High Throughput Measurement of Radioactive Tracers for Searching QTL of Ion Dynamics in Plants

高通量测量放射性示踪剂用于寻找植物离子动力学 QTL

基本信息

批准号：
20H02885
负责人：
田野井慶太朗
金额：
$ 11.15万
依托单位：
The University of Tokyo
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
财政年份：
2020
资助国家：
日本
起止时间：
2020-04-01 至 2024-03-31
项目状态：
已结题

项目摘要

3年目の本年度は、実験材料としてのイネの品種選抜においてイネの拡大版コアコレクション約200系統、インディカ200系統、aus200系統の、合計600系統を対象とし、イオンの転流の影響が大きいと考えられる止め葉（穂が出てくる直前に出てくる最後の葉）の葉身に焦点をあて、2020年に8月の出穂期と10月の収穫期の2回に分けてサンプリングをした止め葉について、合計約6000点について、硝酸にて湿式分解の後、ICP-MSによる網羅的なイオン測定を実施した。測定対象とした元素は、B, Na, Mg, Al, P, S, K, Ca, Mn, Fe, Co, Ni, Cu, Zn, As, Rb, Sr, Mo, Cd, Cs, Baであった。これらを一度の測定で完了するためのプログラムを構築して、測定を進め、全てのサンプルの測定を終えることができた。測定結果をもとに、イオノーム解析を実施した。興味のあった転流を解析するにあたり、得られたデータをクリーニングした後、多変量解析を行ったところ、PC3までで60％となった。とりわけ30％を超えるPC1について各元素のグルーピングを見てみると、2つのグループに別れ、止め葉からの転流が多いと見られるグループには、Mo, Mg, Zn, Rb, Cu, K, Pが、転流なしと見られるグループには、Mn, Ca, Sr, Co, Feがグルーピングされた。PC1を転流を示す軸とみなし、PC1の値でQTLを実施したところ、有意に差があるとされるピークが複数見られた。他、As, Mg, KについてGWASを実施し、それぞれ有意に差があるとされるピークを見出すことに成功した。また、引き続き確立した測定系やRI実験法を活用した共同研究も展開した。

在今年的第三年中，我们选择了稻米品种作为实验材料，总共有600行，包括大约200条米，200条indica和200条AUS线。我们专注于炉子叶片的叶片（耳朵出现之前出现的最后一片叶子）被认为在很大程度上受离子换向的影响。今年，在2020年，米饭品种的湿分解，我们使用ICP-MS进行了全面的离子测量，在八月份进行了大约6,000点炉子叶子的6,000点，并在10月进行收获期。要测量的元素为B，Na，Mg，Al，P，S，K，Ca，Mn，Fe，Co，Ni，Cu，Cu，Zn，AS，RB，Sr，Sr，Mo，Mo，Cd，Cs，ba。构建了一个程序以在一个测量中完成这些程序，进行测量，并完成所有样品的测量。根据测量结果进行了Ionome分析。在分析感兴趣的我的换理时，清理了所获得的数据，然后进行多变量分析，结果为60％，升至PC3。查看每个元素的分组，尤其是对于超过30％的PC1，将组分为两组，Mo，Mg，Mg，Zn，rb，Cu，k，p分组成组，分组成组，这些组似乎从塞子叶和MN，CA，CA，CA，SR，CO，FE分组中似乎是未被转移的组。当将PC1视为表明在PC1值上进行换向和QTL的轴时，发现几个峰显着差异。此外，GWAS是在AS，MG和K上进行的，我们成功地找到了一个峰值，据说这是显着不同的峰值。此外，使用已建立的测量系统和RI实验方法继续进行联合研究。

项目成果

期刊论文数量（23）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

シンチレータの植物研究応用

闪烁体的植物研究应用

DOI：
发表时间：
2023
期刊：
影响因子：
0
作者：
D.X Makaula;K. T. Konadu;Opitz;K. Sasaki;S.T.L Harrison;田野井慶太朗
通讯作者：
田野井慶太朗

Bioimaging of mineral elements in plants

植物中矿物元素的生物成像

DOI：
10.20710/dojo.92.2_213
发表时间：
2021
期刊：
Japanese Journal of Soil Science and Plant Nutrition
影响因子：
0
作者：
馬建鋒;田野井慶太朗;古川純;鈴井伸郎;Wang Peng;山地直樹;高野順平
通讯作者：
高野順平

植物の長距離輸送を調べるためのβ- 線放出核種の非破壊イメージング手法

β射线发射核素的无损成像方法研究植物中的长距离传输

DOI：
发表时间：
2020
期刊：
影响因子：
0
作者：
田野井慶太朗;杉田亮平;中西友子
通讯作者：
中西友子

低分子化合物ライブラリーを対象とした新規有機シンチレータの探索

寻找针对低分子化合物库的新型有机闪烁体

DOI：
发表时间：
2022
期刊：
影响因子：
0
作者：
田野井慶太朗;杉田亮平;山下真一;八木亜樹子;佐藤綾人;伊丹健一郎
通讯作者：
伊丹健一郎

Cell Type-Specific Functional Analysis of Sodium Ion Transporter SOS1 in Roots

根中钠离子转运蛋白 SOS1 的细胞类型特异性功能分析

DOI：
发表时间：
2022
期刊：
影响因子：
0
作者：
Takaaki Ogura;Mio Nagoya;Ryohei Sugita;Natsuko I. Kobayashi;Tomoko M. Nakanishi and Keitaro Tanoi
通讯作者：
Tomoko M. Nakanishi and Keitaro Tanoi