ワンヘルスに基づいた生活環境由来細菌の疫学解析と全ゲノム解析

基于One Health的生活环境来源细菌流行病学分析及全基因组分析

基本信息

批准号：
21K10417
负责人：
漆原範子
金额：
$ 2.41万
依托单位：
Sapporo Medical University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份：
2021
资助国家：
日本
起止时间：
2021-04-01 至 2024-03-31
项目状态：
已结题

项目摘要

薬剤耐性対策には医療のみならず，動物，食品，環境等を含めた分野横断的に取組むこと，すなわちワンヘルスアプローチが重要である。ブドウ球菌属細菌は現在49種類が知られており，中でも黄色ブドウ球菌（S. aureus）は病原性が高く，院内感染，及び食中毒の原因菌として注視されている。血液凝集素コアグラーゼを分泌するか否かにより二分され，黄色ブドウ球菌はコアグラーゼ産生し，コアグラーゼ遺伝子を持たない種はコアグラーゼ陰性ブドウ球菌（CoNS）と総称される。ブドウ球菌属細菌は種，または同じ種内でも遺伝子型（sequence type: ST）により一定の宿主特異性があり，主にヒトから分離される CoNS としてS. epidermidis, S. lugdunensis, S. haemolyticus, S. saprophyticus, S. warneri が挙げられ，家畜から分離される CoNSは S. xylosus, S. chromogenes, S. equorum, S. similans が多い。S. aureus は比較的広い動物種から検出されるが，動物ごとに分離率の高い遺伝子型がみられ，それらの適応性獲得に寄与する遺伝子変異が推定されているものもある。本研究は，その特徴に着目し，生活環境におけるブドウ球菌属細菌の分布と薬剤耐性を調査し，ゲノム配列に基づいた比較解析・系統解析を通して耐性遺伝子の進化，及び伝播の様態を明らかにすることを目的とする。現在まで食肉から分離される菌体解析を中心に行っている。同定された菌種から家畜由来の菌体と，サプライチェーン等から混入する菌体が混在していると考えられ，薬剤感受性のパターンから食肉中の菌体とヒト感染起因菌との直接的な関連を示唆するものではないと推察した。

就耐药性措施而言，重要的是要采取措施进行医疗服务，而且要采取跨越包括动物，食物，环境等领域的措施，即一种健康方法。目前有49种已知类型的葡萄球菌细菌，其中金黄色葡萄球菌具有高度致病性，并被密切监测为导致医院感染和食物中毒的致病细菌。根据它是否分泌血凝蛋白凝血酶，金黄色葡萄球菌会产生凝血酶，而不携带凝结酶基因的物种统称为凝聚酶阴性葡萄球菌（CONS），它是根据血凝蛋白凝血酶分泌的。 S. epidermidis，S。lugdunesis，S。hemolyticus，S。saprophyticus，S。warneri是来自动物的最常见的弊端。在相对较宽的动物物种中检测到金黄色葡萄球菌，但是每只动物的种族隔离率很高，有些动物被推迟具有有助于其适合性的基因突变。这项研究的重点是其特征，旨在研究葡萄球菌细菌在生活环境中的分布和耐药性，并通过基于基因组序列的比较和系统发育分析来阐明抗药性基因的演化和传播。到目前为止，我们一直致力于分析与肉类分离的细菌。据信，所鉴定的细菌与源自牲畜的细菌以及从供应链中混合的细菌混合在一起，并且药物易感性模式并不暗示肉类细菌与人类感染引起的细菌之间存在直接关系。