Elucidation of glioma immune microenvironment heterogeneity based on immunogenomics by liquid biopsy

基于液体活检免疫基因组学阐明胶质瘤免疫微环境异质性

基本信息

批准号：
21H03044
负责人：
溝口昌弘
金额：
$ 11.23万
依托单位：
Kyushu University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
财政年份：
2021
资助国家：
日本
起止时间：
2021-04-01 至 2024-03-31
项目状态：
已结题

项目摘要

グリオーマ遺伝子解析：2021年WHO分類に対応した分子診断を44症例に継続した。新たにFGFR1に対しシークエンス、HRM法、MLPA法による遺伝子異常の検出が可能となった。髄液cell-free(cf) DNAを用いたMLPA法によるコピー数解析：術前に採取した髄液を用いてコピー数変化をMLPA法で解析した。髄液cfDNA濃度(中央値0.213 ng/uL)はMLPA法の推奨濃度を著しく下回ったが、条件を探索し濃度0.15ng/uL以上かつ100 bp以上のDNA長で反応することを確認した。条件を満たす症例では全例MLPAの反応は成功し、EGFR増幅、Ch 7+/10-、PDGFRA、CDK4増幅、CDKN2A欠失は明確に同定され、感度はそれぞれ75%，88.9%，100%，100%，75%であり特異度は100%であった。ヒト血液由来誘導ミクログリア様(iMG)細胞による評価：免疫微小環境のバイオマーカーとして有用であるiMG細胞における貪食能について検討した。グリオーマ25例、てんかん4例、髄膜種1例、GIST1例、そのうち11例に対し脳内ミクログリア（PMG）の貪食能も同時に解析した。同一患者でのPMG、iMGとの間には正の相関関係がみられ、機能面においてもiMGがPMGを反映している所見であった。また星細胞腫や膠芽腫は乏突起膠腫と比較して有意に貪食能が高かった。CDKN2A/Bヘミ欠失の評価：IDH変異型グリオーマでCDKN2A/Bのホモ欠失は強力な予後不良因子であるが、ヘミ欠失の効果は不明である。コピー数解析によりホモ欠失、ヘミ欠失、正常の3群に分類しOS/PFSを評価するとastrocytoma ではヘミ欠失は正常と比較して有意なOSの短縮をみとめた。さらにp16とMTAPに対する免疫染色でヘミ欠失を診断可能であることを見出した。

胶质瘤基因分析：根据2021年的分子诊断，在44例中继续进行分类。现在可以使用测序，HRM和MLPA方法检测FGFR1的遗传异常。使用MLPA方法使用CSF无细胞（CF）DNA进行拷贝数分析：使用MLPA方法使用手术前采样的CSF分析拷贝数更改。 CSF CFDNA浓度（中位0.213 ng/ul）明显低于建议的MLPA方法的浓度，但搜索条件以确认反应是以0.15 ng/ul或更多或更多的DNA长度和100 bp或更高的DNA浓度进行。在所有符合这种情况的情况下，MLPA的响应都是成功的，EGFR扩增，CH 7+/10-，PDGFRA，CDK4扩增和CDKN2A缺失清楚地鉴定出来，敏感性分别为75％，88.9％，100％，100％，100％和75％，以及75％和75％的特定性，以及100％的特定性。研究了人类血液衍生的微胶质细胞样细胞（IMG）细胞的评估：IMG细胞中的吞噬作用，可作为免疫微环境的生物标志物。还分析了25例神经胶质瘤，4例癫痫病，1例脑膜种类和1例GIST，同时分析了脑小胶质细胞（PMG）的吞噬作用能力。同一患者的PMG和IMG之间存在正相关，发现IMG在功能方面反映了PMG。此外，星形胶质细胞瘤和胶质母细胞瘤比少突胶质瘤明显高得多。 CDKN2A/B半骨骼的评估：尽管IDH突变胶质瘤中CDKN2A/B的同型是一个强烈的预后因素，但半骨骼的作用尚不清楚。进行拷贝数分析以将组分为三组：HOMO缺失，HEMI缺失和正常情况，并评估OS/PFS，与正常情况相比，星形胶质细胞瘤的OS中HEMI缺失显着降低。此外，对P16和MTAP的免疫染色显示可以诊断出半裸。

项目成果

期刊论文数量（21）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

当院のMicrosatellite instabilityを有するGBMにおける遺伝的および免疫学的プロファイルの検討

我院微卫星不稳定性GBM的遗传和免疫学特征检查

DOI：
发表时间：
2021
期刊：
影响因子：
0
作者：
瀧川浩介;波多江龍亮;三木健嗣;尾辻亮介;舟越勇介;藤岡寛;三月田祐平;空閑太亮秦暢宏;溝口昌弘;吉本幸司
通讯作者：
吉本幸司

がんゲノム時代の新たなグリオーマ治療戦略

癌症基因组时代的胶质瘤治疗新策略

DOI：
发表时间：
2021
期刊：
影响因子：
0
作者：
Saito Shoji;Natsumeda Manabu;Sainouchi Makoto;Takino Toru;Shibuya Kohei;On Jotaro;Kanemaru Yu;Ogura Ryosuke;Okada Masayasu;Oishi Makoto;Shimada Yoshifumi;Wakai Toshifumi;Okuda Shujiro;Ajioka Yoichi;Kakita Akiyoshi;Fujii Yukihiko;溝口昌弘
通讯作者：
溝口昌弘

当院におけるRosette-forming glioneuronal tumorの経験

我院治疗玫瑰花状胶质神经肿瘤的经验