Metatranscriptome analysis clarify virulence factors of osteomyelitis of the jaw

宏转录组分析阐明颌骨骨髓炎的毒力因子

• 批准号: 20K23021
• 负责人: 加地 博一
• 金额: $ 1.83万
• 依托单位: Tokyo Medical and Dental University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Research Activity Start-up
• 财政年份: 2020
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2020-09-11 至 2024-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-20K23021/
• 关键词: 顎骨骨髄炎; 複合感染症; メタ16S解析; 共起ネットワーク; メタゲノム解析; メタトランスクリプトーム解析; メタトランスクリプトーム; 顎骨骨髄炎細菌叢

顎骨骨髄炎では種々の口腔細菌種が協同して病変形成に関わっている考えられている．しかし、従来の研究は培養可能な一部の細菌種のみを調べる手法に依存しているため，疾患に関与する細菌群を網羅的に解析することや、それらの細菌の活動性を評価することが困難であった。本研究では、まずメタ16S解析を行うことで顎骨骨髄炎の病変に存在する細菌群を網羅的に同定し、さらには16S rDNAと16S rRNAの比を計算することで、細菌群を構成する各細菌腫の活動性を評価した。その結果、従来の研究で顎骨骨髄炎のCore microbiomeと同定された細菌腫であっても、全ての細菌腫の活動性が高いわけではないことが明らかとなった。さらに、共起ネットワーク解析では、活動性の高い細菌種だけでなく活動性の低い細菌種、マイナーな細菌腫がともにネットワークを構築することで、頑強性を保有するネットワークが形成されている可能性が示唆された。

在颌骨骨髓炎中，多种口腔细菌被认为与病变形成有关。然而，传统的研究依赖于仅检查一些可培养的细菌种类的方法，因此很难全面分析与疾病相关的细菌群或评估这些细菌的活性。在本研究中，我们首先进行meta-16S分析来全面鉴定颌骨骨髓炎病变中存在的细菌群，然后计算16S rDNA和16S rRNA的比率来识别构成细菌瘤的每个细菌群。活性进行了评估。结果表明，并非所有细菌瘤都高度活跃，即使它们在之前的研究中被确定为颌骨骨髓炎核心微生物组的一部分。此外，共现网络分析表明，不仅活性高的细菌种类，活性较低的细菌种类和较小的菌瘤也可能形成网络，从而形成强大的网络。