Elucidation of last common ancestor of land plants based on meristem related genes

基于分生组织相关基因阐明陆地植物最后共同祖先

基本信息

  • 批准号:
    21H02549
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 11.23万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
  • 财政年份:
    2021
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    2021-04-01 至 2024-03-31
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

ヒメミカヅキモYABBYの全長CDSを含むcDNAのクローニングを行い塩基配列を確認した。これにもとづき遺伝子破壊用コンストラクトを作成し、薬剤耐性株を数株取得した。遺伝子破壊領域をPCR増幅したところ、配列に難読部分が多く、遺伝子の改変状態を確定するに至らなかった。ヒメミカヅキモの遺伝子解析システムの高度化を目指してエストロゲン受容体の制御領域をヒメミカヅキモのコドン使用率に合わせて調製した配列を合成した。ナガサキツノゴケで遺伝子編集を行うため、形質転換法の効率を高めるとともに、ガイドRNAを発現させるためのU6プロモータについてナガサキツノゴケ内在のU6を同定してそれを使う準備を進めた。
克隆了含有YABBY全长CDS的cDNA并确认了核苷酸序列。在此基础上,我们创建了基因破坏构建体并获得了几种耐药菌株。当通过PCR扩增基因破坏区域时,序列包含许多难以读取的部分,使得无法确定基因的改变状态。为了完善线虫的遗传分析系统,我们合成了适合线虫密码子使用的雌激素受体调节区序列。为了在长崎金鱼草中进行基因编辑,我们提高了转化方法的效率,鉴定了长崎金鱼草中发现的U6启动子,并为使用它做好了准备。

项目成果

期刊论文数量(18)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
ツノゴケ─ゲノム解読と形質転換技術が拓く植物進化研究の新機軸
金鱼草:基因组解码与转化技术开创植物进化研究新突破
  • DOI:
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    西山智明;嶋村正樹;榊原恵子
  • 通讯作者:
    榊原恵子
ゲノム解析から見たツノゴケの二酸化炭素濃縮機構とシアノバクテリア,菌類との共生: 植物の陸上進出を可能にした生存戦略
从基因组分析看金鱼藻的二氧化碳浓度机制以及与蓝藻和真菌的共生:植物向陆地迁移的生存策略
  • DOI:
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    山本洵;小林里帆;冨田淳;粂和彦;西山智明,榊原恵子,嶋村正樹
  • 通讯作者:
    西山智明,榊原恵子,嶋村正樹
A divergent RWP-RK transcription factor determines mating type in heterothallic Closterium
不同的 RWP-RK 转录因子决定异宗新月菌的交配类型
  • DOI:
    10.1111/nph.18662
  • 发表时间:
    2023
  • 期刊:
  • 影响因子:
    9.4
  • 作者:
    Sekimoto;H.;Komiya;A.;Tsuyuki;N.;Kawai;J.;Kanda;N.;Ootsuki;R.;Suzuki;Y.;Toyoda;A.;Fujiyama;A.;Kasahara;M.;Abe;J.;Tsuchikane;Y.;Nishiyama;T.
  • 通讯作者:
    T.
ツノゴケAnthoceros agrestisのアグロバクテリウムを介した形質転換系の確立
金鱼草农杆菌介导转化体系的建立
  • DOI:
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Eftychios Frangedakis;Manuel Waller;西山智明;塚谷裕一;Peter Szovenyi;榊原恵子
  • 通讯作者:
    榊原恵子
ツノゴケゲノムと陸上植物の発生進化
金鱼藻基因组和陆地植物的发育进化
  • DOI:
    10.24480/bsj-review.12d2.00215
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    西山 智明;嶋村 正樹;榊原 恵子
  • 通讯作者:
    榊原 恵子
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西山 智明其他文献

ヒメミカヅキモにおける顕著なゲノムサイズ多型の進化的起源と遺伝子発現
Himemikazukimo 显着基因组大小多态性的进化起源和基因表达
  • DOI:
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    川口 也和子;土金 勇樹;田中 啓介;太治 輝昭;豊田 敦;西山 智明;関本 弘之;土松 隆志
  • 通讯作者:
    土松 隆志
植物からの高分子DNA調整法
从植物中制备聚合DNA的方法
  • DOI:
  • 发表时间:
    2017
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    西山 智明;大槻 涼;榊原 恵子;川井 絢子;嶋村 正樹;関本 弘之
  • 通讯作者:
    関本 弘之
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通过间隙连接转移 L 中的 GDP-L-岩藻糖来拯救无法合成 GDP-L-岩藻糖的细胞中的 Notch 信号传导:果蝇。
  • DOI:
  • 发表时间:
    2012
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    西山 智明;豊田 敦;鈴木 穣;藤山 秋佐夫;坂山 英俊;Kenjiroo Matsumoto
  • 通讯作者:
    Kenjiroo Matsumoto
オジギソウ運動器官に発現する遺伝子群のCRISPR/Cas9による機能解析
使用 CRISPR/Cas9 对运动器官中表达的基因进行功能分析
  • DOI:
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    真野 弘明;Chao-Li Huang;西山 智明;重信 秀治;豊田 正嗣;長谷部 光泰
  • 通讯作者:
    長谷部 光泰
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  • DOI:
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    西山 智明;嶋村 正樹;榊原 恵子;田金秀一郎・田中珠樹・田中睦美・鈴木英治
  • 通讯作者:
    田金秀一郎・田中珠樹・田中睦美・鈴木英治

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  • 作者:
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  • 资助金额:
    $ 11.23万
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    00J02188
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    2000
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    $ 11.23万
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    Grant-in-Aid for JSPS Fellows

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    Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
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  • 资助金额:
    $ 11.23万
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  • 批准号:
    23770277
  • 财政年份:
    2011
  • 资助金额:
    $ 11.23万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
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知道了