Association analysis of the SNPs of ER and lung adenocarcinoma risk in Japanese non-smokers.

日本非吸烟者 ER 的 SNP 与肺腺癌风险的关联分析。

• 批准号: 20K07655
• 负责人: 陶 弘
• 金额: $ 2.75万
• 依托单位: Hamamatsu University School of Medicine
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2020
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2020-04-01 至 2023-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-20K07655/
• 关键词: lung adenocarcinoma; estrogen recepter; SNP; 肺腺癌; エストロゲン受容体; 一塩基多型（SNP)

日本を含むアジア各国では、非喫煙者肺腺癌の割合が増加傾向にあり、特に女性の発症が多いことから、女性ホルモン関連遺伝子との関係を明らかにするために、本研究はエストロゲン受容体（ER)遺伝子における一塩基多型（SNP)について調べた。今年度はまずエストロゲン受容体の二つ亜型（αとβ）のSNPをデータベースから検索し、肺腺癌発症リスクとの関連を報告した論文からターゲットSNPを絞る。ERαは肺腺癌組織での発現は少ないとされてきている中、複数のSNPが肺腺癌との関連を中国大陸と台湾のグループで報告されている。この中4つのSNPsに絞って、データベース上でそれぞれ連鎖不平衡による影響の有無を確認したうえ、解析のターゲットとして決めた。同じ東アジア国の日本の非喫煙者肺腺癌症例におけるこれらのターゲットSNPsの頻度を調べるために、まず日本人非喫煙者肺腺癌270症例と癌なしの健常人コントロールサンプル330例を選出し、凍結手術検体と血液検体からゲノムDNAを抽出した。その一部のDNAサンプルを使って、PCR-sequencing法により、4つのターゲットSNPsのスクリーニングを行い、それぞれの野生型、変異型とヘテロ接合型の検体を確認し、ポジティブコントロールとして使った。残りの症例と対照サンプルをTaqMan SNP Genotyping Assayを用いて遺伝子型を同定し、そのデータを統計解析により、肺腺癌リスクとの関連を調べた。とりあえず1つのSNPに関して、野生型に比べて、ヘテロ接合型と変異型ともに有意差が認められなかった。さらに優性モデルと劣性モデルでの解析でも有意差が認められなかった。

在包括日本在内的亚洲国家中，非吸烟肺腺癌的比例正在上升，这种疾病在女性中尤为普遍。为了阐明与女性激素相关基因的关系，这项研究研究了雌激素受体（ER）基因中的单核苷酸多态性（SNP）。今年，我们将首先从数据库中搜索雌激素受体（α和β）的两个亚型的SNP，并从论文中缩小目标SNP，从而报告其与发展为肺腺癌的风险。虽然据说ERα在肺腺癌组织中的表达较少，但据报道，多个SNP与中国大陆和台湾的组组中的肺腺癌有关。其中，四个SNP被缩小，并使用数据库检查是否由于连锁不平衡而产生影响，然后决定成为分析的目标。为了调查日本非吸烟肺腺癌病例中这些靶SNP的频率，我们首先选择了270例日本非吸烟的肺腺癌和330例没有癌症的健康人的对照样本，并从腐败的标本和血液标本中提取基因组DNA。通过PCR序列将一些DNA样品筛选为四个目标SNP，并确认每个野生型，突变体和杂合标本，并用作阳性对照。使用TAQMAN SNP基因分型测定法对其余病例和对照样品进行了基因分型，并且对数据进行了统计分析，以确定它们与肺腺癌风险的关联。目前，与野生型相比，一个SNP中的杂合形式和突变体形式之间尚未观察到显着差异。此外，在主要模型和隐性模型之间的分析中没有观察到显着差异。