Construction of preemptive medicine for rheumatoid arthritis based on proteomics and artificial intelligence of a medical examination cohort

基于体检队列蛋白质组学和人工智能的类风湿性关节炎抢先治疗构建

• 批准号: 20K20617
• 负责人: 大山 要
• 金额: $ 16.56万
• 依托单位: Nagasaki University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Challenging Research (Pioneering)
• 财政年份: 2020
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2020-07-30 至 2024-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-20K20617/
• 关键词: 健診コホート; 免疫複合体; 人工知能; 関節リウマチ; 先制医療

離島コホートの血清検体に含まれる免疫複合体抗原の一斉同定結果（2021年度解析分を含む）をもとに、RA超早期から出現する抗原の特定を試みた。最終的に56名の離島コホート64検体を解析した。なお、全検体が抗シトルリン化ペプチド抗体陽性であった。過去に解析した早期RA、全身性エリテマトーデス、強皮症、シェーグレン症候群で検出された免疫複合体抗原を比較対照とした（Ann Rheum Dis 2012；Clin Biochem 2015；Clin Exp Immunol 2021；J Autoimmun 2023）。離島コホートでは447種類の免疫複合体抗原が同定された。このうち、比較対照群で検出されず、離島コホートのみで検出される免疫複合体抗原が2種類特定できた。この免疫複合体抗原は早期RAでも検出されなかったため、抗シトルリン化ペプチド抗体陽性ではあるが、症状が現れる（早期RA）前の超早期RAに特徴的なものと考えられた。さらに、シトルリン化タンパク質に絞った免疫複合体抗原解析についても同様の比較を行い、超早期RAに特徴的または特異的なシトルリン化配列（ペプチド）の特定を継続中である。他方、上記の解析で得たMSスペクトル、MS/MSスペクトルのシグナル強度を利用してラベルフリー定量を行った。個々の免疫複合体抗原の量を示すデータであり、疾患／免疫複合体抗原／量に基づく特徴付けを人工知能解析で進めている。また、架橋質量分析法を応用して、自己抗原化における異常本体である抗原決定基（エピトープ）を特定する方法を開発した（投稿論文英文校正中）。この手法を用いて、上記の特徴的な免疫複合体抗原のエピトープ特定を開始した。

根据同时鉴定偏远岛屿队列血清样本（包括 2021 年分析的样本）中所含免疫复合物抗原的结果，我们试图鉴定 RA 早期阶段出现的抗原。最终，对来自偏远岛屿 56 人的 64 个样本进行了分析。所有样本的抗瓜氨酸肽抗体均呈阳性。将过去分析的早期 RA、系统性红斑狼疮、硬皮病和干燥综合征中检测到的免疫复合物抗原用作对照（Ann Rheum Dis 2012；Clin Biochem 2015；Clin Exp Immunol 2021；J Autoimmun 2023）。在偏远岛屿队列中，鉴定出 447 种免疫复合物抗原。其中，鉴定出两种类型的免疫复合物抗原，这些抗原在对照组中未检测到，仅在偏远岛屿队列中检测到。由于即使在早期 RA 中也未检测到这种免疫复合物抗原，因此它被认为是症状出现之前的极早期 RA（早期 RA）的特征，尽管患者的抗瓜氨酸肽抗体呈阳性。此外，我们正在与侧重于瓜氨酸蛋白的免疫复合物抗原分析进行类似的比较，并继续鉴定极早期 RA 特征性或特异性的瓜氨酸序列（肽）。另一方面，使用上述分析中得到的MS谱图和MS/MS谱图的信号强度进行无标记定量。该数据显示了每种免疫复合物抗原的量，并且正在使用人工智能分析进行基于疾病/免疫复合物抗原/量的表征。此外，通过应用交联质谱法，我们开发了一种识别抗原决定簇（表位）的方法，抗原决定簇是自身抗原化的异常（目前正在编辑提交的英文手稿）。使用这种技术，我们开始鉴定上述特征性免疫复合物抗原的表位。

项目成果

Evaluation of four commercial severe acute respiratory coronavirus 2 antibody tests

四种商业化严重急性呼吸道冠状病毒2抗体检测的评估

• DOI: 10.1016/j.jiac.2021.03.008
• 发表时间: 2021
• 影响因子: 2.2
• 作者: Ashizawa Nobuyuki;Takazono Takahiro;Ohyama Kaname;et al
• 通讯作者: et al

Determination Method for Pyrroloquinoline Quinone in Food Products by HPLC-UV Detection Using a Redox-Based Colorimetric Reaction

采用基于氧化还原的比色反应的 HPLC-UV 检测测定食品中的吡咯并喹啉醌的方法

• DOI: 10.1248/cpb.c21-00638
• 发表时间: 2022
• 影响因子: 1.7
• 作者: Fukuda Mizuho;Kishikawa Naoya;Samemoto Taketo;Ohta Kaoru;Ohyama Kaname;El;Ikemoto Kazuto;Kuroda Naotaka
• 通讯作者: Kuroda Naotaka

Ceruloplasmin Levels in Cancer Tissues and Urine Are Significant Biomarkers of Pathological Features and Outcome in Bladder Cancer

癌症组织和尿液中的铜蓝蛋白水平是膀胱癌病理特征和结果的重要生物标志物

• DOI: 10.21873/anticanres.15174
• 发表时间: 2021
• 影响因子: 2
• 作者: MUKAE YUTA;ITO HIDENORI;MIYATA YASUYOSHI;ARAKI KYOHEI;MATSUDA TSUYOSHI;AIBARA NOZOMI;NAKAMURA YUICHIRO;MATSUO TOMOHIRO;SAKAI HIDEKI;OHYAMA KANAME
• 通讯作者: OHYAMA KANAME

Detection of Novel Urine Markers Using Immune Complexome Analysis in Bladder Cancer Patients: A Preliminary Study

使用免疫复合物组分析检测膀胱癌患者的新型尿液标志物：初步研究

• DOI: 10.21873/invivo.12476
• 发表时间: 2021
• 影响因子: 2.3
• 作者: AIBARA NOZOMI;MIYATA YASUYOSHI;ARAKI KYOHEI;SAGARA YUJI;MITSUNARI KENSUKE;MATSUO TOMOHIRO;OHBA KOJIRO;MOCHIZUKI YASUSHI;SAKAI HIDEKI;OHYAMA KANAME
• 通讯作者: OHYAMA KANAME

Itpr1 regulates the formation of anterior eye segment tissues derived from neural crest cells

<i>Itpr1</i> 调节神经嵴细胞衍生的眼前节组织的形成

• DOI: 10.1242/dev.188755
• 发表时间: 2021
• 影响因子: 4.6
• 作者: Kinoshita Akira;Ohyama Kaname;Tanimura Susumu;Matsuda Katsuya;Kishino Tatsuya;Negishi Yutaka;Asahina Naoko;Shiraishi Hideaki;Hosoki Kana;Tomiwa Kiyotaka;Ishihara Naoko;Mishima Hiroyuki;Mori Ryoichi;Nakashima Masahiro;Saitoh Shinji;Yoshiura Koh
• 通讯作者: Yoshiura Koh