オルガネラ代謝物の化学標識による時空間メタボローム解析
使用细胞器代谢物的化学标记进行时空代谢组分析
基本信息
- 批准号:21H02058
- 负责人:
- 金额:$ 11.23万
- 依托单位:
- 依托单位国家:日本
- 项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
- 财政年份:2021
- 资助国家:日本
- 起止时间:2021-04-01 至 2025-03-31
- 项目状态:未结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
2021年度はミトコンドリア内代謝物を標的としたOrganelle-targeting Reactive Molecule (ORM)の開発を行った。ミトコンドリアはTCA回路、酸化的リン酸化、脂肪酸ベータ酸化など、様々な代謝を担うオルガネラであり、本手法の有用性を検証する上で適したオルガネラであると言える。ORMのミトコンドリア局在モチーフとして膜電位依存的にミトコンドリアに局在することが知られるローダミン誘導体を採用し、様々な官能基(アミン、カルボン酸、アルデヒド、ケトン、チオールなど)を有する代謝物の化学標識を実現するために、多様な反応基を連結したORM試薬を合成した。本年度は特に光反応基の検討を進め、フェニルアジド、ベンゾフェノン、ジアジリンといった光反応基を有するローダミン誘導体を合成した。合成したORMを培養細胞に処置し、ライブイメージングやLC-MS解析によって、オルガネラターゲッティング能、反応効率、反応選択性等を評価した。初期検討の結果、ORMはミトコンドリアに特異的に局在し、光照射によっていくつかの代謝物に対する標識が進行することが確認された。特に脂肪酸類が同定されたことから、ミトコンドリア内代謝物の選択的な標識が進行していることが示唆された。また、本年度はオルガネラ内のホスファチジルコリンを選択的に標識する技術を応用してホスファチジルコリンの代謝を制御する遺伝子の網羅的スクリーニングを行った。
在2021财年,我们开发了靶向线粒体代谢物的细胞器靶向反应性分子(ORM)。线粒体是负责多种新陈代谢的细胞器,包括TCA循环,氧化磷酸化和脂肪酸β氧化,可以说是适合验证该方法有用性的细胞器。使用膜的潜在依赖性方式将已知已知与线粒体定位为ORM的线粒体定位基序的罗丹明衍生物,并合成了与各种反应性基团相关的ORM试剂,以实现具有各种功能组的化学标记(胺,羧酸含量),卵形酸,卵黄酸盐等(氨基酸等),孔酸盐,孔酸盐,肯特蛋白酶,孔。今年,我们一直在研究光电反应性基团,并合成含有光电反应性基团(例如苯唑,苄苯酮和重氮酶)的若丹明衍生物。通过培养细胞处理合成的ORM,并通过实时成像和LC-MS分析评估细胞器靶向能力,反应效率,反应选择性等。初步研究证实,ORMS专门定位于线粒体,并且在几种代谢产物的标记中,光照射会进展。特别是,脂肪酸的鉴定表明线粒体代谢产物的选择性标记正在进行中。此外,今年,我们将一项技术应用于Organelle中的磷脂酰胆碱,以全面的筛选基因调节磷脂酰胆碱代谢。
项目成果
期刊论文数量(6)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Development of novel proteomics methods based on biocompatible organic chemistry
基于生物相容性有机化学的新型蛋白质组学方法的开发
- DOI:
- 发表时间:2022
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Kohei Morimoto;Daichi Kitagawa;Seiya Kobatake;吉田真明;田村朋則
- 通讯作者:田村朋則
タンパク質/脂質の in situ 化学修飾
蛋白质/脂质的原位化学修饰
- DOI:
- 发表时间:2021
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Yui TSUNEKAWA;Shin-ichi YUSA;田村朋則
- 通讯作者:田村朋則
オルガネラ選択的脂質ラベリングの新展開(3):ホスファチジルイノシトールへの拡張
细胞器选择性脂质标记的新进展(3):扩展到磷脂酰肌醇
- DOI:
- 发表时间:2022
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:木村 天海;田村 朋則;浜地 格
- 通讯作者:浜地 格
{{
item.title }}
{{ item.translation_title }}
- DOI:
{{ item.doi }} - 发表时间:
{{ item.publish_year }} - 期刊:
- 影响因子:{{ item.factor }}
- 作者:
{{ item.authors }} - 通讯作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ patent.updateTime }}
田村 朋則其他文献
組織イメージングを指向したヘム選択的生体分子修飾化剤の開発
用于组织成像的血红素选择性生物分子修饰剂的开发
- DOI:
- 发表时间:
2022 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
垣内 亮;平山 祐;辻 翔平;嶋澤 雅光;田村 朋則;浜地 格;辻 美恵子;永澤 秀子 - 通讯作者:
永澤 秀子
非遺伝子改変動物における細胞種特異的なウイルス感染法の開発
非转基因动物细胞类型特异性病毒感染方法的开发
- DOI:
- 发表时间:
2021 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
釜口 力;大月 祥子;山口 真広;田村 朋則;森本 菜央;浜地 格;小坂田文隆 - 通讯作者:
小坂田文隆
細胞内在性タンパク質の非失活型アフィニティーラベル化
细胞内源蛋白的非灭活亲和标记
- DOI:
- 发表时间:
2008 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
高岡 洋輔;宮川 雅好;田村 朋則;築地 真也;浜地 格 - 通讯作者:
浜地 格
田村 朋則的其他文献
{{
item.title }}
{{ item.translation_title }}
- DOI:
{{ item.doi }} - 发表时间:
{{ item.publish_year }} - 期刊:
- 影响因子:{{ item.factor }}
- 作者:
{{ item.authors }} - 通讯作者:
{{ item.author }}
{{ truncateString('田村 朋則', 18)}}的其他基金
オルガネラ代謝物の化学標識による時空間メタボローム解析
使用细胞器代谢物的化学标记进行时空代谢组分析
- 批准号:
23K21151 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 11.23万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
黄色ブドウ球菌由来鉄獲得蛋白質Isdの蛍光バイオセンサー化と阻害剤探索法の構築
金黄色葡萄球菌铁获取蛋白Isd荧光生物传感器的开发及抑制剂搜索方法的构建
- 批准号:
13J07399 - 财政年份:2013
- 资助金额:
$ 11.23万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
LDT化学による新しい細胞内蛋白質間相互作用解析技術の開発
利用LDT化学开发新的细胞内蛋白质-蛋白质相互作用分析技术
- 批准号:
10J04905 - 财政年份:2010
- 资助金额:
$ 11.23万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
相似海外基金
分子ハイパーグラフ文法と深層学習を活用した代謝物の代謝経路グループ構築
使用分子超图语法和深度学习构建代谢物的代谢途径组
- 批准号:
23K05739 - 财政年份:2023
- 资助金额:
$ 11.23万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
Usefulness of metabolite biomarker as a common pathway for the prevention of non-communicable diseases and frailty
代谢生物标志物作为预防非传染性疾病和虚弱的常见途径的有用性
- 批准号:
23H00452 - 财政年份:2023
- 资助金额:
$ 11.23万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
ファイトケミカルの肝線維化改善作用の理解に資する非コードRNAと代謝物の統合解析
非编码RNA和代谢物的综合分析有助于了解植物化学物质的肝纤维化改善作用
- 批准号:
22K05525 - 财政年份:2022
- 资助金额:
$ 11.23万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
メタボロミクス解析とSingle Cell解析による膵癌間質内代謝物質分布の解明
通过代谢组学分析和单细胞分析阐明胰腺癌基质中的代谢物分布
- 批准号:
22K07171 - 财政年份:2022
- 资助金额:
$ 11.23万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
Function analysis of plant idioblast cells with single cell omics
单细胞组学对植物成纤维细胞的功能分析
- 批准号:
22K15136 - 财政年份:2022
- 资助金额:
$ 11.23万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Early-Career Scientists