームネス（従順性）について行動テストにより評価を行った。そのデータをもとに次世代のための交配に用いる個体の選抜を行っている。これまでに得られた31サンプルのゲノムデータを用いて、その解析を進めた。現在得られている結果によると、繁殖個体は遺伝的に比較的独立したグループは8つに分かれており、多様性が低いことが分かった。現在、これらのゲノムデータをどのように今後の解析に活用するか検討を進めている。

在本项目中，我们将利用研究代表利用小鼠建立的选育驯化方法，推进割草机的驯化，并研究其表型特征，特别是繁殖、行为、免疫和组织学特征。这项研究的目的是分析这些动物并考虑它们作为新实验动物的潜力。 2022年，我们利用Grass Cutter的全基因组序列数据整理了基因注释分析的结果。此外，我们从基因组信息中鉴定了嗅觉受体基因、信息素受体基因和苦味敏感性基因，包括割草机所属的豪猪亚目动物物种，并分析了基因、旁系同源物和直系同源物的数量。此外，我们总结了使用多态性信息进行进化定位分析的结果。这些结果被总结为一篇论文并提交给国际期刊。割草机原产于加纳，不断繁殖以促进驯化。该育种是使用加纳大学的育种设施进行的。目前繁殖工作进展顺利，并通过行为测试评估了新生个体的驯服程度。根据这些数据，选择个体来培育下一代。我们利用迄今为止获得的 31 个样本的基因组数据进行了分析。目前的结果表明，育种个体被分为8个遗传上相对独立的群体，表明多样性较低。我们目前正在考虑如何利用这些基因组数据进行未来的分析。