バーチャルスライドを用いた牛呼吸器病症候群病理診断データベースの構築

利用虚拟切片构建牛呼吸道疾病综合征病理诊断数据库

基本信息

批准号：
21K05965
负责人：
木村久美子
金额：
$ 2.58万
依托单位：
National Agriculture and Food Research Organization
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份：
2021
资助国家：
日本
起止时间：
2021-04-01 至 2024-03-31
项目状态：
已结题

项目摘要

牛呼吸器病症候群（BRDC）は、様々な要因が複雑に関与することによって引き起こされる牛の呼吸器障害の総称である。BRDCでは病態と病原体分離結果が一致しないことも多く、病理学的所見も複雑となり、診断が困難な症例も少なくない。本研究では、BRDCの病理組織学的診断精度向上のために、バーチャルスライド(Whole Slide Image: WSI）によるデジタル画像を用いて、BRDCの病理組織像を比較できるデータベースを構築し、組織所見から類似症例を容易に抽出する方法を開発する。本データベースの構築は、診断の効率化及び標準化に有用である。今年度は、R3年度にWSI化した症例のメタデータを整理し、一部の症例については特殊染色標本、免疫染色標本のWSIデータを追加した。これらの症例について、農研機構統合データベースにデジタル画像とメタデータの登録を行った。それぞれのファイルにはサムネイル画像を付け、ファイルを開かずに画像を確認できるようにした。また、新たにBRDC 7症例を収集し、病理組織学的に解析を行った。一部の症例についてはTeamsやZoomを利用してWSI画像を遠隔地と供覧し、病理組織像の解説あるいはディスカッションを行った。既存および新規症例をあわせて19症例92枚(累計46症例159枚)のBRDC症例をWSI化し、アノテーションを行っている。作成したデータベースの検索には、データベース管理ソフトの活用を検討していたが、他プロジェクトにて構築するWSIメタデータ検索システムを活用することとした。そのために、メタデータ項目を同検索システムと統一させた。今後、メタデータ内の専門用語を同検索システムの語彙に一致するよう修正する予定である。

牛呼吸道疾病综合征（BRDC）是由多种因素复杂相互作用引起的牛呼吸系统疾病的总称。 BRDC的病理情况与病原分离结果往往不符，且病理表现复杂，很多病例诊断困难。在本研究中，为了提高BRDC组织病理学诊断的准确性，我们使用虚拟载玻片（Whole Slide Image：WSI）数字图像构建了可以比较BRDC组织病理学图像的数据库，并基于类似的组织学发现开发了一个数据库。方法轻松提取案例。该数据库的建设对于提高诊断效率和标准化具有重要意义。本财年，我们整理了R3年转为WSI的病例元数据，并添加了部分病例特殊染色标本和免疫染色标本的WSI数据。这些案例的数字图像和元数据已在国家农业和食品研究组织综合数据库中注册。每个文件都有一个缩略图，因此您无需打开文件即可查看图像。此外，还收集了7例新的BRDC病例并进行组织病理学分析。对于某些情况，使用 Teams 或 Zoom 远程共享 WSI 图像，并对组织病理学图像进行解释或讨论。 BRDC 病例（包括现有病例和新病例）的 19 个病例（总共 46 个病例的 159 个图像）的总共 92 幅图像被转换为 WSI 并进行注释。我们曾考虑使用数据库管理软件来搜索创建的数据库，但决定使用另一个项目中内置的 WSI 元数据搜索系统。为此，我们使用相同的搜索系统统一了元数据项。未来，我们计划修改元数据中的技术术语以匹配搜索系统的词汇。