Comprehensive genetic and morphological analysis for sudden cardiac death autopsy cases

心源性猝死尸检病例的综合遗传和形态学分析

基本信息

批准号：
21H03211
负责人：
畑由紀子
金额：
$ 11.23万
依托单位：
University of Toyama
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
财政年份：
2021
资助国家：
日本
起止时间：
2021-04-01 至 2024-03-31
项目状态：
已结题

项目摘要

本年度は、21症例の突然死症例について全エクソーム解析を行なった。全症例について、以下に示す通り病理組織学的検索および遺伝子解析を行なった。1. 突然死症例の病理組織学的検索は、微細な病理学的変化を明らかにすることを目的に、死因、肉眼所見を問わず刺激伝導系の切り出しを含め常に15ヶ所以上の心臓組織標本を作製し観察を行った。加えて、その他主要臓器については2ヶ所以上、脳については20ヶ所以上標本を作製して観察を行った。2. 突然死症例の遺伝子解析は、剖検時採取した血液からDNAを抽出し、エクソーム解析を施行した。また、説明・同意をえられた家族については、スワブで採取した口腔粘膜細胞からDNA抽出し、エクソーム解析を施行した。突然死剖検例に対する遺伝子検索手法の確立を目指すために、検出されたバリアントについて、1) 日本人の稀少変異(頻度1%以下)の抽出、2) 疾患データベースのClinVar、HGMDを用いた検索、3) 米国臨床遺伝・ゲノム学会のガイドラインに従った評価、4) 機能予測ツールを用いて病原性を評価した。検出したバリアントについては、Human Phenotype Ontology (HPO)やOnline Mendelian Inheritance in Man (OMIM)などを用いて疾患関連遺伝子で分類した。また、病歴や健康診断の心電図などできる限り入手した。そのうち40代男性症例について、生前の心電図、刺激伝導系の病理組織学的検索、遺伝子解析の結果についてまとめ学会発表・論文作成を行なった。また、これまでの当教室で実施したてんかん症例の遺伝子検索についての講演を行った。本年度の補助金は、研究を遂行するための遺伝子解析、遺伝子解析ソフト及びバリアントの機能解析に用いるキット購入の費用にあてられた。

今年，对21例猝死病例进行了全外显子组分析。对于所有病例，如下所示进行组织病理学搜索和遗传分析。 1.猝死病例的组织病理学搜索总是涉及从15个或更多位置采集心脏组织标本，包括切除冲动传导系统，无论死亡原因或肉眼观察结果如何，以澄清微小的病理变化。。此外，在两个以上的其他主要器官位置和至少 20 个大脑位置制备并观察了标本。 2. 对于猝死病例的基因分析，从尸检时采集的血液中提取DNA并进行外显子组分析。此外，对于提供知情同意的家庭，从拭子收集的口腔粘膜细胞中提取DNA并进行外显子组分析。为了建立针对突发尸检病例的基因搜索方法，我们进行了1）提取日本患者的罕见突变（频率为1％以下），2）使用疾病数据库ClinVar和HGMD进行搜索，3）根据指南进行评估美国临床遗传学和基因组学协会，4) 使用功能预测工具评估致病性。使用人类表型本体论 (HPO) 和在线人类孟德尔遗传 (OMIM) 对检测到的变异按疾病相关基因进行分类。我们还尽可能从体检中获取病史和心电图。针对一名40多岁男性的病例，我们总结了生前心电图、脉冲传导系统组织病理学检查和遗传分析的结果，并在学术会议上发表了结果并撰写了论文。此外，他还就我们科室进行的癫痫病例的基因搜索进行了讲座。今年的拨款用于进行基因分析研究、基因分析软件以及购买用于变异功能分析的试剂盒。

项目成果

期刊论文数量（10）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

A burden of sarcomere gene variants in fetal-onset patients with left ventricular noncompaction

胎儿期发病的左心室致密化不全患者的肌节基因变异负担

DOI：
10.1016/j.ijcard.2020.12.013
发表时间：
2021
期刊：
影响因子：
3.5
作者：
Hirono Keiichi;Hata Yukiko;Ozawa Sayaka Watanabe;Toda Takako;Momoi Nobuo;Fukuda Yutaka;Inuzuka Ryo;Nagamine Hiroki;Sakaguchi Heima;Kurosaki Kenichi;Okabe Mako;Takarada Shinya;Miyao Nariaki;Nakaoka Hideyuki;Ibuki Keijiro;Origasa Hideki;Bowles Neil E.;Nishi
通讯作者：
Nishi

Pathological and comprehensive genetic investigation of autopsy cases of idiopathic bradyarrhythmia

特发性缓慢性心律失常尸检病例的病理和综合遗传学研究